ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cycas taitungensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010303	TA	6	2213	2223	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16689563
2	NC_010303	AG	6	4337	4348	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	16689563
3	NC_010303	ATACT	3	5677	5690	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	16689563
4	NC_010303	TA	6	5799	5809	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16689563
5	NC_010303	G	14	6672	6685	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	16689563
6	NC_010303	GGGT	3	6875	6885	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	16689563
7	NC_010303	G	14	7321	7334	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	16689563
8	NC_010303	TGC	4	8065	8075	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	16689563
9	NC_010303	TGC	5	8114	8127	14	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	16689563
10	NC_010303	AAAT	3	8128	8139	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	16689563
11	NC_010303	TTGA	4	8516	8531	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	16689563
12	NC_010303	GAAT	3	10452	10463	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	16689563
13	NC_010303	AAT	4	11694	11705	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	16689563
14	NC_010303	TGAA	3	11863	11873	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16689563
15	NC_010303	G	14	12151	12164	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	16689563
16	NC_010303	CGAT	3	12341	12351	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	16689563
17	NC_010303	CCGG	3	13122	13132	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	16689563
18	NC_010303	CCCA	3	13359	13370	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	16689563
19	NC_010303	CCAG	3	13498	13508	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	16689563
20	NC_010303	CAT	4	13894	13905	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	16689563
21	NC_010303	TA	6	14455	14465	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16689563
22	NC_010303	AGAA	3	14631	14643	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	16689563
23	NC_010303	TA	6	14974	14984	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16689563
24	NC_010303	AGA	4	15060	15071	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	16689563
25	NC_010303	AG	6	15168	15180	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	16689563
26	NC_010303	ATGA	3	15383	15394	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	16689563
27	NC_010303	ATGAA	3	17222	17236	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	16689563
28	NC_010303	CCTTT	3	17250	17263	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	16689563
29	NC_010303	GTG	4	17376	17386	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	16689563
30	NC_010303	TGAA	4	17597	17611	15	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	16689563
31	NC_010303	CTAT	3	18337	18347	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	16689563
32	NC_010303	CTAT	3	18390	18400	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	16689563
33	NC_010303	GCTATT	3	18830	18846	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
34	NC_010303	GCTATT	3	18894	18910	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
35	NC_010303	GCTATT	3	18951	18967	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
36	NC_010303	TCGG	3	20666	20678	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	16689563
37	NC_010303	TTCGG	3	20870	20883	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	16689563
38	NC_010303	ACCC	3	21452	21463	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	16689563
39	NC_010303	ACCT	3	21889	21900	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	16689563
40	NC_010303	GAG	4	24236	24247	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	16689563
41	NC_010303	TCGAT	3	26420	26433	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	16689563
42	NC_010303	TATTC	3	27373	27387	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	16689563
43	NC_010303	AAGA	3	27720	27731	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	16689563
44	NC_010303	GAA	4	27981	27993	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	16689563
45	NC_010303	AAGA	3	28339	28351	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	16689563
46	NC_010303	AATAGC	3	28596	28612	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
47	NC_010303	TA	6	29240	29250	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16689563
48	NC_010303	AATAGT	3	29340	29356	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	16689563
49	NC_010303	AATAGC	3	29439	29455	17	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
50	NC_010303	CTCG	3	29712	29723	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	16689563
51	NC_010303	CCAA	3	29828	29838	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	16689563
52	NC_010303	CAT	4	30242	30252	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	16689563
53	NC_010303	ATA	4	30321	30332	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	16689563
54	NC_010303	ATT	4	30779	30790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	16689563
55	NC_010303	ATC	4	30788	30799	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	16689563
56	NC_010303	GCC	4	31342	31352	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	16689563
57	NC_010303	ATTCT	3	31830	31844	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	16689563
58	NC_010303	TA	6	32475	32485	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16689563
59	NC_010303	G	15	33436	33450	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	16689563
60	NC_010303	GCG	4	34940	34950	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	16689563
61	NC_010303	CTATT	3	35382	35396	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	16689563
62	NC_010303	CGAG	3	36543	36554	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	16689563
63	NC_010303	TGAG	3	36799	36810	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	16689563
64	NC_010303	TGGC	3	36913	36924	12	0 %	25 %	50 %	25 %	0 %	16689563
65	NC_010303	ATGCC	3	37514	37529	16	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	16689563
66	NC_010303	TTC	4	39987	39998	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	16689563
67	NC_010303	GAAT	3	40510	40521	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	16689563
68	NC_010303	CCCT	3	40525	40535	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	16689563
69	NC_010303	GGCAT	3	41958	41973	16	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	16689563
70	NC_010303	TATT	3	42604	42615	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	16689563
71	NC_010303	GAA	4	44377	44388	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	16689563
72	NC_010303	ATA	4	44745	44756	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	16689563
73	NC_010303	TTTC	3	45057	45067	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	16689563
74	NC_010303	G	15	45210	45224	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	16689563
