ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ditaxis biseriata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_013257	TAT	4	176	186	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_013257	TAT	5	542	556	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	258649629
3	NC_013257	AT	6	597	608	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	258649629
4	NC_013257	ATT	4	780	791	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649629
5	NC_013257	ATA	4	1305	1316	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649629
6	NC_013257	TTCT	3	2987	2997	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	258649630
7	NC_013257	AAT	4	3146	3157	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_013257	AATT	3	3372	3384	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	258649631
9	NC_013257	TTA	4	4069	4079	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	258649632
10	NC_013257	TTAA	3	4690	4702	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	258649633
11	NC_013257	TA	7	5609	5621	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_013257	AT	6	5922	5935	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	258649635
13	NC_013257	CTTT	3	6267	6277	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_013257	ATTAAT	3	6441	6458	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	258649636
15	NC_013257	AAT	4	6629	6639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	258649636
16	NC_013257	ATAA	3	6694	6704	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	258649636
17	NC_013257	TAA	4	6710	6721	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649636
18	NC_013257	TAT	4	6791	6802	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649636
19	NC_013257	TAA	4	6875	6886	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649636
20	NC_013257	TAATA	3	6902	6916	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	258649636
21	NC_013257	TTA	4	7309	7320	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649636
22	NC_013257	ATA	5	7417	7431	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	258649636
23	NC_013257	AAT	4	7853	7865	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	258649636
24	NC_013257	AAAAT	4	8089	8108	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	258649636
25	NC_013257	ATTC	3	8554	8564	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	258649637
26	NC_013257	AAAT	4	9130	9144	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	258649637
27	NC_013257	AAAAT	4	9219	9238	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	258649637
28	NC_013257	TATAA	3	9259	9272	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	258649637
29	NC_013257	AT	8	9708	9722	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	258649638
30	NC_013257	AGAA	3	9923	9934	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_013257	TTTA	3	10175	10186	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	258649639
32	NC_013257	TA	6	10241	10253	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	258649639
33	NC_013257	TTA	4	10251	10263	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	258649639
34	NC_013257	ATT	5	10442	10457	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	258649639
35	NC_013257	ATTT	3	11095	11105	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	258649640
36	NC_013257	TAT	4	11221	11232	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	258649640
37	NC_013257	ATT	4	11474	11484	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	258649640
38	NC_013257	AAATT	3	11716	11730	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	258649641
39	NC_013257	AGA	4	12085	12095	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	258649641
40	NC_013257	ATA	5	12200	12213	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	258649641
41	NC_013257	CTAAAT	3	12353	12369	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	258649641
42	NC_013257	CTA	4	12602	12613	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	258649641
43	NC_013257	TAA	4	12627	12638	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	258649641
44	NC_013257	AAT	4	13015	13027	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_013257	TAAT	4	13111	13126	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_013257	TTA	4	13472	13483	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_013257	TAT	4	13495	13506	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_013257	AAATT	4	13702	13720	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_013257	ATT	4	14005	14016	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_013257	AAAT	5	14233	14252	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
51	NC_013257	TAT	5	14384	14398	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_013257	AAATT	3	14967	14980	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_013257	ATTT	3	15006	15018	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_013257	TAA	4	15087	15098	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_013257	TTAA	3	15250	15260	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_013257	TTATA	4	15296	15315	20	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_013257	ATAAA	3	15483	15496	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_013257	TTAA	4	15558	15573	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_013257	TA	6	15752	15762	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_013257	TAA	4	15796	15806	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_013257	TATAAT	3	15844	15861	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_013257	TA	8	15937	15953	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_013257	TTATAT	3	15954	15970	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_013257	TA	6	15988	15998	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_013257	TA	8	16007	16023	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_013257	AT	13	16046	16069	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_013257	TAAA	3	16171	16181	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_013257	TA	6	16203	16214	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_013257	TTTTA	3	16290	16303	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_013257	TTAA	3	16318	16328	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_013257	AAATT	3	16358	16371	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ditaxis biseriata mitochondrion