ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida sojae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013839	TA	6	1	12	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_013839	ATAG	7	30	61	32	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_013839	TA	6	126	137	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_013839	ATT	4	242	254	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_013839	AT	7	344	356	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_013839	TA	7	541	556	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_013839	AT	6	672	682	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_013839	ATAA	3	703	714	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013839	AT	7	799	812	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_013839	ATA	4	886	898	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_013839	ATGTA	3	961	975	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_013839	AAT	5	1354	1369	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	28890350
13	NC_013839	TACA	3	4167	4177	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	28890350
14	NC_013839	ATT	4	5128	5139	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890350
15	NC_013839	ATA	7	5469	5489	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890350
16	NC_013839	AGA	9	6188	6214	27	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_013839	ATT	5	6312	6326	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_013839	TAA	4	6432	6443	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_013839	AT	10	6483	6501	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_013839	ATTT	4	6720	6735	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_013839	TAATA	5	6902	6925	24	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_013839	ATATG	9	6954	6998	45	40 %	40 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
23	NC_013839	TAA	6	7093	7111	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
24	NC_013839	TAA	4	7836	7846	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
25	NC_013839	ATA	4	7849	7861	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28890351
26	NC_013839	TA	6	8323	8334	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28890351
27	NC_013839	TAA	4	8566	8576	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
28	NC_013839	TA	6	8640	8650	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890351
29	NC_013839	TAA	4	8725	8735	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
30	NC_013839	TAAA	3	8946	8956	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28890351
31	NC_013839	ATC	4	9071	9081	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	28890351
32	NC_013839	TCATA	3	9114	9128	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
33	NC_013839	ATA	4	9164	9175	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_013839	TA	6	9464	9474	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_013839	ATATC	7	9628	9661	34	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
36	NC_013839	ATA	4	9794	9805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_013839	ATT	6	10537	10554	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013839	TAG	4	11004	11015	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013839	TA	6	11198	11208	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_013839	AATAT	3	11665	11679	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	28890351
41	NC_013839	AAT	4	11727	11737	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
42	NC_013839	TAT	7	12834	12855	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_013839	TA	6	12881	12892	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_013839	TTATC	11	13173	13227	55	20 %	60 %	0 %	20 %	1 %	28890351
45	NC_013839	ATA	4	13670	13680	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28890351
46	NC_013839	TAA	5	13698	13711	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28890351
47	NC_013839	AT	6	13759	13770	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28890351
48	NC_013839	AT	6	13811	13821	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890351
49	NC_013839	TACAT	16	14059	14136	78	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
50	NC_013839	ATT	4	14586	14597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_013839	ATT	4	14644	14656	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_013839	TAATA	6	14743	14776	34	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_013839	TTTC	3	14830	14842	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
54	NC_013839	AGA	5	14843	14857	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_013839	TA	6	14883	14893	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_013839	AT	7	14895	14907	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_013839	ATA	4	15062	15074	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_013839	TAAGT	5	15073	15096	24	40 %	40 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
59	NC_013839	TA	7	15138	15151	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_013839	ATGT	3	15536	15546	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_013839	AT	8	15651	15666	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_013839	AAG	4	15923	15933	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28890351
63	NC_013839	TAC	4	15942	15953	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	28890351
64	NC_013839	TA	6	16305	16315	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890351
65	NC_013839	AGC	4	16444	16455	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	28890351
66	NC_013839	TAA	6	16656	16673	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	28890351
67	NC_013839	TAA	4	16788	16799	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28890351
68	NC_013839	ATA	4	16862	16873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28890351
69	NC_013839	ATA	4	17513	17523	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_013839	ATAG	3	17594	17604	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_013839	TACT	3	17835	17846	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_013839	TTA	4	18733	18745	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_013839	ATTATA	3	19282	19298	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_013839	AATTT	3	19473	19487	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_013839	TTAA	3	19511	19522	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_013839	ATTA	3	19537	19549	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_013839	TAG	5	19603	19617	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_013839	TTA	4	19772	19782	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_013839	TAA	4	20065	20076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_013839	AAAGA	3	20077	20090	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_013839	TTATA	6	20148	20177	30	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_013839	AAT	4	20270	20282	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_013839	TAATG	13	20789	20853	65	40 %	40 %	20 %	0 %	3 %	Non-Coding
84	NC_013839	AT	7	21104	21116	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28890351
85	NC_013839	AT	6	21152	21163	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28890351
