ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Alsophila spinulosa chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_012818	T	14	364	377	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_012818	CAAA	3	507	518	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_012818	AG	6	1483	1494	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	242910149
4	NC_012818	ATC	4	1841	1851	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	242910149
5	NC_012818	AAAT	3	2139	2151	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	242910149
6	NC_012818	TAAA	3	3280	3292	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	242910149
7	NC_012818	TAAAAA	3	3436	3453	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	242910149
8	NC_012818	AATC	3	3664	3674	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	242910149
9	NC_012818	T	15	4289	4303	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	242910149
10	NC_012818	ATTT	3	4593	4603	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242910149
11	NC_012818	AT	6	4808	4818	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
12	NC_012818	GAAC	3	5679	5689	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	242910149
13	NC_012818	TTATA	3	6451	6464	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	242910149
14	NC_012818	G	14	6799	6812	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	242910149
15	NC_012818	ACA	4	7051	7062	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	242910149
16	NC_012818	AATT	3	7138	7148	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
17	NC_012818	TCT	4	7413	7424	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242910149
18	NC_012818	TA	6	7529	7540	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	242910149
19	NC_012818	AT	7	7637	7650	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242910149
20	NC_012818	AG	6	7884	7894	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	242910149
21	NC_012818	C	15	8126	8140	15	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	242910149
22	NC_012818	AAG	4	8145	8155	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	242910149
23	NC_012818	AT	9	8228	8245	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	242910149
24	NC_012818	G	13	8796	8808	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	242910149
25	NC_012818	AGAA	3	9345	9356	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
26	NC_012818	AAGA	3	9531	9542	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
27	NC_012818	C	13	9680	9692	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	242910149
28	NC_012818	CCAATT	3	10489	10506	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	242910149
29	NC_012818	AATT	3	11144	11154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
30	NC_012818	GAAA	3	11674	11685	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
31	NC_012818	TC	7	12280	12293	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	242910149
32	NC_012818	CAG	4	13456	13467	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	242910149
33	NC_012818	C	12	14045	14056	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	242910149
34	NC_012818	T	12	15000	15011	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
35	NC_012818	CTT	4	18584	18595	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242910149
36	NC_012818	TAT	4	19089	19099	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	242910149
37	NC_012818	CATT	3	20380	20390	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	242910149
38	NC_012818	T	13	22281	22293	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
39	NC_012818	AGA	4	22473	22484	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	242910149
40	NC_012818	CT	6	25005	25016	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	242910149
41	NC_012818	ATG	4	25178	25188	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	242910149
42	NC_012818	TC	6	26287	26297	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	242910149
43	NC_012818	GCCCC	3	26548	26562	15	0 %	0 %	20 %	80 %	6 %	242910149
44	NC_012818	A	14	28198	28211	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	242910149
45	NC_012818	CTAT	4	28914	28929	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	242910149
46	NC_012818	AATA	3	28950	28961	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242910149
47	NC_012818	GATT	3	28990	29000	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	242910149
48	NC_012818	GAA	4	29289	29300	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	242910149
49	NC_012818	A	23	29362	29384	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	242910149
50	NC_012818	AT	12	30353	30374	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
51	NC_012818	ACCT	3	30807	30819	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	242910149
52	NC_012818	TCC	4	31126	31138	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	242910149
53	NC_012818	G	12	31694	31705	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	242910149
54	NC_012818	TCAA	3	31718	31730	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	242910149
55	NC_012818	A	13	31775	31787	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	242910149
56	NC_012818	TTGA	3	31908	31919	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	242910149
57	NC_012818	TTGA	3	32813	32823	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	242910149
58	NC_012818	TC	6	32919	32930	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	242910149
59	NC_012818	A	12	32989	33000	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	242910149
60	NC_012818	T	13	33060	33072	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
61	NC_012818	ATCT	4	33593	33608	16	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	242910149
62	NC_012818	ATAG	5	33611	33630	20	50 %	25 %	25 %	0 %	5 %	242910149
63	NC_012818	GAA	4	33871	33882	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	242910149
64	NC_012818	AAGC	3	34319	34329	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	242910149
65	NC_012818	AGT	4	36252	36262	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	242910149
66	NC_012818	CT	6	36452	36463	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	242910149
67	NC_012818	CTTT	3	36518	36529	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
68	NC_012818	TCAA	3	36567	36578	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	242910149
69	NC_012818	CTTT	3	36790	36801	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
70	NC_012818	AG	6	36825	36835	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	242910149
