ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Halyomorpha halys mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013272	TGAATA	3	279	296	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	260150944
2	NC_013272	TAA	4	412	423	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	260150944
3	NC_013272	TAA	4	464	474	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260150944
4	NC_013272	TAA	5	601	616	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260150944
5	NC_013272	TAA	5	614	628	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260150944
6	NC_013272	ATA	5	909	923	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	260150944
7	NC_013272	ATT	4	1056	1067	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260150944
8	NC_013272	TA	6	1232	1243	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_013272	CTATTA	3	2004	2020	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	260150945
10	NC_013272	AGG	4	2059	2070	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	260150945
11	NC_013272	TAT	4	2632	2642	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260150945
12	NC_013272	AACA	3	3134	3144	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	260150946
13	NC_013272	AATT	3	4116	4128	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	260150948
14	NC_013272	TAA	4	4524	4534	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260150948
15	NC_013272	ATT	5	4543	4557	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	260150948
16	NC_013272	ATT	5	4805	4819	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	260150949
17	NC_013272	CATT	3	6351	6361	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	260150951
18	NC_013272	TAA	4	6619	6629	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260150951
19	NC_013272	TAA	4	6733	6744	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	260150951
20	NC_013272	AATA	3	6869	6880	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	260150951
21	NC_013272	AATTA	3	7008	7021	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	260150951
22	NC_013272	AATA	3	7312	7323	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	260150951
23	NC_013272	TAAA	3	7492	7502	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	260150951
24	NC_013272	AT	6	7849	7860	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	260150951
25	NC_013272	ATA	4	7947	7957	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	260150951
26	NC_013272	ATT	4	8042	8053	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_013272	TAT	4	8397	8408	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260150952
28	NC_013272	TAAA	3	8681	8691	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	260150952
29	NC_013272	AAT	4	8693	8705	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	260150952
30	NC_013272	ATCA	3	8892	8903	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	260150952
31	NC_013272	AAAT	3	8979	8989	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	260150952
32	NC_013272	TAA	4	9108	9119	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	260150952
33	NC_013272	AATA	3	9325	9336	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	260150952
34	NC_013272	TAAAAA	3	9551	9568	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	260150953
35	NC_013272	TAT	4	9834	9846	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260150954
36	NC_013272	ATT	7	9974	9994	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260150954
37	NC_013272	TAT	4	10069	10079	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	260150954
38	NC_013272	TAA	4	10086	10097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	260150954
39	NC_013272	ATTAT	3	10211	10224	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	260150954
40	NC_013272	ATT	5	10659	10672	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260150955
41	NC_013272	ATTT	3	10865	10875	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	260150955
42	NC_013272	AAT	4	10880	10891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	260150955
43	NC_013272	ATT	5	11298	11311	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	260150955
44	NC_013272	TCAAA	3	11679	11692	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	260150956
45	NC_013272	ATT	4	12028	12039	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	260150956
46	NC_013272	AATT	3	12264	12275	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	260150956
47	NC_013272	TAA	4	12946	12957	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_013272	AATAAA	4	13438	13461	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_013272	AAT	4	13473	13484	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_013272	AATTA	3	13489	13503	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_013272	ATA	4	13774	13785	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_013272	AT	6	13998	14008	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_013272	AAT	4	14057	14071	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_013272	TCAA	3	14695	14706	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_013272	AT	6	14928	14938	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_013272	TAA	4	15127	15139	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_013272	ATA	4	15567	15577	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Halyomorpha halys mitochondrion