ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015141	GGCG	3	8592	8603	12	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015141	GCA	4	9527	9538	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015141	TAA	4	12171	12182	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015141	GAT	4	12412	12423	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015141	CTAA	3	14603	14614	12	50 %	25 %	0 %	25 %	32364987
6	NC_015141	TTCT	3	21488	21499	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364987
7	NC_015141	TACT	3	25557	25568	12	25 %	50 %	0 %	25 %	32364987
8	NC_015141	CTT	4	27584	27595	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32364987
9	NC_015141	GATT	3	30838	30849	12	25 %	50 %	25 %	0 %	32364987
10	NC_015141	TAA	4	35645	35656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32364987
11	NC_015141	GATA	3	39940	39951	12	50 %	25 %	25 %	0 %	32364987
12	NC_015141	AT	6	60913	60924	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
13	NC_015141	ATGA	3	65131	65142	12	50 %	25 %	25 %	0 %	32364987
14	NC_015141	A	14	71783	71796	14	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
15	NC_015141	GAAT	3	73020	73031	12	50 %	25 %	25 %	0 %	32364987
16	NC_015141	CTTA	3	79150	79161	12	25 %	50 %	0 %	25 %	32364987
17	NC_015141	TGAC	4	84909	84924	16	25 %	25 %	25 %	25 %	32364987
18	NC_015141	GAAG	3	86095	86106	12	50 %	0 %	50 %	0 %	32364987
19	NC_015141	CTTT	3	98059	98070	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364987
20	NC_015141	TGT	4	99033	99044	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32364987
21	NC_015141	T	13	105101	105113	13	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
22	NC_015141	ACCT	3	107348	107359	12	25 %	25 %	0 %	50 %	32364987
23	NC_015141	T	12	115003	115014	12	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
24	NC_015141	TTAA	3	121243	121254	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
25	NC_015141	A	13	131947	131959	13	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
26	NC_015141	AG	6	138696	138707	12	50 %	0 %	50 %	0 %	32364987
27	NC_015141	TCTT	3	142437	142448	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364987
28	NC_015141	AT	6	155147	155158	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
29	NC_015141	CTAGT	3	158908	158922	15	20 %	40 %	20 %	20 %	32364988
30	NC_015141	TCTT	3	161568	161579	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364988
31	NC_015141	AGCA	3	166096	166107	12	50 %	0 %	25 %	25 %	32364988
32	NC_015141	TCAA	3	171106	171117	12	50 %	25 %	0 %	25 %	32364988
33	NC_015141	TAGA	3	171446	171457	12	50 %	25 %	25 %	0 %	32364988
34	NC_015141	CTTG	3	172343	172354	12	0 %	50 %	25 %	25 %	32364988
35	NC_015141	ATGA	3	179324	179335	12	50 %	25 %	25 %	0 %	32364988
36	NC_015141	CTT	4	181426	181437	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32364988
37	NC_015141	AAGA	3	185079	185090	12	75 %	0 %	25 %	0 %	32364988
38	NC_015141	TTA	4	188782	188793	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32364988
39	NC_015141	T	12	211708	211719	12	0 %	100 %	0 %	0 %	32364988
40	NC_015141	T	12	211938	211949	12	0 %	100 %	0 %	0 %	32364988
41	NC_015141	TAGC	3	214582	214593	12	25 %	25 %	25 %	25 %	32364988
42	NC_015141	A	12	219862	219873	12	100 %	0 %	0 %	0 %	32364988
43	NC_015141	TAGAAC	3	223056	223073	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32364988
44	NC_015141	A	14	227627	227640	14	100 %	0 %	0 %	0 %	32364988
45	NC_015141	AG	6	235237	235248	12	50 %	0 %	50 %	0 %	32364988
46	NC_015141	AGAA	3	235467	235478	12	75 %	0 %	25 %	0 %	32364988
47	NC_015141	A	12	237071	237082	12	100 %	0 %	0 %	0 %	32364988
48	NC_015141	TC	6	243765	243776	12	0 %	50 %	0 %	50 %	32364988
49	NC_015141	T	12	244882	244893	12	0 %	100 %	0 %	0 %	32364988
50	NC_015141	TAA	4	246592	246603	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32364988
51	NC_015141	CTAG	3	252754	252765	12	25 %	25 %	25 %	25 %	32364988
52	NC_015141	CTTT	3	256958	256969	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364988
53	NC_015141	AT	6	259760	259771	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364988
54	NC_015141	AAGG	3	259829	259840	12	50 %	0 %	50 %	0 %	32364988
55	NC_015141	A	13	263094	263106	13	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
