ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Blastocladiella emersonii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011360	ATT	4	319	329	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20942764
2	NC_011360	CAA	4	1129	1140	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	20942764
3	NC_011360	TATT	3	1179	1190	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	20942764
4	NC_011360	AAT	4	1267	1277	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20942764
5	NC_011360	CTG	4	1576	1587	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	20942764
6	NC_011360	TAA	4	1800	1811	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20942764
7	NC_011360	AAG	4	1814	1825	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_011360	GAA	4	2027	2038	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_011360	TAA	4	4222	4233	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20942764
10	NC_011360	TTTC	3	4327	4338	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	20942764
11	NC_011360	TCT	4	4719	4729	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
12	NC_011360	CTTC	3	4741	4752	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
13	NC_011360	CTT	4	4896	4907	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_011360	ATA	4	5096	5106	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_011360	ATT	4	5661	5672	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20942764
16	NC_011360	TTC	4	6011	6022	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_011360	ATAAA	3	6123	6138	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_011360	AATTAG	3	6346	6362	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	20942764
19	NC_011360	GAA	4	6972	6983	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	20942764
20	NC_011360	TTA	6	7484	7501	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	20942764
21	NC_011360	ATT	4	8153	8164	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20942764
22	NC_011360	ATTT	4	8178	8193	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	20942764
23	NC_011360	GAT	4	8363	8374	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	20942764
24	NC_011360	ATA	4	8956	8967	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20942764
25	NC_011360	AAT	5	9282	9295	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	20942764
26	NC_011360	TAT	4	10434	10444	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_011360	TTC	5	11470	11484	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
28	NC_011360	GAA	4	11871	11882	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_011360	ATTTT	3	12256	12269	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	20942764
30	NC_011360	TAT	4	12590	12601	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20942764
31	NC_011360	TCTT	3	13308	13319	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_011360	ATA	4	13633	13643	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_011360	ATTTT	3	13977	13990	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_011360	TTC	5	15186	15200	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
35	NC_011360	AGA	4	15300	15311	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_011360	TAT	4	15608	15620	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_011360	AACG	3	15692	15702	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_011360	AAT	4	16019	16029	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_011360	TCT	4	16582	16593	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_011360	TCC	4	16597	16608	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
41	NC_011360	AATA	3	18144	18155	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_011360	TATT	3	18338	18349	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	20942765
43	NC_011360	AAG	4	18642	18652	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	20942765
44	NC_011360	CAG	4	18653	18664	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	20942765
45	NC_011360	CTT	11	20050	20081	32	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
46	NC_011360	AT	6	20254	20265	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_011360	CCA	4	20589	20600	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
48	NC_011360	CGAA	3	21236	21247	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011360	AGAAAA	4	21312	21335	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	4 %	Non-Coding
50	NC_011360	TAA	4	21828	21838	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_011360	TAT	4	22779	22789	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20942765
52	NC_011360	GAA	5	23876	23890	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_011360	CTT	4	23967	23978	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_011360	C	13	24058	24070	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
55	NC_011360	GAA	5	24189	24204	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_011360	TTC	4	25550	25561	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	20942765
57	NC_011360	CAT	4	25656	25667	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	20942765
58	NC_011360	CTTT	3	26038	26049	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011360	AAG	4	26092	26103	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_011360	CTT	4	26681	26692	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_011360	TAAA	3	27081	27092	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_011360	TTA	4	27984	27994	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20942765
63	NC_011360	TCT	4	28983	28993	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_011360	TAT	4	29060	29070	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_011360	TTC	4	29111	29123	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
66	NC_011360	ATCTCC	3	29199	29216	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	Non-Coding
67	NC_011360	CTTC	3	29285	29296	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
68	NC_011360	TTC	4	29668	29678	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
69	NC_011360	GAA	4	29823	29834	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_011360	GAA	4	30207	30219	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_011360	TAA	4	30662	30672	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_011360	A	12	30671	30682	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	20942765
73	NC_011360	ATTAAT	3	30792	30810	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	20942765
74	NC_011360	TTCC	3	31516	31526	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
75	NC_011360	AATG	3	34174	34186	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_011360	GGAA	3	34679	34690	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_011360	ATAA	3	34800	34810	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_011360	TAG	4	35732	35742	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	20942765
79	NC_011360	TTC	4	36442	36454	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Blastocladiella emersonii mitochondrion