ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Durinskia baltica chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_014287	ACC	4	628	639	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983050
2	NC_014287	TTA	4	812	823	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983050
3	NC_014287	TGA	4	883	894	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983050
4	NC_014287	TACAA	3	1468	1481	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	29983050
5	NC_014287	TAA	4	1891	1902	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	29983050
6	NC_014287	ACC	4	2925	2936	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983050
7	NC_014287	ATG	4	3777	3787	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	29983050
8	NC_014287	TGT	4	5433	5443	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29983050
9	NC_014287	TA	6	5703	5713	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_014287	A	12	5725	5736	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_014287	TAAA	3	5745	5755	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_014287	ATAA	3	8359	8370	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983051
13	NC_014287	AT	7	8899	8911	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_014287	AGA	4	9570	9581	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983051
15	NC_014287	ATAA	4	10202	10217	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	29983051
16	NC_014287	TTTA	4	10450	10465	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	29983063
17	NC_014287	TTAC	3	10579	10589	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	29983051
18	NC_014287	CAAT	3	11462	11474	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	29983051
19	NC_014287	TAA	4	12630	12640	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_014287	TAAT	3	12997	13007	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983052
21	NC_014287	GCA	4	13067	13078	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29983052
22	NC_014287	AAG	4	13112	13123	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983052
23	NC_014287	TGT	4	13816	13827	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983052
24	NC_014287	CAC	4	13842	13853	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	29983052
25	NC_014287	TAA	4	13893	13905	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983052
26	NC_014287	AAT	4	15312	15323	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983052
27	NC_014287	AT	6	15884	15894	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_014287	TAT	4	15908	15918	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983052
29	NC_014287	TTA	4	15987	15998	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983052
30	NC_014287	ATA	4	16066	16076	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_014287	GGTTT	3	16990	17004	15	0 %	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_014287	CTA	4	17646	17657	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
33	NC_014287	TAA	4	17868	17879	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_014287	TAT	4	17885	17896	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_014287	TTAA	3	18441	18452	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_014287	TAAA	3	18637	18647	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983053
37	NC_014287	TAT	4	20416	20426	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_014287	AATT	3	20443	20454	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014287	AGA	4	21772	21783	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983053
40	NC_014287	AAAGT	3	22202	22215	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	29983053
41	NC_014287	GTTT	3	22274	22284	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_014287	TTTAT	4	23087	23106	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_014287	AAT	5	24599	24612	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_014287	TAT	4	24632	24643	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_014287	AGC	4	24898	24909	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	29983053
46	NC_014287	TATT	4	28209	28224	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_014287	TAT	4	28611	28622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983054
48	NC_014287	TTA	4	28758	28769	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983054
49	NC_014287	GTTT	3	28855	28866	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	29983054
50	NC_014287	TAG	4	28940	28951	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983054
51	NC_014287	TGG	4	29374	29384	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	29983054
52	NC_014287	GTTC	3	30375	30385	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	29983054
53	NC_014287	ATAA	3	30996	31006	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_014287	TTTA	3	31654	31664	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	29983054
55	NC_014287	TAAAAT	3	32792	32809	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	29983054
56	NC_014287	TTGAA	4	33866	33884	19	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	29983055
57	NC_014287	TTG	4	33887	33897	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	29983055
58	NC_014287	ATA	4	34026	34038	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	29983055
59	NC_014287	ATTT	3	34917	34928	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29983055
60	NC_014287	TCT	4	35055	35066	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983055
61	NC_014287	TTTAA	3	35721	35734	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	29983055
62	NC_014287	AT	6	36038	36048	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_014287	TTTA	3	36390	36400	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_014287	TAT	4	37112	37122	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983055
65	NC_014287	AAG	4	37925	37936	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983055
66	NC_014287	ATAA	3	38276	38287	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983055
67	NC_014287	GTTA	3	39148	39160	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	29983055
68	NC_014287	AATGTT	3	42352	42370	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	29983055
69	NC_014287	AGTT	3	45001	45011	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	29983055
70	NC_014287	GTTAAA	3	45420	45437	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	29983055
71	NC_014287	TTAT	3	46699	46710	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	29983055
