ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Trachypachus holmbergi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011329	ATTATA	3	432	449	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	208433760
2	NC_011329	ATT	4	509	520	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433760
3	NC_011329	TAT	6	662	679	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	208433760
4	NC_011329	TAA	4	850	861	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433760
5	NC_011329	TTTA	4	1067	1082	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	208433760
6	NC_011329	TAT	7	2069	2089	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433761
7	NC_011329	GGA	4	2161	2171	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	208433761
8	NC_011329	TA	6	4010	4022	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	208433763
9	NC_011329	ATT	4	4668	4679	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	208433764
10	NC_011329	TTTC	3	5043	5054	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	208433765
11	NC_011329	TA	6	5563	5573	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_011329	TAA	5	5639	5653	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	208433766
13	NC_011329	TTAT	3	5654	5665	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	208433766
14	NC_011329	TATAAT	3	5853	5870	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	208433766
15	NC_011329	CTTT	3	6205	6215	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_011329	TTTATA	3	6231	6249	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
17	NC_011329	TAAA	3	6373	6384	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433767
18	NC_011329	TAT	4	6437	6448	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433767
19	NC_011329	AAAATA	4	6958	6981	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	208433767
20	NC_011329	TTA	4	7244	7255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433767
21	NC_011329	TAA	5	7353	7367	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	208433767
22	NC_011329	TGAA	3	7434	7444	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	208433767
23	NC_011329	TAA	4	7784	7796	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	208433767
24	NC_011329	AAAT	3	8037	8048	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	208433767
25	NC_011329	TAA	4	8052	8063	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433767
26	NC_011329	ACTT	3	8120	8131	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_011329	ATA	4	8234	8246	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	208433768
28	NC_011329	ATA	7	8348	8368	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	208433768
29	NC_011329	ATT	4	8596	8607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	208433768
30	NC_011329	ATA	4	9024	9035	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433768
31	NC_011329	AAAT	4	9075	9089	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	208433768
32	NC_011329	A	15	9162	9176	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	208433768
33	NC_011329	ATA	5	9215	9229	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	208433768
34	NC_011329	AAAT	3	9424	9434	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	208433768
35	NC_011329	ATAA	4	9646	9661	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	208433769
36	NC_011329	TAA	6	9698	9715	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	208433769
37	NC_011329	TAT	4	9942	9954	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	208433770
38	NC_011329	ATTTT	4	10075	10094	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	208433770
39	NC_011329	ATT	4	10810	10820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	208433771
40	NC_011329	ATTT	3	11045	11055	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	208433771
41	NC_011329	TTA	5	11153	11166	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	208433771
42	NC_011329	AATAT	4	11683	11702	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	208433772
43	NC_011329	CAAA	3	12047	12059	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	208433772
44	NC_011329	AAT	4	12386	12396	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	208433772
45	NC_011329	TAA	4	12579	12590	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	208433772
46	NC_011329	ATTT	3	13455	13466	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011329	AATAA	3	13752	13765	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_011329	ATTAA	3	13970	13984	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011329	ATTT	3	14003	14013	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_011329	TTTA	3	14620	14630	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_011329	TAAT	3	14798	14808	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_011329	AAATT	3	14833	14846	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_011329	TATAAA	3	14886	14902	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
54	NC_011329	ATA	4	14903	14915	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_011329	TAAA	3	14918	14929	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_011329	TAATAT	3	15098	15116	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Trachypachus holmbergi mitochondrion