ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ammothea carolinensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014671	AATT	3	140	151	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223310
2	NC_014671	TCC	4	195	206	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31223310
3	NC_014671	TTAA	3	354	364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223310
4	NC_014671	TAAATT	3	385	402	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	31223310
5	NC_014671	ATA	4	423	434	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223310
6	NC_014671	AATT	3	1554	1565	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223311
7	NC_014671	CTTC	3	1629	1639	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	31223311
8	NC_014671	TAT	5	1894	1908	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31223311
9	NC_014671	ATTTAT	3	2555	2572	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	31223311
10	NC_014671	ATT	4	2721	2732	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	31223311
11	NC_014671	TTAA	3	2830	2841	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223311
12	NC_014671	CATT	3	2963	2973	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	31223311
13	NC_014671	AAT	4	3566	3576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_014671	ATT	4	4127	4138	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223311
15	NC_014671	ATT	4	4374	4385	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223311
16	NC_014671	TTCTTT	3	4755	4773	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	31223311
17	NC_014671	ATT	4	4947	4958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223311
18	NC_014671	TAT	4	5346	5357	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223311
19	NC_014671	TTAATT	3	5365	5382	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	31223311
20	NC_014671	TTA	4	5844	5855	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_014671	TAATA	3	5948	5961	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_014671	ATA	8	6076	6099	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223311
23	NC_014671	TAA	4	6124	6134	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223311
24	NC_014671	TAA	4	6173	6184	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223311
25	NC_014671	A	14	6408	6421	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31223311
26	NC_014671	ACTA	3	6644	6654	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	31223311
27	NC_014671	AATT	3	6793	6803	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223311
28	NC_014671	AGA	4	7577	7587	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	31223311
29	NC_014671	TAAA	4	7700	7715	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	31223311
30	NC_014671	A	13	7752	7764	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31223311
31	NC_014671	AAT	4	7935	7947	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223311
32	NC_014671	AAAAAG	3	8039	8057	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	31223311
33	NC_014671	TTA	4	8207	8218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223311
34	NC_014671	AAAT	3	8608	8618	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31223311
35	NC_014671	ATA	5	8700	8714	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	31223311
36	NC_014671	TAA	4	8745	8756	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223311
37	NC_014671	TATAA	3	8844	8857	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	31223311
38	NC_014671	TA	7	9104	9117	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31223311
39	NC_014671	TAT	4	9225	9236	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31223311
40	NC_014671	TAAACC	3	9300	9317	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	31223311
41	NC_014671	TAAA	3	9396	9406	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31223311
42	NC_014671	TAA	4	9408	9418	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223311
43	NC_014671	AAAT	3	9466	9477	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223311
44	NC_014671	ATA	4	9487	9499	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31223311
45	NC_014671	TA	7	9494	9508	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31223311
46	NC_014671	TAA	5	9544	9558	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014671	TAC	4	9676	9687	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31223311
48	NC_014671	ATA	4	9771	9781	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223311
49	NC_014671	AT	6	9804	9814	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223311
50	NC_014671	ATTTT	3	9912	9927	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	31223311
51	NC_014671	TAT	4	9928	9940	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31223311
52	NC_014671	TAA	4	9953	9964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223311
53	NC_014671	AATAT	3	10228	10243	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	31223312
54	NC_014671	AT	6	10429	10439	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31223312
55	NC_014671	TAT	4	10728	10740	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	31223312
56	NC_014671	TTAT	3	10874	10885	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31223312
57	NC_014671	ATT	4	11146	11156	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31223312
58	NC_014671	TAAT	3	11273	11284	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31223312
59	NC_014671	TAAA	3	11531	11542	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	31223312
60	NC_014671	AATAAA	3	11613	11630	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	31223312
61	NC_014671	TAA	4	11819	11830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31223312
62	NC_014671	TAA	4	12159	12169	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	31223312
63	NC_014671	CTA	4	12242	12253	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	31223312
64	NC_014671	ATA	4	12759	12770	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_014671	TTAA	3	13225	13236	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_014671	TTAAA	3	13304	13317	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_014671	ATT	4	14017	14028	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_014671	TAAAA	3	14267	14280	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_014671	TA	10	14606	14626	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_014671	TA	8	14652	14668	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_014671	ATA	4	14666	14676	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_014671	TA	11	14730	14751	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_014671	TA	8	14777	14793	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_014671	ATA	4	14791	14801	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_014671	TA	11	14855	14876	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_014671	TA	8	14902	14918	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_014671	ATA	4	14916	14926	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_014671	TA	12	14980	15003	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ammothea carolinensis mitochondrion