ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Blattella germanica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012901	ATTC	3	1000	1010	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	242624231
2	NC_012901	CATTA	3	1065	1078	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	242624231
3	NC_012901	ATT	4	1229	1241	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	242624231
4	NC_012901	TTTAA	3	1247	1261	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_012901	TAC	4	1318	1329	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
6	NC_012901	TATAA	3	1718	1731	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	242624232
7	NC_012901	ATT	7	2006	2026	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242624232
8	NC_012901	TTTG	3	2283	2293	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	242624232
9	NC_012901	TAAC	3	2857	2867	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	242624232
10	NC_012901	ATT	4	3495	3506	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624233
11	NC_012901	CTT	4	3970	3981	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242624234
12	NC_012901	ATT	4	4102	4114	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	242624235
13	NC_012901	TTAATT	4	4843	4866	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624236
14	NC_012901	TTG	4	5432	5443	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	242624236
15	NC_012901	TTA	4	5561	5572	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624237
16	NC_012901	TAT	4	5605	5615	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242624237
17	NC_012901	TAA	4	6066	6076	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_012901	ACTT	3	6130	6140	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_012901	TAATTA	3	6302	6320	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	242624238
20	NC_012901	AATATA	3	6321	6339	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	242624238
21	NC_012901	TA	6	6546	6556	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242624238
22	NC_012901	AT	7	6785	6798	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242624238
23	NC_012901	AT	6	6919	6930	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242624238
24	NC_012901	TTA	4	7190	7201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624238
25	NC_012901	TAA	4	7299	7310	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624238
26	NC_012901	TAAA	3	7530	7540	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	242624238
27	NC_012901	TAAA	3	7770	7781	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	242624238
28	NC_012901	ATAA	3	8006	8017	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242624238
29	NC_012901	AT	6	8032	8043	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242624238
30	NC_012901	ATA	4	8122	8133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624239
31	NC_012901	AAAAAT	3	8173	8190	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	242624239
32	NC_012901	AT	8	8967	8981	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	242624239
33	NC_012901	TAA	4	9162	9173	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624239
34	NC_012901	ATATAA	4	9338	9361	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624239
35	NC_012901	ATATA	3	9602	9616	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	242624240
36	NC_012901	ATTT	3	10049	10061	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	242624241
37	NC_012901	TTAA	4	10223	10238	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	242624241
38	NC_012901	TAT	4	10264	10275	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242624241
39	NC_012901	AAAT	3	11626	11636	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	242624243
40	NC_012901	ATAA	3	11755	11766	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242624243
41	NC_012901	TAA	4	11982	11993	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242624243
42	NC_012901	TAA	4	12124	12136	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	242624243
43	NC_012901	TAA	4	12484	12494	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	242624243
44	NC_012901	TAA	4	12498	12510	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	242624243
45	NC_012901	TTAA	3	13052	13062	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_012901	TAA	4	13067	13078	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_012901	TA	7	13204	13217	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_012901	AATT	3	13287	13297	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_012901	TAAT	3	13340	13350	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_012901	TAA	4	13521	13532	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_012901	ATT	4	13633	13644	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_012901	AATA	4	13695	13709	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_012901	AATAA	3	13744	13757	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_012901	AAATT	3	13867	13880	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_012901	GATC	3	14305	14315	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_012901	ACAA	3	14530	14541	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
57	NC_012901	A	13	14828	14840	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Blattella germanica mitochondrion