56	NC_015141	AT	6	265034	265045	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
57	NC_015141	TTTC	3	265161	265172	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364987
58	NC_015141	GACA	3	287843	287854	12	50 %	0 %	25 %	25 %	32364987
59	NC_015141	TA	6	295920	295931	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
60	NC_015141	A	13	299833	299845	13	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
61	NC_015141	TTAG	3	300870	300881	12	25 %	50 %	25 %	0 %	32364987
62	NC_015141	T	14	302562	302575	14	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
63	NC_015141	T	12	306939	306950	12	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
64	NC_015141	A	14	308010	308023	14	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
65	NC_015141	TGAA	3	308572	308583	12	50 %	25 %	25 %	0 %	32364987
66	NC_015141	A	12	318742	318753	12	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
67	NC_015141	AAGA	3	319731	319742	12	75 %	0 %	25 %	0 %	32364987
68	NC_015141	T	12	325238	325249	12	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
69	NC_015141	TTTC	3	326512	326523	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364987
70	NC_015141	T	14	337130	337143	14	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
71	NC_015141	AGAA	3	338328	338339	12	75 %	0 %	25 %	0 %	32364987
72	NC_015141	GATAG	3	342879	342893	15	40 %	20 %	40 %	0 %	32364987
73	NC_015141	A	12	348757	348768	12	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
74	NC_015141	CTTG	3	349979	349990	12	0 %	50 %	25 %	25 %	32364987
75	NC_015141	AT	6	355269	355280	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
76	NC_015141	A	14	362044	362057	14	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
77	NC_015141	T	15	364431	364445	15	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
78	NC_015141	TGA	4	374634	374645	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32364987
79	NC_015141	ATG	4	383523	383534	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32364987
80	NC_015141	AGTC	3	385008	385019	12	25 %	25 %	25 %	25 %	32364987
81	NC_015141	A	14	389156	389169	14	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
82	NC_015141	GAAA	3	393980	393991	12	75 %	0 %	25 %	0 %	32364987
83	NC_015141	TTCA	3	395058	395069	12	25 %	50 %	0 %	25 %	32364987
84	NC_015141	CTT	4	398158	398169	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32364987
85	NC_015141	TGGT	3	414031	414042	12	0 %	50 %	50 %	0 %	32364987
86	NC_015141	A	12	416905	416916	12	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
87	NC_015141	TAA	4	423418	423429	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32364987
88	NC_015141	TTAT	3	430586	430597	12	25 %	75 %	0 %	0 %	32364987
89	NC_015141	A	16	430972	430987	16	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
90	NC_015141	TCTT	3	432990	433001	12	0 %	75 %	0 %	25 %	32364987
91	NC_015141	CTT	4	434732	434743	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32364987
92	NC_015141	A	12	435020	435031	12	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
93	NC_015141	CTT	4	437988	437999	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32364987
94	NC_015141	TACT	3	440468	440479	12	25 %	50 %	0 %	25 %	32364987
95	NC_015141	ATG	4	442556	442567	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32364987
96	NC_015141	AGTC	3	444041	444052	12	25 %	25 %	25 %	25 %	32364987
97	NC_015141	TTC	4	446157	446168	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32364987
98	NC_015141	TTAA	3	448581	448592	12	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
99	NC_015141	T	12	449656	449667	12	0 %	100 %	0 %	0 %	32364987
100	NC_015141	TCC	4	453109	453120	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32364987
101	NC_015141	GGTT	3	454169	454180	12	0 %	50 %	50 %	0 %	32364987
102	NC_015141	GTAA	3	460662	460673	12	50 %	25 %	25 %	0 %	32364987
103	NC_015141	TA	7	466506	466519	14	50 %	50 %	0 %	0 %	32364987
104	NC_015141	AGCT	3	476606	476617	12	25 %	25 %	25 %	25 %	32364987
105	NC_015141	A	16	478510	478525	16	100 %	0 %	0 %	0 %	32364987
106	NC_015141	GCCG	3	486709	486720	12	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_015141	T	14	493495	493508	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Ricinus communis mitochondrion