75	NC_010303	G	12	46383	46394	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	16689563
76	NC_010303	AAG	4	46495	46505	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	16689563
77	NC_010303	TTCT	3	47905	47915	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	16689563
78	NC_010303	CGA	4	48499	48510	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	16689563
79	NC_010303	ACTT	3	51048	51059	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16689563
80	NC_010303	AG	6	52288	52299	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	16689563
81	NC_010303	GC	6	52449	52459	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	16689563
82	NC_010303	TA	10	54170	54188	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	16689563
83	NC_010303	CTT	4	55102	55114	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	16689563
84	NC_010303	ATA	4	56682	56694	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	16689563
85	NC_010303	AAGT	3	60114	60125	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	16689563
86	NC_010303	AAGA	3	63398	63410	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	16689563
87	NC_010303	CCGGG	3	64102	64117	16	0 %	0 %	60 %	40 %	6 %	16689563
88	NC_010303	AT	7	64499	64511	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	16689563
89	NC_010303	GAA	4	67748	67759	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	16689563
90	NC_010303	TCT	4	68531	68542	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	16689563
91	NC_010303	TGGGG	3	70103	70118	16	0 %	20 %	80 %	0 %	6 %	16689563
92	NC_010303	GAA	4	70217	70228	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	16689563
93	NC_010303	TGAA	3	72010	72020	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16689563
94	NC_010303	CCCA	3	72155	72166	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	16689563
95	NC_010303	TGCCC	3	74238	74252	15	0 %	20 %	20 %	60 %	6 %	16689563
96	NC_010303	CCTA	4	74782	74797	16	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	16689563
97	NC_010303	CTG	4	74822	74833	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	16689563
98	NC_010303	ATTG	3	75125	75136	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	16689563
99	NC_010303	GGGC	3	75328	75340	13	0 %	0 %	75 %	25 %	7 %	16689563
100	NC_010303	CTTCG	3	76201	76215	15	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	16689563
101	NC_010303	TGC	4	76466	76476	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	16689563
102	NC_010303	AAAAG	3	79322	79336	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	16689563
103	NC_010303	AG	6	80249	80260	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	16689563
104	NC_010303	AGGT	3	82897	82908	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	16689563
105	NC_010303	CTCG	3	83598	83609	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	16689563
106	NC_010303	TTCA	3	83854	83865	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16689563
107	NC_010303	CT	6	85047	85058	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	16689563
108	NC_010303	CGG	4	85880	85891	12	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	16689563
109	NC_010303	ATG	4	86121	86133	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	16689563
110	NC_010303	AATAG	3	86558	86572	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	16689563
111	NC_010303	TTGA	3	87496	87507	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	16689563
112	NC_010303	GCT	4	87673	87684	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	16689563
113	NC_010303	TA	6	88751	88762	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	16689563
114	NC_010303	GCGG	3	90438	90448	11	0 %	0 %	75 %	25 %	9 %	16689563
115	NC_010303	CCTATT	3	91271	91288	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	16689563
116	NC_010303	AT	6	93272	93282	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16689563
117	NC_010303	CTAT	3	93453	93463	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	16689563
118	NC_010303	CTAT	3	93506	93516	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	16689563
119	NC_010303	GCTATT	3	93878	93894	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
120	NC_010303	GCTATT	3	94027	94043	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
121	NC_010303	CTAT	3	94252	94262	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	16689563
122	NC_010303	GCTATT	3	94411	94427	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
123	NC_010303	GCTATT	3	94468	94484	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	16689563
124	NC_010303	AAGAG	3	95031	95045	15	60 %	0 %	40 %	0 %	6 %	16689563
125	NC_010303	GAA	5	97450	97463	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	16689563
126	NC_010303	GCCA	3	97811	97821	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	16689563
127	NC_010303	GGCCGG	3	101793	101811	19	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	5 %	16689563
128	NC_010303	G	14	101864	101877	14	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	16689563
129	NC_010303	TTG	4	103145	103156	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16689563
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137	NC_010303	GAAA	3	108760	108770	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	16689563
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140	NC_010303	TGTT	3	114825	114835	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	16689563
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237	NC_010303	CCGG	3	178452	178464	13	0 %	0 %	50 %	50 %	7 %	16689563
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239	NC_010303	CGGA	3	179639	179650	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	16689563
240	NC_010303	ATGCC	3	179858	179873	16	20 %	20 %	20 %	40 %	6 %	16689563
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243	NC_010303	C	13	182508	182520	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	16689563
244	NC_010303	TGAA	3	182528	182538	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16689563
245	NC_010303	TGAA	3	182590	182602	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	16689563
246	NC_010303	GA	6	183766	183776	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	16689563
247	NC_010303	CT	9	184597	184614	18	0 %	50 %	0 %	50 %	5 %	16689563
248	NC_010303	GAG	4	185350	185361	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	16689563
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250	NC_010303	GCC	4	187226	187236	11	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	9 %	16689563
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491	NC_010303	CAATA	4	362440	362459	20	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	16689564
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499	NC_010303	AATC	3	369215	369225	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	16689564
500	NC_010303	TACA	4	369431	369446	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	16689564
501	NC_010303	AATG	3	369827	369837	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16689564
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cycas taitungensis mitochondrion