72	NC_014287	TAT	4	47607	47619	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29983055
73	NC_014287	TAT	4	50187	50198	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_014287	CAA	4	51589	51600	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983056
75	NC_014287	ATT	4	53615	53626	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983056
76	NC_014287	ATTA	3	55167	55178	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983056
77	NC_014287	AGAA	3	56065	56075	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	29983056
78	NC_014287	TACAT	3	56204	56218	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	29983056
79	NC_014287	GGT	4	56433	56444	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	29983056
80	NC_014287	AAATTA	3	56649	56666	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	29983056
81	NC_014287	TTA	4	57039	57050	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_014287	CAT	4	57593	57604	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29983057
83	NC_014287	CAA	4	57998	58009	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983057
84	NC_014287	TAT	4	58862	58873	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983057
85	NC_014287	ATA	4	59009	59019	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_014287	TTAAA	3	60013	60027	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_014287	AATT	3	60584	60595	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983057
88	NC_014287	AAT	4	61201	61212	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	29983057
89	NC_014287	GTTTT	3	61934	61947	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	29983057
90	NC_014287	ATTT	3	62843	62855	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_014287	TAT	4	62855	62866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_014287	ATAA	3	67769	67780	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014287	AGGT	3	67802	67813	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_014287	GTAA	3	68952	68963	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_014287	ATAA	3	71055	71066	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983057
96	NC_014287	ATA	4	71935	71945	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_014287	TACTTT	3	72479	72497	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
98	NC_014287	ATT	4	76470	76482	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	29983058
99	NC_014287	GAT	4	76747	76758	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	29983058
100	NC_014287	AAT	4	77599	77611	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_014287	TAATA	4	77626	77646	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_014287	ATT	4	78020	78031	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983058
103	NC_014287	AT	6	79149	79160	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983058
104	NC_014287	ATA	4	80523	80534	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_014287	AAG	4	81263	81274	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983058
106	NC_014287	CTT	4	82193	82204	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29983059
107	NC_014287	CTTT	3	82842	82852	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	29983059
108	NC_014287	TGTA	3	83526	83536	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	29983059
109	NC_014287	AAT	4	83604	83614	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	29983059
110	NC_014287	AACT	3	85461	85472	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	29983059
111	NC_014287	AATT	3	87074	87085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983059
112	NC_014287	CAA	4	88101	88112	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	29983059
113	NC_014287	AATATT	4	88282	88304	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983059
114	NC_014287	TTTCTT	3	88723	88740	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	29983059
115	NC_014287	TTGT	3	90047	90058	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	29983059
116	NC_014287	TTA	4	90211	90222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_014287	GGT	4	91283	91294	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	29983059
118	NC_014287	ATCG	3	91830	91840	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	29983060
119	NC_014287	AATT	3	92028	92038	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	29983060
120	NC_014287	AGA	4	94256	94267	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	29983060
121	NC_014287	TAT	4	95776	95786	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	29983060
122	NC_014287	CAAA	3	96156	96167	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	29983061
123	NC_014287	ATTC	3	96356	96366	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	29983061
124	NC_014287	ATT	4	96755	96766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	29983061
125	NC_014287	TAAAAA	3	98209	98227	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	29983061
126	NC_014287	TAAAAA	3	98641	98659	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	29983061
127	NC_014287	TTG	4	98773	98784	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983061
128	NC_014287	AAAT	3	100630	100641	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	29983061
129	NC_014287	ATTAA	3	100840	100854	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	29983061
130	NC_014287	TAAA	3	102329	102339	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983062
131	NC_014287	TTAT	3	102370	102380	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_014287	AAT	4	102385	102396	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_014287	ATC	4	102780	102791	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	29983062
134	NC_014287	AGTT	4	104074	104089	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	29983062
135	NC_014287	AAAC	4	104167	104181	15	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	29983062
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137	NC_014287	TTAA	3	105789	105800	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	29983062
138	NC_014287	TA	7	106386	106398	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_014287	GTT	4	108208	108219	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	29983062
140	NC_014287	AATT	3	108942	108954	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	29983062
141	NC_014287	TAAA	3	115746	115756	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	29983063
142	NC_014287	AAAAT	3	116138	116151	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Durinskia baltica chloroplast