ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Hydrometra sp. NKMT020 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012842	GATA	3	30	42	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012842	ATA	4	304	314	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266641
3	NC_012842	ATA	4	340	350	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266641
4	NC_012842	AAT	4	358	370	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	240266641
5	NC_012842	AAATAT	3	449	466	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	240266641
6	NC_012842	ATT	4	603	614	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266641
7	NC_012842	ATA	4	909	920	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266641
8	NC_012842	ATA	4	1071	1082	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266641
9	NC_012842	AAG	4	1727	1738	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	240266642
10	NC_012842	TTA	4	1974	1985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266642
11	NC_012842	AT	7	2722	2736	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	240266642
12	NC_012842	TAATTA	4	3079	3102	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	240266643
13	NC_012842	AATA	3	3135	3146	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266643
14	NC_012842	TA	6	3244	3254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266643
15	NC_012842	TTAA	3	3871	3881	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266645
16	NC_012842	ATAA	3	3934	3944	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266645
17	NC_012842	ATA	4	4104	4118	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266646
18	NC_012842	TA	6	4115	4126	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	240266646
19	NC_012842	TTA	4	4515	4526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266646
20	NC_012842	ATA	4	4744	4755	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266644
21	NC_012842	TAAA	3	5501	5511	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_012842	TAA	4	5546	5557	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_012842	ATTGTA	3	5895	5912	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	240266647
24	NC_012842	TAA	4	6439	6450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266648
25	NC_012842	ATA	4	6877	6888	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266648
26	NC_012842	TGAA	3	7468	7478	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	240266648
27	NC_012842	ATA	5	7574	7587	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	240266648
28	NC_012842	ATA	4	7615	7626	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266648
29	NC_012842	TCA	4	7877	7887	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	240266648
30	NC_012842	TA	7	7886	7899	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	240266648
31	NC_012842	ATAAAT	3	8041	8057	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	240266648
32	NC_012842	TAA	5	8248	8261	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	240266649
33	NC_012842	AATA	3	9007	9018	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266649
34	NC_012842	TA	8	9036	9052	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	240266649
35	NC_012842	AATA	3	9375	9385	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266649
36	NC_012842	ATAAA	3	9407	9421	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	240266649
37	NC_012842	ATAAA	3	9636	9650	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	240266650
38	NC_012842	A	13	9661	9673	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	240266650
39	NC_012842	TAAT	3	9929	9941	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	240266651
40	NC_012842	TAA	5	10031	10045	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266651
41	NC_012842	TATT	3	10242	10253	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	240266651
42	NC_012842	AATTAT	3	11302	11319	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	240266653
43	NC_012842	TA	6	11626	11638	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	240266652
44	NC_012842	AAT	4	11766	11777	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266652
45	NC_012842	ATAA	3	11873	11884	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266652
46	NC_012842	ATA	4	12230	12241	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266652
47	NC_012842	A	13	12993	13005	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_012842	TA	6	13006	13016	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_012842	TTA	4	13315	13326	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_012842	TAA	4	13341	13351	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_012842	TTAAT	3	13489	13502	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_012842	AATT	4	13675	13690	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_012842	AAAT	4	13834	13849	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_012842	ATT	4	13895	13907	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_012842	ATCATA	3	14314	14332	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
56	NC_012842	AAT	4	14407	14419	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_012842	AAAT	3	14694	14705	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_012842	TAT	4	15107	15117	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_012842	AT	6	15143	15153	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_012842	T	12	15270	15281	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Hydrometra sp. NKMT020 mitochondrion