ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lymantria dispar mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012893	ATTT	3	469	479	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242610073
2	NC_012893	TTAA	3	537	547	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242610073
3	NC_012893	ATT	4	1032	1044	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	242610073
4	NC_012893	TTTA	3	1106	1117	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	242610073
5	NC_012893	TTAA	3	1147	1158	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242610073
6	NC_012893	AAAT	3	1187	1197	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	242610073
7	NC_012893	T	13	1254	1266	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242610073
8	NC_012893	TATAA	3	1751	1764	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	255961287
9	NC_012893	AGG	4	2132	2142	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	255961287
10	NC_012893	GAAA	3	2251	2262	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	255961287
11	NC_012893	AATT	3	3736	3746	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	255961288
12	NC_012893	TTA	4	3931	3942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242610076
13	NC_012893	TATT	4	3941	3956	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	242610076
14	NC_012893	ATA	5	3992	4007	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	242610076
15	NC_012893	TAA	5	4014	4028	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	242610076
16	NC_012893	TAAAA	3	4040	4054	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	242610076
17	NC_012893	TTAA	3	4626	4638	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242610077
18	NC_012893	TTAA	3	4738	4749	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	242610077
19	NC_012893	ATT	5	5395	5409	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	242610078
20	NC_012893	TATTTA	3	5547	5565	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_012893	ATTTT	3	5892	5905	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	242610079
22	NC_012893	ATT	4	6120	6131	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_012893	TA	16	6259	6291	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_012893	TAA	4	6320	6330	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_012893	T	12	6333	6344	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_012893	AT	14	6414	6440	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242610080
27	NC_012893	ATA	5	6447	6461	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	242610080
28	NC_012893	TAAA	3	6495	6506	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	242610080
29	NC_012893	TTA	4	6885	6896	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	242610080
30	NC_012893	AAAT	3	7041	7052	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242610080
31	NC_012893	TAAA	3	7245	7255	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	242610080
32	NC_012893	TTA	4	7320	7331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242610080
33	NC_012893	TAA	4	7429	7439	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	242610080
34	NC_012893	A	15	8107	8121	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	242610080
35	NC_012893	TAT	5	8122	8136	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	242610080
36	NC_012893	A	25	8137	8161	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	242610080
37	NC_012893	TAA	4	8312	8326	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	242610081
38	NC_012893	ATC	4	8551	8562	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	242610081
39	NC_012893	TAAA	3	9074	9084	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	242610081
40	NC_012893	TA	6	9104	9115	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242610081
41	NC_012893	AAAAT	3	9247	9260	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	242610081
42	NC_012893	TAT	4	9569	9580	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242610081
43	NC_012893	TTTAA	3	9599	9613	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_012893	A	13	9766	9778	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	242610082
45	NC_012893	AATA	3	9855	9865	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	242610082
46	NC_012893	ATT	5	10091	10105	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	242610083
47	NC_012893	TTTA	3	10241	10252	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	242610083
48	NC_012893	TTA	5	10318	10332	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	242610083
49	NC_012893	TAA	7	10489	10509	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	242610083
50	NC_012893	TTTA	3	10510	10521	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	242610083
51	NC_012893	TAAAT	3	10577	10591	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	242610083
52	NC_012893	TA	7	10602	10616	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_012893	TA	6	10812	10822	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242610084
54	NC_012893	ATTT	3	11201	11211	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242610084
55	NC_012893	TAT	4	11649	11659	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242610084
56	NC_012893	TTA	4	11739	11749	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242610084
57	NC_012893	ATTA	3	11792	11807	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	242610084
58	NC_012893	AATA	3	11843	11854	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012893	TATT	3	11858	11869	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_012893	ATA	5	12360	12373	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	242610085
61	NC_012893	TAA	4	12534	12544	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	242610085
62	NC_012893	TAAAAT	3	12781	12798	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	242610085
63	NC_012893	AT	6	12824	12834	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242610085
64	NC_012893	TA	12	12919	12944	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_012893	TAAA	3	13161	13171	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_012893	TAAA	4	13343	13357	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_012893	TTAA	3	13528	13538	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_012893	AAAT	3	13721	13731	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_012893	TATT	4	14246	14261	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_012893	ATT	4	14842	14853	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_012893	T	12	15127	15138	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_012893	T	18	15161	15178	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_012893	TA	12	15202	15226	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_012893	TA	6	15282	15295	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_012893	TTA	4	15302	15313	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_012893	AATT	3	15320	15330	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lymantria dispar mitochondrion