ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mekongiana xiangchengensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014450	AAT	4	611	622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30432283
2	NC_014450	CTA	4	1061	1071	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	30432283
3	NC_014450	AAT	5	1163	1177	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30432283
4	NC_014450	ATTAAA	3	3740	3758	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_014450	ATA	4	4259	4270	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30432284
6	NC_014450	TAA	4	4581	4592	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30432284
7	NC_014450	ATT	4	4592	4603	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	30432284
8	NC_014450	TAATTA	3	5557	5574	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30432284
9	NC_014450	TAA	4	5608	5619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30432284
10	NC_014450	TAA	5	6082	6096	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_014450	TAAA	3	6362	6373	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30432284
12	NC_014450	AGA	4	6507	6517	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30432284
13	NC_014450	TAA	4	6659	6671	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30432284
14	NC_014450	ATA	4	7342	7352	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30432284
15	NC_014450	AAG	4	7430	7440	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30432284
16	NC_014450	ATA	4	7647	7657	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30432284
17	NC_014450	TAA	4	7998	8008	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30432284
18	NC_014450	ATAA	3	8883	8894	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30432284
19	NC_014450	AAAT	3	9010	9022	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	30432284
20	NC_014450	AAAC	3	9172	9182	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	30432284
21	NC_014450	AAT	4	9271	9282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30432284
22	NC_014450	AAAG	3	9392	9403	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	30432284
23	NC_014450	AAAGAA	3	9443	9460	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	30432284
24	NC_014450	AAT	5	9558	9572	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30432284
25	NC_014450	ATAA	3	9691	9702	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30432284
26	NC_014450	AT	6	10015	10025	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30432284
27	NC_014450	TTTA	3	10059	10070	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30432284
28	NC_014450	ATTT	3	10312	10323	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	30432284
29	NC_014450	TAG	4	10331	10342	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	30432284
30	NC_014450	ATT	4	10747	10757	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30432285
31	NC_014450	ATT	4	11460	11471	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30432285
32	NC_014450	TTAA	3	11526	11538	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30432285
33	NC_014450	CAAA	3	11972	11983	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	30432285
34	NC_014450	AACA	3	12006	12017	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	30432285
35	NC_014450	TAAAA	3	12213	12226	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	30432285
36	NC_014450	ATA	4	12678	12688	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_014450	AAAATA	3	13422	13439	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
38	NC_014450	TAA	4	13798	13809	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_014450	ACTA	3	13822	13833	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
40	NC_014450	TGAA	3	14383	14395	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_014450	AAAG	3	14766	14776	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_014450	TTTA	3	14995	15007	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_014450	ATA	4	15382	15392	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_014450	TA	6	15436	15446	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Mekongiana xiangchengensis mitochondrion