ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Panonychus citri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014347	AATT	3	229	240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135331
2	NC_014347	TTAA	3	244	254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135331
3	NC_014347	AATA	3	501	511	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135331
4	NC_014347	GAG	4	659	670	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	0 %	30135331
5	NC_014347	TA	6	1201	1212	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135331
6	NC_014347	T	15	1471	1485	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30135331
7	NC_014347	TTTAA	4	1513	1532	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	30135331
8	NC_014347	AT	6	1741	1751	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135331
9	NC_014347	ATA	5	1827	1841	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30135331
10	NC_014347	AATT	3	2012	2023	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_014347	TAAA	3	2070	2081	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_014347	AAT	4	2134	2145	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_014347	ATA	5	2159	2173	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_014347	ATAA	4	2257	2272	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_014347	TA	6	2326	2336	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_014347	TTAAA	3	2395	2409	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_014347	ATTT	3	2476	2487	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014347	ATTA	3	2493	2504	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014347	A	12	2509	2520	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_014347	ATAAA	3	2828	2842	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_014347	T	16	2845	2860	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_014347	TAA	4	3397	3407	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135332
23	NC_014347	TAAA	3	3423	3434	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30135332
24	NC_014347	TTAA	3	3527	3537	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_014347	AAT	4	3538	3548	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135332
26	NC_014347	TAT	4	3634	3644	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135332
27	NC_014347	TAA	4	3647	3657	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135332
28	NC_014347	AAAT	3	3830	3840	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135332
29	NC_014347	ATA	4	3894	3905	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135332
30	NC_014347	T	14	4096	4109	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135332
31	NC_014347	AAAAG	3	4171	4185	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	30135332
32	NC_014347	A	14	4251	4264	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	30135332
33	NC_014347	TA	6	4273	4283	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30135332
34	NC_014347	TAAA	3	4295	4306	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30135332
35	NC_014347	AT	7	4408	4421	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135332
36	NC_014347	T	15	4623	4637	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30135332
37	NC_014347	TAAAAT	3	4664	4681	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30135332
38	NC_014347	TTAA	4	4732	4747	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30135332
39	NC_014347	AAAG	3	4857	4868	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30135332
40	NC_014347	TAAA	3	4871	4881	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135332
41	NC_014347	A	15	4899	4913	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30135332
42	NC_014347	ATTAAA	3	5017	5034	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30135332
43	NC_014347	TCATT	3	5595	5608	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	30135332
44	NC_014347	ATA	4	5673	5684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135332
45	NC_014347	TAT	5	5723	5736	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135332
46	NC_014347	ATTAA	3	5871	5885	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_014347	TAT	4	6030	6042	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_014347	AAT	4	6063	6073	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_014347	TTTA	5	6208	6227	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_014347	AAAT	3	6324	6334	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_014347	TAT	5	6582	6596	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30135332
52	NC_014347	TA	7	6954	6966	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135332
53	NC_014347	A	12	7105	7116	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	30135332
54	NC_014347	ATA	4	7158	7168	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135332
55	NC_014347	ATT	4	7231	7242	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	30135332
56	NC_014347	AAAT	5	7601	7621	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30135332
57	NC_014347	TTAA	3	7624	7635	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135332
58	NC_014347	TAT	4	7853	7863	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135332
59	NC_014347	TAT	4	8287	8297	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135332
60	NC_014347	T	25	8297	8321	25	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	30135332
61	NC_014347	T	12	8662	8673	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	30135332
62	NC_014347	T	13	8765	8777	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135332
63	NC_014347	ATA	4	8779	8789	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135332
64	NC_014347	T	12	8836	8847	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135332
65	NC_014347	TAA	4	8955	8965	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135332
66	NC_014347	TA	6	8994	9005	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135332
67	NC_014347	TTAT	3	9103	9114	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	30135332
68	NC_014347	TTA	4	9124	9136	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135332
69	NC_014347	ATTTAT	4	9166	9189	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135332
70	NC_014347	T	18	9204	9221	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	30135332
71	NC_014347	TA	10	9256	9274	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	30135332
72	NC_014347	AGAA	3	9305	9316	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	30135332
73	NC_014347	ATTT	4	9500	9515	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	30135332
74	NC_014347	TAA	4	9540	9551	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30135332
75	NC_014347	T	12	9751	9762	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	30135332
76	NC_014347	T	29	10033	10061	29	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30135332
77	NC_014347	TA	7	10110	10123	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135332
78	NC_014347	T	15	10400	10414	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135332
79	NC_014347	TAT	5	10463	10477	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	30135332
80	NC_014347	TAT	4	10514	10526	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	30135332
81	NC_014347	TAG	4	10564	10574	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	30135332
82	NC_014347	T	12	10632	10643	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135332
83	NC_014347	ATT	4	10821	10832	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30135332
84	NC_014347	TAT	4	10845	10855	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30135332
85	NC_014347	T	14	10884	10897	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	30135332
86	NC_014347	T	15	11054	11068	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135332
87	NC_014347	ATA	4	11274	11284	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30135332
88	NC_014347	TTTAAT	3	11298	11315	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	30135332
89	NC_014347	TA	7	11423	11435	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135332
90	NC_014347	TTTTCT	3	11455	11472	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	30135332
91	NC_014347	T	12	11558	11569	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	30135332
92	NC_014347	ATTT	3	11604	11615	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30135332
93	NC_014347	ATTT	3	11635	11646	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	30135332
94	NC_014347	TATT	3	11678	11689	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	30135332
95	NC_014347	AAAT	4	11962	11977	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_014347	AT	11	11995	12017	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30135333
97	NC_014347	T	14	12085	12098	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	30135333
98	NC_014347	TATT	4	12209	12224	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	30135333
99	NC_014347	T	12	12711	12722	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	30135333
100	NC_014347	TTTATT	3	12729	12747	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	30135333
101	NC_014347	TA	7	12748	12761	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30135333
102	NC_014347	T	16	12766	12781	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	30135333
103	NC_014347	ATTT	3	12830	12840	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30135333
104	NC_014347	T	18	12849	12866	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	30135333

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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