86	NC_013839	TAT	4	21214	21225	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890351
87	NC_013839	TTA	4	21241	21251	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890351
88	NC_013839	ATAAG	13	21691	21754	64	60 %	20 %	20 %	0 %	9 %	28890351
89	NC_013839	TA	6	22030	22041	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_013839	ATA	9	22060	22086	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_013839	ATATT	3	23243	23257	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	28890351
92	NC_013839	TA	6	23715	23725	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_013839	CTA	4	23907	23918	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_013839	ATA	6	24369	24386	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
95	NC_013839	ATATG	7	25262	25295	34	40 %	40 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_013839	AT	6	25447	25457	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_013839	ATT	5	25748	25762	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_013839	ATATA	3	25765	25779	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_013839	GAT	4	25841	25851	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	28890352
100	NC_013839	TTTA	3	25966	25976	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	28890352
101	NC_013839	TTA	4	26187	26197	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890352
102	NC_013839	TA	6	26272	26282	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890352
103	NC_013839	TA	8	26590	26605	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	28890352
104	NC_013839	TTA	4	27076	27086	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890352
105	NC_013839	AATT	3	27501	27513	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28890352
106	NC_013839	CATAT	9	27924	27968	45	40 %	40 %	0 %	20 %	4 %	Non-Coding
107	NC_013839	TATAT	4	27995	28018	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_013839	AGT	4	28020	28030	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_013839	ATAA	4	28185	28200	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
110	NC_013839	AT	10	28421	28439	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_013839	TTA	4	28479	28490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_013839	TCT	9	28708	28734	27	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
113	NC_013839	ATT	4	28794	28805	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_013839	ATTAT	3	29109	29122	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_013839	TA	6	29260	29270	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28890352
116	NC_013839	CATTA	3	29892	29905	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	28890352
117	NC_013839	TAT	4	30102	30112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28890352
118	NC_013839	TATT	3	30145	30156	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	28890352
119	NC_013839	AAT	4	30578	30589	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_013839	TATAA	3	30610	30623	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_013839	GTAA	3	30625	30637	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_013839	TA	6	30912	30923	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_013839	AT	7	30984	30997	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_013839	TA	6	31021	31031	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_013839	ACTCT	3	31195	31208	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
126	NC_013839	AGCATA	3	31298	31315	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
127	NC_013839	TA	7	31335	31347	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_013839	AT	7	31401	31416	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
129	NC_013839	TA	7	32492	32504	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_013839	TA	6	32551	32561	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_013839	CTTA	3	32574	32585	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
132	NC_013839	TA	7	32593	32605	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
133	NC_013839	ATTAT	4	32894	32913	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
134	NC_013839	AT	7	33096	33108	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_013839	AT	8	33134	33148	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_013839	AAGTA	5	33177	33200	24	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_013839	TTATAT	3	33386	33404	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
138	NC_013839	AT	6	33525	33535	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_013839	AT	6	33592	33603	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_013839	AT	7	33686	33698	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
141	NC_013839	TAT	4	33716	33726	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
142	NC_013839	TAA	4	33770	33780	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_013839	AT	7	33828	33841	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_013839	TA	6	33955	33965	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
145	NC_013839	TAT	4	34190	34202	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
146	NC_013839	TTTAT	5	34233	34257	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_013839	CTATA	6	34269	34298	30	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
148	NC_013839	TA	7	34349	34361	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
149	NC_013839	TTAA	4	34985	35000	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
150	NC_013839	TAT	4	35076	35088	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28890352
151	NC_013839	TA	7	35217	35229	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
152	NC_013839	ATA	4	35240	35252	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
153	NC_013839	ATT	4	35292	35303	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890352
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155	NC_013839	AATT	3	36042	36053	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_013839	TAT	4	36160	36171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28890352
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161	NC_013839	TTATA	3	37953	37966	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	28890352
162	NC_013839	TA	6	38053	38064	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
163	NC_013839	AATTAT	3	38185	38203	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
164	NC_013839	AT	6	38357	38367	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
165	NC_013839	AT	7	38396	38408	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
166	NC_013839	TAT	4	38454	38464	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
167	NC_013839	AT	11	38477	38499	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
168	NC_013839	AT	8	38888	38903	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
169	NC_013839	AAGATA	4	38990	39013	24	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	4 %	Non-Coding
170	NC_013839	ATTA	5	39154	39172	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
171	NC_013839	TA	6	39213	39223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
172	NC_013839	AT	6	39364	39376	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
173	NC_013839	AT	6	39387	39397	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Candida sojae mitochondrion