ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hypoderma lineatum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013932	TTA	4	229	239	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	290967646
2	NC_013932	TAA	4	490	501	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	290967646
3	NC_013932	ATTT	4	818	833	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	290967646
4	NC_013932	ATT	4	863	874	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	290967646
5	NC_013932	TTAT	3	900	910	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	290967646
6	NC_013932	ATT	5	1971	1985	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	290967647
7	NC_013932	AGG	4	2064	2075	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	290967647
8	NC_013932	TAT	4	2637	2647	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	290967647
9	NC_013932	ATTCA	3	2851	2865	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	290967647
10	NC_013932	ATT	4	3906	3917	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	290967649
11	NC_013932	ATA	6	3951	3967	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	290967649
12	NC_013932	TTA	4	4576	4587	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	290967650
13	NC_013932	ATT	4	5568	5579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	290967652
14	NC_013932	CTTT	3	6101	6111	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_013932	ATT	4	6354	6364	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	290967653
16	NC_013932	AATT	3	6474	6485	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	290967653
17	NC_013932	TTA	4	7160	7171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	290967653
18	NC_013932	TAA	4	7269	7280	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	290967653
19	NC_013932	TGAA	3	7353	7363	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	290967653
20	NC_013932	TAAA	3	7503	7513	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	290967653
21	NC_013932	ATCC	3	7664	7676	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	290967653
22	NC_013932	TAA	4	7703	7715	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	290967653
23	NC_013932	TAA	4	7743	7753	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	290967653
24	NC_013932	AAT	4	7941	7952	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	290967653
25	NC_013932	TAAA	3	7953	7964	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	290967653
26	NC_013932	AAAT	3	7977	7988	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	290967653
27	NC_013932	ATA	4	8090	8101	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	290967654
28	NC_013932	TAAAAA	3	8148	8165	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	290967654
29	NC_013932	AT	6	8232	8243	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	290967654
30	NC_013932	AAAAT	3	8874	8887	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	290967654
31	NC_013932	ATAA	3	8889	8900	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	290967654
32	NC_013932	AAAAT	3	9083	9096	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	290967654
33	NC_013932	AAAATA	3	9148	9166	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	290967654
34	NC_013932	TAA	4	9339	9351	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	290967654
35	NC_013932	TAAA	3	9566	9577	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	290967655
36	NC_013932	TTTA	3	10038	10049	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	290967656
37	NC_013932	TAT	4	10122	10133	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	290967656
38	NC_013932	CTA	4	10138	10150	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	290967656
39	NC_013932	TAC	4	10161	10171	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	290967656
40	NC_013932	TAT	5	10478	10491	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	290967657
41	NC_013932	TAT	4	10724	10734	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	290967657
42	NC_013932	ATTA	3	11471	11481	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	290967657
43	NC_013932	AT	7	11612	11625	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_013932	AT	15	11634	11661	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_013932	TAA	4	12575	12586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	290967658
46	NC_013932	AATA	4	12590	12604	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	290967658
47	NC_013932	TTAA	3	12756	12767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_013932	TAT	4	13045	13056	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_013932	TTTTA	3	13123	13138	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_013932	TAAA	3	13149	13159	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_013932	TTA	4	13413	13424	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_013932	AATT	3	13550	13561	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_013932	TAAT	3	13629	13640	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_013932	TAATA	3	13891	13905	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_013932	TAAA	6	13979	14001	23	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_013932	AAAT	3	14574	14585	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_013932	AAC	4	14622	14633	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
58	NC_013932	TAA	4	14944	14954	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_013932	TA	6	15224	15237	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_013932	TTAAAA	3	15399	15417	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_013932	T	22	15542	15563	22	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013932	A	12	15609	15620	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013932	A	12	15725	15736	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013932	A	12	15818	15829	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013932	TTAA	3	15845	15856	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_013932	T	13	15997	16009	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013932	A	14	16065	16078	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013932	A	28	16238	16265	28	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hypoderma lineatum mitochondrion