ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Blastocystis sp. DMP/02-328 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_011212	TTATTT	3	25	43	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	20000401
2	NC_011212	TTATT	3	290	303	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	20000401
3	NC_011212	ATGT	3	501	511	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_011212	ATT	4	705	717	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000402
5	NC_011212	TAT	5	816	830	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	20000402
6	NC_011212	CAA	5	890	904	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	20000402
7	NC_011212	T	12	1159	1170	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_011212	TTAA	3	1245	1256	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_011212	TAA	4	1423	1435	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_011212	TAA	4	1686	1696	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_011212	AGTT	3	2254	2265	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_011212	AAATA	3	2535	2549	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_011212	AT	6	2951	2962	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_011212	AGTA	3	3117	3128	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_011212	TTAGT	3	3991	4005	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_011212	TAATA	3	4158	4171	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_011212	AATTA	3	7533	7546	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	20000402
18	NC_011212	ATTT	3	9052	9063	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	20000402
19	NC_011212	ATTT	3	9608	9619	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	20000402
20	NC_011212	AAT	5	10215	10230	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	20000402
21	NC_011212	TTAA	3	10450	10462	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	20000402
22	NC_011212	TGTT	3	10639	10649	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	20000402
23	NC_011212	ATTTT	3	10686	10699	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	20000402
24	NC_011212	ACA	4	11750	11761	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	20000402
25	NC_011212	TAT	4	11802	11813	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000402
26	NC_011212	TTTA	3	12174	12185	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	20000402
27	NC_011212	ATT	4	12307	12319	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000402
28	NC_011212	TTTC	3	12407	12417	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	20000402
29	NC_011212	TATT	3	12605	12616	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	20000402
30	NC_011212	TTTA	3	12947	12958	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	20000402
31	NC_011212	ACA	4	13277	13287	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	20000402
32	NC_011212	TCAA	3	13706	13716	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	20000402
33	NC_011212	ATT	4	13976	13986	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000402
34	NC_011212	ATTA	3	14336	14347	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	20000402
35	NC_011212	TTA	4	14350	14361	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000402
36	NC_011212	TAA	4	14388	14399	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_011212	ATA	4	15437	15447	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000403
38	NC_011212	ATATTT	3	15621	15639	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	20000403
39	NC_011212	AATTT	3	15683	15696	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	20000403
40	NC_011212	AT	6	15870	15881	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	20000403
41	NC_011212	TAA	4	15913	15924	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000403
42	NC_011212	A	14	16025	16038	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	20000403
43	NC_011212	TAA	4	16040	16051	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000403
44	NC_011212	TAAA	3	16079	16089	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	20000403
45	NC_011212	TTAAA	3	16208	16223	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	20000403
46	NC_011212	TTAG	3	16399	16409	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	20000403
47	NC_011212	ATT	4	17280	17290	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000403
48	NC_011212	TAA	4	17590	17601	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_011212	TAA	4	17668	17678	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000403
50	NC_011212	GAAA	3	18171	18181	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	20000403
51	NC_011212	TAA	4	18282	18292	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000403
52	NC_011212	ATAAAA	4	18935	18958	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	20000403
53	NC_011212	TAA	4	19002	19012	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000403
54	NC_011212	T	15	19703	19717	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	20000403
55	NC_011212	T	13	19726	19738	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	20000403
56	NC_011212	TTG	4	20086	20097	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	20000403
57	NC_011212	TAT	4	20777	20789	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000403
58	NC_011212	TATATT	3	20897	20915	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	20000403
59	NC_011212	TGTTAA	3	21097	21114	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	20000403
60	NC_011212	TAAA	4	21215	21230	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	20000404
61	NC_011212	TAA	4	21479	21489	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	20000404
62	NC_011212	ATAA	4	21600	21615	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	20000404
63	NC_011212	TAA	4	22074	22085	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	20000404
64	NC_011212	TTTA	3	22512	22522	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	20000404
65	NC_011212	AT	10	22541	22559	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	20000404
66	NC_011212	A	15	22684	22698	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_011212	ATAA	4	22779	22794	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_011212	ATTT	3	24136	24147	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	20000404
69	NC_011212	AAT	4	24217	24228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	20000404
70	NC_011212	TTAA	3	24857	24867	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	20000404
71	NC_011212	ATT	4	25435	25447	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	20000404
72	NC_011212	TAT	4	25964	25975	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	20000404
73	NC_011212	TTTAAT	3	26124	26142	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	20000404
74	NC_011212	A	13	26572	26584	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	20000404
75	NC_011212	TTA	4	27052	27062	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	20000404

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Blastocystis sp. DMP/02-328 mitochondrion