71	NC_012818	A	12	36847	36858	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	242910149
72	NC_012818	TAG	4	36898	36908	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	242910149
73	NC_012818	TTAA	3	37183	37194	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242910149
74	NC_012818	T	21	37263	37283	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	242910149
75	NC_012818	ATAA	3	37339	37350	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	242910149
76	NC_012818	TTA	4	37351	37362	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	242910149
77	NC_012818	TCAA	3	37538	37549	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	242910149
78	NC_012818	TTTC	3	37968	37978	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242910149
79	NC_012818	TTTC	3	38767	38777	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	242910149
80	NC_012818	ATTT	3	38905	38915	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	242910149
81	NC_012818	AG	7	39017	39030	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	242910149
82	NC_012818	CCTG	3	40294	40304	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	242910149
83	NC_012818	ATG	4	40405	40415	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	242910149
84	NC_012818	T	14	44223	44236	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242910149
85	NC_012818	C	15	45321	45335	15	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	242910149
86	NC_012818	T	17	45718	45734	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	242910149
87	NC_012818	TTA	5	45749	45762	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	242910149
88	NC_012818	A	16	45774	45789	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	242910149
89	NC_012818	T	12	45844	45855	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
90	NC_012818	GAA	4	47532	47542	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	242910149
91	NC_012818	A	14	48335	48348	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	242910149
92	NC_012818	T	13	48937	48949	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
93	NC_012818	CTGA	3	49452	49462	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	242910149
94	NC_012818	CTTT	3	49869	49880	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
95	NC_012818	AAGGT	3	51083	51097	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	242910149
96	NC_012818	T	12	51278	51289	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	242910149
97	NC_012818	A	14	52139	52152	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	242910149
98	NC_012818	TA	12	52226	52250	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242910149
99	NC_012818	AGA	4	52516	52527	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	242910149
100	NC_012818	T	13	54704	54716	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
101	NC_012818	CTGC	3	56412	56422	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	242910149
102	NC_012818	T	22	56547	56568	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	242910149
103	NC_012818	T	21	56968	56988	21	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	242910149
104	NC_012818	TATT	3	58017	58032	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	242910149
105	NC_012818	AAAG	3	58039	58050	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	242910149
106	NC_012818	A	16	58077	58092	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	242910149
107	NC_012818	AAT	4	58357	58368	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	242910149
108	NC_012818	T	15	58500	58514	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	242910149
109	NC_012818	TCTCAT	3	58829	58847	19	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	10 %	242910149
110	NC_012818	TTGT	3	58864	58875	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	242910149
111	NC_012818	ATGA	3	61302	61313	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	242910149
112	NC_012818	CTA	4	62043	62054	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	242910149
113	NC_012818	C	13	62525	62537	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	242910149
114	NC_012818	GATG	3	62556	62567	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	242910149
115	NC_012818	AGA	4	63000	63010	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	242910149
116	NC_012818	TTCTTT	3	63145	63162	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	242910149
117	NC_012818	T	13	63154	63166	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
118	NC_012818	TCT	4	64280	64292	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	242910149
119	NC_012818	ATTA	3	64346	64357	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	242910149
120	NC_012818	AATT	3	64673	64683	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	242910149
121	NC_012818	CTATTA	3	64774	64792	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	242910149
122	NC_012818	C	12	66640	66651	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	242910149
123	NC_012818	T	17	67329	67345	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
124	NC_012818	TTTC	3	67613	67624	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	242910149
125	NC_012818	T	12	68303	68314	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	242910149
126	NC_012818	T	13	68506	68518	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242910149
127	NC_012818	T	13	68763	68775	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	242910149
128	NC_012818	TATC	3	69219	69230	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	242910149
129	NC_012818	GATA	3	69237	69248	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	242910149
130	NC_012818	CTT	4	69527	69538	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242910149
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242	NC_012818	ATA	5	148460	148474	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	242910149
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245	NC_012818	A	13	153065	153077	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	242910149
246	NC_012818	TTC	4	154417	154428	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	242910149
247	NC_012818	AT	7	154511	154524	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242910149
248	NC_012818	AT	7	154966	154979	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242910149
249	NC_012818	ATTA	3	155805	155817	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	242910149
250	NC_012818	ATA	4	155825	155837	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	242910149
251	NC_012818	AGT	4	156621	156631	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Alsophila spinulosa chloroplast