Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Chlorella variabilis plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_015359CCGA38068181325 %0 %25 %50 %7 %Non-Coding
2NC_015359CTGA3194119511125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
3NC_015359CAAA3297729871175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
4NC_015359TTTA3319132011125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_015359AAAT3455845681175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_015359T1260816092120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
7NC_015359TAT4672467351233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33126809
8NC_015359CTTTT370997113150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
9NC_015359GAAA312603126141275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
10NC_015359AAAC313886138971275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
11NC_015359GAAA314947149571175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
12NC_015359GAAA315763157741275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
13NC_015359AAAC316005160151175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
14NC_015359TTTG31694716958120 %75 %25 %0 %8 %33126810
15NC_015359AAAC317116171271275 %0 %0 %25 %8 %33126810
16NC_015359ATT418379183891133.33 %66.67 %0 %0 %9 %33126810
17NC_015359TTAAAA318552185691866.67 %33.33 %0 %0 %5 %33126810
18NC_015359AAAT321057210681275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_015359N502313523184500 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
20NC_015359TGT42493124942120 %66.67 %33.33 %0 %8 %33126810
21NC_015359GGT42512725138120 %33.33 %66.67 %0 %8 %33126810
22NC_015359TTTC32755427565120 %75 %0 %25 %8 %33126811
23NC_015359ACA427710277221366.67 %0 %0 %33.33 %7 %33126811
24NC_015359T152849928513150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
25NC_015359CAGGAA729065291064250 %0 %33.33 %16.67 %9 %Non-Coding
26NC_015359CAG529298293121533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %Non-Coding
27NC_015359CTTT32992129932120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
28NC_015359GTT43043830448110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
29NC_015359CAC430698307081133.33 %0 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
30NC_015359AAT430810308211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_015359TTTC33097730988120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
32NC_015359TCCA331427314381225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
33NC_015359T123285132862120 %100 %0 %0 %0 %33126811
34NC_015359ATAA335725357351175 %25 %0 %0 %9 %33126811
35NC_015359TGA436219362291133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %33126811
36NC_015359AGA436367363771166.67 %0 %33.33 %0 %9 %33126811
37NC_015359A16368473686216100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
38NC_015359AAAT338637386471175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
39NC_015359TTAA340047400571150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
40NC_015359N10043265433641000 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
41NC_015359TAA443539435501266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
42NC_015359ACA443728437391266.67 %0 %0 %33.33 %8 %33126811
43NC_015359ATT444410444201133.33 %66.67 %0 %0 %9 %33126811
44NC_015359AAAT344730447401175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
45NC_015359GT64574445755120 %50 %50 %0 %8 %33126811
46NC_015359AAGA346456464661175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
47NC_015359GTTT34936449376130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
48NC_015359TGCTTT35122651243180 %66.67 %16.67 %16.67 %5 %33126812
49NC_015359AGA451251512621266.67 %0 %33.33 %0 %0 %33126812
50NC_015359GAA451952519641366.67 %0 %33.33 %0 %7 %33126812
51NC_015359CATG354260542711225 %25 %25 %25 %8 %33126812
52NC_015359ATAAA355989560021480 %20 %0 %0 %7 %33126812
53NC_015359N505673256781500 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
54NC_015359TGTT36004060051120 %75 %25 %0 %8 %33126812
55NC_015359AT661013610241250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
56NC_015359ATCC361135611451125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
57NC_015359TTATT361396614111620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
58NC_015359TCTTT36150861521140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
59NC_015359CGAAA361809618231560 %0 %20 %20 %6 %Non-Coding
60NC_015359TTAT362313623251325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_015359AATA363722637321175 %25 %0 %0 %9 %33126812
62NC_015359TTTTC36410564118140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
63NC_015359AAAC364170641801175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
64NC_015359GAAAA464247642651980 %0 %20 %0 %5 %Non-Coding
65NC_015359ATTTT365319653331520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
66NC_015359TAAA365346653561175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_015359AGAA365364653751275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
68NC_015359AAAG365872658831275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
69NC_015359AAAG368543685531175 %0 %25 %0 %9 %33126813
70NC_015359CAA470218702281166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
71NC_015359AAAC372637726481275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
72NC_015359AAAT373556735661175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
73NC_015359CAA474050740601166.67 %0 %0 %33.33 %9 %33126813
74NC_015359GAAA376393764031175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
75NC_015359ATTT380206802161125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
76NC_015359GAA480466804761166.67 %0 %33.33 %0 %9 %33126814
77NC_015359ATT480977809871133.33 %66.67 %0 %0 %9 %33126814
78NC_015359TA681302813121150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
79NC_015359AC681754817651250 %0 %0 %50 %8 %33126814
80NC_015359GGGC38232682337120 %0 %75 %25 %8 %33126814
81NC_015359AGT482708827191233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %33126814
82NC_015359TTAA383299833101250 %50 %0 %0 %8 %33126814
83NC_015359AAATA384137841511580 %20 %0 %0 %6 %33126814
84NC_015359ATTT384656846661125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
85NC_015359AAAGAA387068870851883.33 %0 %16.67 %0 %5 %33126815
86NC_015359ATT487087870981233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33126815
87NC_015359T128730187312120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
88NC_015359A15873288734215100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
89NC_015359ACA490260902701166.67 %0 %0 %33.33 %9 %33126815
90NC_015359TTTG39230992319110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
91NC_015359CTG49352593535110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %33126815
92NC_015359A15942559426915100 %0 %0 %0 %6 %33126815
93NC_015359CCTTTT39451994536180 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
94NC_015359TTA495349953601233.33 %66.67 %0 %0 %8 %33126816
95NC_015359ATTT395786957981325 %75 %0 %0 %7 %33126816
96NC_015359TGG49786597876120 %33.33 %66.67 %0 %8 %33126816
97NC_015359TCT49851598525110 %66.67 %0 %33.33 %9 %33126816
98NC_015359TGC49855898569120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %33126816
99NC_015359TGT49892298933120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
100NC_015359GTTT39893898949120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
101NC_015359TC69923399244120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
102NC_015359T129941799428120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
103NC_015359A12994729948312100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
104NC_015359AAAC399526995361175 %0 %0 %25 %9 %Non-Coding
105NC_015359GGAT31010931011031125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
106NC_015359TCAAA31030101030241560 %20 %0 %20 %0 %Non-Coding
107NC_015359CAAA31078271078371175 %0 %0 %25 %9 %33126817
108NC_015359TTTTGT3109709109727190 %83.33 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
109NC_015359T12109933109944120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
110NC_015359GAAA41111441111591675 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
111NC_015359A1411201611202914100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
112NC_015359ATCT31124951125061225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
113NC_015359GTTT3113494113504110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
114NC_015359ATTT31139401139511225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
115NC_015359A1311417211418413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
116NC_015359T12116509116520120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
117NC_015359TTTC3116577116588120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
118NC_015359TGC4117338117348110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %33126817
119NC_015359AATT31175811175921250 %50 %0 %0 %8 %33126817
120NC_015359TTTCC3117962117976150 %60 %0 %40 %6 %Non-Coding
121NC_015359AAAG31181021181121175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
122NC_015359T13118273118285130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
123NC_015359N64119441119504640 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
124NC_015359TAG51199321199461533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
125NC_015359TGA41201581201691233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
126NC_015359AATA31202541202641175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
127NC_015359ATTTT31203211203341420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
128NC_015359TTC4120694120705120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
129NC_015359AAAAT31222111222241480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
130NC_015359T12122362122373120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding