ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Boreus elegans mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015119	TCT	4	189	200	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_015119	ATT	4	223	234	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32283070
3	NC_015119	ATT	4	823	834	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32283070
4	NC_015119	TTA	4	938	949	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32283070
5	NC_015119	TTA	4	1214	1224	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32283070
6	NC_015119	TA	6	1223	1233	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32283070
7	NC_015119	TATAA	3	1707	1720	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	32283070
8	NC_015119	GAAA	3	2207	2218	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32283070
9	NC_015119	TAA	4	2874	2884	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32283070
10	NC_015119	TTA	4	3126	3138	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32283070
11	NC_015119	ACA	4	3203	3213	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	32283070
12	NC_015119	ATT	4	3281	3291	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32283070
13	NC_015119	TA	8	3944	3958	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32283070
14	NC_015119	TTAA	3	4076	4087	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32283070
15	NC_015119	ATT	4	4101	4113	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32283070
16	NC_015119	TTAT	3	4143	4154	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32283070
17	NC_015119	TAACTT	4	4316	4339	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	32283070
18	NC_015119	AAT	4	4701	4712	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32283071
19	NC_015119	TAA	4	4768	4779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32283071
20	NC_015119	T	15	4969	4983	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	32283071
21	NC_015119	ATT	4	5368	5379	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32283071
22	NC_015119	TAT	5	5838	5851	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32283071
23	NC_015119	A	23	6883	6905	23	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	32283071
24	NC_015119	ATT	5	7181	7195	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32283071
25	NC_015119	TAA	4	7291	7302	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	32283071
26	NC_015119	TAA	4	7725	7737	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32283071
27	NC_015119	TAA	4	7765	7775	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32283071
28	NC_015119	AT	6	7798	7808	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32283071
29	NC_015119	TTA	4	7944	7954	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32283071
30	NC_015119	TAA	5	7953	7966	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32283071
31	NC_015119	ATT	5	7967	7981	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32283071
32	NC_015119	TAAA	4	7998	8013	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	32283071
33	NC_015119	AAAT	3	8025	8036	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32283071
34	NC_015119	TAA	4	8164	8178	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32283071
35	NC_015119	AATT	3	8680	8692	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32283071
36	NC_015119	ATT	5	8723	8737	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	32283071
37	NC_015119	AT	7	8928	8941	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32283071
38	NC_015119	TAT	4	8946	8958	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32283071
39	NC_015119	AAAT	4	9010	9024	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	32283071
40	NC_015119	AAAAT	3	9099	9112	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	32283071
41	NC_015119	TAA	5	9151	9165	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32283071
42	NC_015119	ATA	4	9187	9198	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32283071
43	NC_015119	TAA	4	9223	9234	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32283071
44	NC_015119	TATAAA	3	9331	9348	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	32283071
45	NC_015119	AAT	4	9416	9426	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32283071
46	NC_015119	TAAA	4	9585	9600	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	32283071
47	NC_015119	AATA	3	9716	9727	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32283071
48	NC_015119	AGAA	3	9804	9815	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_015119	ATA	4	10245	10255	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32283071
50	NC_015119	T	14	10656	10669	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	32283071
51	NC_015119	ATTT	3	10979	10989	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	32283071
52	NC_015119	TAT	5	11382	11395	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32283071
53	NC_015119	AATA	3	11644	11654	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32283071
54	NC_015119	A	15	11777	11791	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	32283071
55	NC_015119	TAA	4	12006	12017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	32283071
56	NC_015119	AT	6	12246	12256	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32283071
57	NC_015119	CTA	4	12486	12497	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32283071
58	NC_015119	TAA	4	12507	12519	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32283071
59	NC_015119	AT	8	12540	12554	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	32283071
60	NC_015119	ATAA	5	12933	12953	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_015119	TAAA	3	13097	13107	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_015119	ATTTT	3	13108	13122	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_015119	TTCA	4	13143	13158	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
64	NC_015119	TA	12	13438	13461	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_015119	TAA	4	13520	13530	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_015119	AATT	3	13596	13606	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_015119	AT	9	13825	13841	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_015119	ATA	4	14150	14160	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_015119	ATT	4	14579	14590	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_015119	T	12	14893	14904	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_015119	TA	7	14902	14914	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_015119	TTAATT	3	14998	15016	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_015119	ATTAAA	3	15094	15112	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_015119	ATTAA	3	15196	15210	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_015119	T	12	15254	15265	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_015119	TA	7	15263	15275	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_015119	TTAATT	3	15359	15377	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
78	NC_015119	ATTAAA	3	15457	15475	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_015119	T	22	15615	15636	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_015119	A	12	15671	15682	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015119	TTAA	3	15759	15770	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_015119	AAAT	3	15891	15902	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_015119	TA	6	15925	15935	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_015119	AT	6	15944	15955	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_015119	TA	6	15969	15979	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_015119	TAA	4	16007	16019	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_015119	ATA	4	16126	16138	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_015119	ATAA	4	16151	16166	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_015119	TA	6	16164	16174	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_015119	AT	6	16183	16194	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_015119	TA	6	16208	16218	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_015119	TAA	4	16246	16258	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_015119	ATA	4	16365	16377	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_015119	ATAA	4	16390	16405	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_015119	TA	6	16403	16413	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_015119	AT	6	16422	16433	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_015119	TA	6	16447	16457	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_015119	TAA	4	16485	16497	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_015119	ATA	4	16604	16616	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_015119	ATAA	4	16629	16644	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_015119	TA	6	16642	16652	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_015119	AT	8	16661	16676	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_015119	ATA	5	16740	16754	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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