ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pneumocystis carinii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013660	TAT	4	40	52	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_013660	AT	11	58	79	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_013660	TA	9	84	100	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_013660	TAT	4	133	145	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_013660	TAT	4	177	187	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_013660	TAT	4	215	225	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_013660	TAT	4	231	243	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_013660	TAT	4	261	271	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_013660	TA	7	547	559	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28142879
10	NC_013660	AT	8	572	586	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	28142879
11	NC_013660	AT	7	597	611	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	28142879
12	NC_013660	TAT	4	609	621	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28142879
13	NC_013660	ATTAT	5	625	647	23	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	28142879
14	NC_013660	TATATG	3	665	682	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	28142879
15	NC_013660	AT	6	690	702	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28142879
16	NC_013660	TA	6	710	722	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28142879
17	NC_013660	TA	12	732	758	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28142879
18	NC_013660	TAT	4	800	812	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	28142879
19	NC_013660	TAT	4	845	855	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	28142879
20	NC_013660	TAT	4	1111	1123	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_013660	AT	6	1193	1203	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_013660	CATA	3	1817	1827	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
23	NC_013660	TA	8	2024	2039	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_013660	GAA	4	2555	2565	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28142880
25	NC_013660	AAAGA	3	2738	2751	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	28142880
26	NC_013660	TAA	4	3283	3294	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142880
27	NC_013660	CTC	4	4256	4267	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	28142880
28	NC_013660	ATA	5	4343	4357	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	28142880
29	NC_013660	AAGA	3	4584	4596	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	28142880
30	NC_013660	ATAA	3	5393	5403	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28142880
31	NC_013660	ATA	4	5608	5619	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142880
32	NC_013660	TTA	4	5753	5764	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	28142880
33	NC_013660	AGA	4	6543	6553	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28142880
34	NC_013660	ATGAG	3	7193	7207	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	28142880
35	NC_013660	TA	6	7395	7405	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28142880
36	NC_013660	GA	6	7809	7820	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_013660	GA	6	7833	7844	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_013660	ATTT	3	8524	8535	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_013660	ATT	4	8541	8552	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_013660	TTA	4	8577	8588	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_013660	ATT	4	8617	8628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_013660	ATT	4	8679	8690	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_013660	GATT	3	9727	9737	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	28142880
44	NC_013660	ATAA	3	10576	10587	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28142880
45	NC_013660	ATA	4	10627	10637	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28142880
46	NC_013660	TGA	4	11468	11480	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	28142880
47	NC_013660	AGA	4	12194	12206	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	28142880
48	NC_013660	TAAA	3	12495	12505	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_013660	TAA	4	12662	12673	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142881
50	NC_013660	AAG	4	13398	13410	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	28142881
51	NC_013660	AGA	4	13812	13824	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_013660	TAC	4	14082	14095	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	28142881
53	NC_013660	AAT	4	14923	14935	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28142881
54	NC_013660	AAT	5	14953	14967	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	28142881
55	NC_013660	TAA	4	15069	15079	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28142881
56	NC_013660	AAG	4	15314	15325	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	28142881
57	NC_013660	AT	6	15421	15433	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28142881
58	NC_013660	AAG	5	15962	15976	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	28142881
59	NC_013660	TAA	4	16200	16211	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142881
60	NC_013660	TATCC	3	17018	17032	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
61	NC_013660	TAC	4	17534	17548	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
62	NC_013660	ATA	4	17564	17575	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28142881
63	NC_013660	ATAA	3	17634	17645	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28142881
64	NC_013660	AATA	5	17786	17805	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
65	NC_013660	TGTA	3	18217	18228	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	28142881
66	NC_013660	TAA	4	18333	18343	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	28142881
67	NC_013660	ACCT	3	18405	18415	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	28142881
68	NC_013660	TAA	4	20213	20224	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_013660	TACATA	4	20577	20599	23	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
70	NC_013660	TAA	6	21090	21106	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_013660	TATTC	3	21953	21966	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
72	NC_013660	TA	6	22392	22402	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_013660	CA	7	22468	22480	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
74	NC_013660	TA	8	22613	22627	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_013660	AT	7	22645	22658	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pneumocystis carinii mitochondrion