ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gerris sp. NKMT033 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012841	GATA	3	30	42	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012841	AAT	5	434	449	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266627
3	NC_012841	TAT	4	473	484	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266627
4	NC_012841	AAT	5	494	508	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	240266627
5	NC_012841	AAT	4	633	643	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266627
6	NC_012841	AATT	3	849	861	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	240266627
7	NC_012841	TAA	4	1118	1129	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266627
8	NC_012841	TAT	4	1924	1935	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266628
9	NC_012841	AT	6	2757	2768	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	240266628
10	NC_012841	TA	6	3280	3290	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	240266629
11	NC_012841	AAC	4	3671	3681	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	240266629
12	NC_012841	ATT	4	3820	3832	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_012841	AAAT	3	3937	3948	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266630
14	NC_012841	ATA	4	3952	3963	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266630
15	NC_012841	TAT	4	4067	4078	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266631
16	NC_012841	TAT	5	4538	4551	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	240266631
17	NC_012841	CAG	4	4591	4602	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	240266631
18	NC_012841	ATA	4	5504	5515	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266633
19	NC_012841	ACA	4	5513	5524	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	240266633
20	NC_012841	AAT	7	5527	5547	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266633
21	NC_012841	ATT	5	5717	5730	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	240266633
22	NC_012841	ACA	4	5777	5788	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	240266633
23	NC_012841	TAT	4	5792	5802	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	240266633
24	NC_012841	ATA	4	6324	6334	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266634
25	NC_012841	AT	7	7253	7267	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	240266634
26	NC_012841	CAAA	3	8217	8227	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	240266635
27	NC_012841	TAA	4	8265	8276	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266635
28	NC_012841	ATT	4	8597	8608	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	240266635
29	NC_012841	TAAA	3	8620	8631	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	240266635
30	NC_012841	TTAAA	4	8844	8862	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	240266635
31	NC_012841	AAAATA	3	9026	9044	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	240266635
32	NC_012841	GAAA	3	9223	9233	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	240266635
33	NC_012841	AAATT	3	9239	9252	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	240266635
34	NC_012841	AATA	3	9268	9278	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266635
35	NC_012841	CAAAA	3	9331	9344	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	240266635
36	NC_012841	ATA	4	9469	9480	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	240266636
37	NC_012841	AAAAC	3	9507	9521	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	240266636
38	NC_012841	TAA	6	9822	9838	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	240266637
39	NC_012841	ATA	5	9902	9915	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	240266637
40	NC_012841	TA	7	9969	9982	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	240266637
41	NC_012841	CTTAT	3	10054	10068	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	240266637
42	NC_012841	TTTA	3	10539	10550	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	240266639
43	NC_012841	TTTA	3	10975	10986	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	240266639
44	NC_012841	AAAT	3	11652	11662	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	240266638
45	NC_012841	TAA	4	12133	12143	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	240266638
46	NC_012841	AT	6	12217	12228	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	240266638
47	NC_012841	AACA	3	12850	12860	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_012841	TTA	4	13177	13188	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_012841	AAAT	3	13712	13722	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_012841	ATT	4	13903	13913	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_012841	TAA	4	13969	13979	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_012841	ATA	4	14211	14222	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_012841	ATA	4	14274	14284	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_012841	AGAA	3	14475	14485	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_012841	TA	7	14695	14707	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_012841	TCT	4	15054	15065	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
57	NC_012841	TTC	4	15071	15081	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gerris sp. NKMT033 mitochondrion