ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pristomyrmex punctatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_015075	ATT	4	377	389	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_015075	TAA	4	568	579	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242236
3	NC_015075	ATAA	3	582	592	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32242236
4	NC_015075	ATTTT	3	600	614	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	32242236
5	NC_015075	ATC	4	624	634	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	32242236
6	NC_015075	TAA	4	637	648	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242236
7	NC_015075	ATT	5	705	719	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	32242236
8	NC_015075	TAT	4	860	872	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242236
9	NC_015075	ATA	4	906	917	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242236
10	NC_015075	CAAA	3	1064	1075	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	32242236
11	NC_015075	TTAA	3	1398	1410	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32242236
12	NC_015075	TAT	4	1411	1422	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242236
13	NC_015075	AGG	4	2377	2388	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	32242236
14	NC_015075	GAAA	3	2496	2507	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32242236
15	NC_015075	ATTT	3	2741	2752	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32242236
16	NC_015075	TAA	4	3102	3113	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242236
17	NC_015075	AATT	3	3695	3706	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32242236
18	NC_015075	AATT	3	4027	4038	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_015075	TA	7	4098	4110	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_015075	TAT	4	4972	4983	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242236
21	NC_015075	ATT	4	5006	5016	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242236
22	NC_015075	ATT	4	5352	5364	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32242237
23	NC_015075	CATT	3	5399	5410	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	32242237
24	NC_015075	TTTAA	3	5882	5897	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	32242237
25	NC_015075	ATT	4	6005	6016	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242237
26	NC_015075	TTAA	3	6549	6559	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_015075	AATT	3	6647	6658	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_015075	CTAA	3	6954	6964	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	32242237
29	NC_015075	AAT	4	7334	7345	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242237
30	NC_015075	AAAT	3	7444	7454	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32242237
31	NC_015075	GAAA	3	7588	7599	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	32242237
32	NC_015075	TTAA	3	7977	7987	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242237
33	NC_015075	TAA	4	8278	8290	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32242237
34	NC_015075	TAA	4	8303	8313	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32242237
35	NC_015075	AAAAT	3	8409	8422	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	32242237
36	NC_015075	AAAT	3	8436	8446	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32242237
37	NC_015075	AT	6	9273	9283	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242237
38	NC_015075	AAAT	3	9532	9542	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	32242237
39	NC_015075	CAAAA	3	9565	9578	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	32242237
40	NC_015075	TA	9	10345	10361	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	32242237
41	NC_015075	TAA	4	10371	10385	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32242237
42	NC_015075	TATT	4	10387	10402	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	32242237
43	NC_015075	ACTTAT	3	10484	10501	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	32242237
44	NC_015075	AAT	4	10721	10732	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242237
45	NC_015075	ATATTT	3	11546	11564	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	32242237
46	NC_015075	CT	6	11802	11812	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	32242237
47	NC_015075	ATT	4	11839	11849	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32242237
48	NC_015075	AT	6	11885	11896	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	32242237
49	NC_015075	TAA	4	11981	11993	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32242237
50	NC_015075	TAT	4	12302	12313	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242237
51	NC_015075	TAA	4	12311	12322	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242237
52	NC_015075	AT	6	12559	12569	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32242237
53	NC_015075	AAT	4	12629	12640	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32242237
54	NC_015075	TAA	4	12763	12775	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	32242237
55	NC_015075	ATT	4	13101	13112	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32242237
56	NC_015075	TTAA	3	13433	13444	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_015075	AT	6	13532	13542	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_015075	TAAA	3	13609	13619	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_015075	TTAAA	3	13925	13938	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_015075	TAT	5	14019	14033	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_015075	TTAA	3	14057	14068	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_015075	TAA	4	14218	14229	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_015075	TAT	4	15033	15044	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_015075	TAT	5	15118	15133	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_015075	TAATTA	3	15751	15768	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_015075	ATTT	3	15818	15829	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_015075	ATT	4	15918	15930	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_015075	ATTT	3	16102	16112	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pristomyrmex punctatus mitochondrion