ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Teladorsagia circumcincta mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013827	TA	6	3	13	11	50 %	50 %	0 %	9 %	288903353
2	NC_013827	TTTATT	3	1413	1430	18	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	288903353
3	NC_013827	ATT	4	1584	1595	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_013827	TAAA	3	1659	1669	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_013827	TAA	4	1756	1767	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_013827	TTA	4	1768	1780	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_013827	TAT	4	2154	2164	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	288903354
8	NC_013827	ATTTT	3	3169	3183	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_013827	TAT	4	3765	3775	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	288903355
10	NC_013827	ATG	4	3897	3907	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	288903355
11	NC_013827	TTTTA	3	4080	4094	15	20 %	80 %	0 %	6 %	288903356
12	NC_013827	ATT	5	4164	4177	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	288903356
13	NC_013827	ATA	4	4427	4438	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288903356
14	NC_013827	TTTA	3	4769	4780	12	25 %	75 %	0 %	8 %	288903356
15	NC_013827	ATT	4	4998	5009	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	288903356
16	NC_013827	TTAA	3	5133	5144	12	50 %	50 %	0 %	8 %	288903356
17	NC_013827	ATTT	3	5246	5256	11	25 %	75 %	0 %	9 %	288903356
18	NC_013827	ATTA	3	5257	5267	11	50 %	50 %	0 %	9 %	288903356
19	NC_013827	TA	6	5654	5667	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_013827	TTA	6	5668	5685	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_013827	TAT	5	5710	5723	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_013827	TTA	4	5766	5776	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_013827	TTTTA	3	6201	6215	15	20 %	80 %	0 %	6 %	288903357
24	NC_013827	GTTTT	3	6354	6367	14	0 %	80 %	20 %	7 %	288903357
25	NC_013827	ATTT	3	6459	6470	12	25 %	75 %	0 %	8 %	288903357
26	NC_013827	TAA	4	6747	6758	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288903358
27	NC_013827	T	13	7282	7294	13	0 %	100 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_013827	AT	6	7528	7539	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_013827	TTA	4	7851	7863	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_013827	ATTG	3	7898	7908	11	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_013827	TAA	4	7940	7950	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_013827	GTTT	3	8328	8338	11	0 %	75 %	25 %	9 %	288903359
33	NC_013827	TTTAA	3	8854	8867	14	40 %	60 %	0 %	7 %	288903359
34	NC_013827	TTTA	3	9464	9476	13	25 %	75 %	0 %	7 %	288903360
35	NC_013827	TAA	4	9718	9729	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288903361
36	NC_013827	AATT	3	9818	9828	11	50 %	50 %	0 %	9 %	288903361
37	NC_013827	ATA	4	10047	10058	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288903361
38	NC_013827	ATTT	3	10132	10143	12	25 %	75 %	0 %	8 %	288903361
39	NC_013827	TTAA	3	10162	10173	12	50 %	50 %	0 %	8 %	288903361
40	NC_013827	ATTTTT	3	10212	10230	19	16.67 %	83.33 %	0 %	10 %	288903361
41	NC_013827	TTAATT	5	10239	10269	31	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	288903361
42	NC_013827	TGA	4	10585	10595	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
43	NC_013827	TTAA	3	10808	10819	12	50 %	50 %	0 %	8 %	288903362
44	NC_013827	GTTTT	3	11295	11309	15	0 %	80 %	20 %	6 %	288903362
45	NC_013827	GTT	4	11331	11342	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	288903362
46	NC_013827	TATT	3	11581	11591	11	25 %	75 %	0 %	9 %	288903362
47	NC_013827	TAAAT	3	11705	11718	14	60 %	40 %	0 %	7 %	288903362
48	NC_013827	ATTT	4	11820	11835	16	25 %	75 %	0 %	6 %	288903362
49	NC_013827	ATTT	3	12511	12521	11	25 %	75 %	0 %	9 %	288903363
50	NC_013827	TTGTTT	3	12673	12690	18	0 %	83.33 %	16.67 %	5 %	288903363
51	NC_013827	AATTTT	3	13071	13088	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	288903364
52	NC_013827	TAA	4	13583	13594	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	288903364
53	NC_013827	TTTA	3	13838	13848	11	25 %	75 %	0 %	9 %	288903364
54	NC_013827	AAT	5	13906	13920	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	288903364
55	NC_013827	TTAA	3	13989	13999	11	50 %	50 %	0 %	9 %	288903364

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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