ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pieris melete mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010568	TATTTT	3	271	289	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	177807248
2	NC_010568	AATT	3	779	789	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	177807248
3	NC_010568	TTAA	3	957	967	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	177807248
4	NC_010568	ATA	4	1042	1054	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	177807248
5	NC_010568	TAAAAT	3	1160	1177	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	177807248
6	NC_010568	TAT	4	1933	1944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	177807249
7	NC_010568	GAAA	3	2221	2231	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	177807249
8	NC_010568	ACT	4	2649	2660	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	177807249
9	NC_010568	ATA	5	2831	2845	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	177807249
10	NC_010568	ATT	4	3284	3294	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	177807250
11	NC_010568	AATT	3	3701	3711	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	177807250
12	NC_010568	T	26	3882	3907	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	177807251
13	NC_010568	TTAAAA	3	3959	3977	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	177807251
14	NC_010568	AATT	3	3992	4003	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	177807251
15	NC_010568	AATT	3	4365	4375	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	177807252
16	NC_010568	TTTTA	3	4568	4581	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	177807252
17	NC_010568	TAAT	4	4680	4695	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	177807252
18	NC_010568	T	15	4972	4986	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	177807253
19	NC_010568	TAA	4	5152	5164	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	177807253
20	NC_010568	ATT	5	5190	5204	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	177807253
21	NC_010568	A	12	5916	5927	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_010568	AATATA	3	6325	6342	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	177807255
23	NC_010568	ATAA	3	6528	6539	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	177807255
24	NC_010568	ATA	4	6761	6772	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	177807255
25	NC_010568	AGAAAA	3	6891	6909	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	177807255
26	NC_010568	TTA	4	7190	7201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	177807255
27	NC_010568	AAAT	3	7534	7544	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	177807255
28	NC_010568	AGA	4	7836	7846	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	177807255
29	NC_010568	AATATA	3	7996	8013	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	177807255
30	NC_010568	ATT	4	8040	8051	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_010568	CAAATT	3	8125	8143	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	177807256
32	NC_010568	ATA	4	8180	8192	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	177807256
33	NC_010568	AAT	4	8745	8756	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	177807256
34	NC_010568	TAAAAT	3	9072	9089	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	177807256
35	NC_010568	AAAAT	3	9110	9123	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	177807256
36	NC_010568	TAA	4	9165	9176	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	177807256
37	NC_010568	AT	7	9565	9579	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	177807257
38	NC_010568	TAAA	3	9608	9618	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	177807257
39	NC_010568	AATA	3	9695	9705	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	177807257
40	NC_010568	ATT	5	9835	9849	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_010568	AAT	4	9882	9893	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	177807258
42	NC_010568	AAAT	3	10166	10176	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	177807258
43	NC_010568	TAA	5	10295	10309	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	177807258
44	NC_010568	ATT	4	10309	10321	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	177807258
45	NC_010568	T	14	10667	10680	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	177807259
46	NC_010568	ATTTA	3	10721	10735	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	177807259
47	NC_010568	ATT	5	10752	10765	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	177807259
48	NC_010568	TAA	4	10768	10779	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	177807259
49	NC_010568	ATTT	3	10961	10971	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	177807259
50	NC_010568	ATTT	3	10990	11000	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	177807259
51	NC_010568	AATTT	3	11110	11124	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	177807259
52	NC_010568	TAAT	3	11537	11548	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	177807259
53	NC_010568	ATT	4	11657	11667	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	177807260
54	NC_010568	ATCAAA	3	12008	12026	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	177807260
55	NC_010568	TTAAAA	3	12059	12077	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	177807260
56	NC_010568	CCCA	3	12178	12188	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	177807260
57	NC_010568	ATA	4	12251	12262	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	177807260
58	NC_010568	AAT	4	12321	12332	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	177807260
59	NC_010568	AAAAAT	3	12993	13011	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_010568	AATT	3	13021	13033	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_010568	TTTA	3	13310	13321	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_010568	TTTA	3	13329	13341	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_010568	TAAT	5	13566	13585	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_010568	TTAA	3	13699	13710	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010568	TAATTA	3	13954	13971	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_010568	ATTT	3	14181	14192	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_010568	TAATTT	3	14494	14511	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_010568	TAT	4	14558	14570	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_010568	T	23	14813	14835	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_010568	AAT	4	14890	14901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_010568	TA	6	14915	14925	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_010568	TTTA	3	14928	14939	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_010568	ATA	6	14952	14969	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_010568	AAAT	3	14998	15008	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_010568	AT	16	15018	15048	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pieris melete mitochondrion