ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mycosphaerella graminicola mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_010222	TTTC	3	834	844	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	16442212
2	NC_010222	TTAG	3	1580	1592	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	16442212
3	NC_010222	AAGA	3	1936	1947	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	16442212
4	NC_010222	TAAA	3	2065	2077	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	16442212
5	NC_010222	TAAT	3	2543	2555	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	16442212
6	NC_010222	TTAGT	3	3443	3457	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	16442212
7	NC_010222	A	14	3485	3498	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010222	TA	6	3619	3629	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_010222	TAAA	3	3928	3938	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_010222	TAT	5	5292	5306	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	16442212
11	NC_010222	A	12	6743	6754	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010222	T	12	7021	7032	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_010222	ATT	4	7087	7098	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_010222	TA	6	7484	7495	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_010222	AT	6	7744	7754	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_010222	AGA	4	7870	7880	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_010222	AAC	4	8334	8345	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_010222	AG	6	8438	8449	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_010222	TTTA	3	10028	10039	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_010222	T	15	10265	10279	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_010222	GTAT	3	10741	10751	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_010222	T	13	10913	10925	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	16442212
23	NC_010222	TAT	4	11439	11450	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	16442212
24	NC_010222	TAT	4	13561	13572	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	16442212
25	NC_010222	AT	6	13675	13685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	16442213
26	NC_010222	TTAG	3	13892	13904	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_010222	T	17	14777	14793	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_010222	GTTA	3	14805	14815	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_010222	TCAA	3	15618	15628	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	16442213
30	NC_010222	TAGT	3	16382	16393	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_010222	GTAT	4	16510	16525	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_010222	T	13	16544	16556	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_010222	TA	6	16577	16588	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_010222	AGTAG	3	16652	16666	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
35	NC_010222	T	14	16683	16696	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_010222	ATTT	3	17417	17427	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	16442213
37	NC_010222	ATTT	3	17585	17595	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_010222	A	12	17684	17695	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_010222	AGT	4	18420	18431	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	16442213
40	NC_010222	TA	6	18921	18934	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	16442213
41	NC_010222	CATA	3	19221	19232	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	16442213
42	NC_010222	ATT	4	19882	19893	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	16442213
43	NC_010222	TAA	4	20589	20600	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	16442213
44	NC_010222	AGAT	3	21549	21559	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16442213
45	NC_010222	TCAC	3	21889	21901	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	16442213
46	NC_010222	TAA	4	22826	22838	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	16442213
47	NC_010222	AAT	4	22941	22951	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_010222	ATTTT	3	22954	22968	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010222	T	14	23091	23104	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010222	AAT	4	23105	23116	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_010222	TAA	4	23680	23690	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_010222	T	24	23692	23715	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_010222	AT	6	24309	24319	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_010222	TAA	4	24625	24636	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_010222	GTA	4	24694	24704	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_010222	T	16	24776	24791	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_010222	CTTTT	3	24793	24807	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
58	NC_010222	TCG	4	25571	25582	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	16442214
59	NC_010222	ATTAAT	3	25700	25717	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	16442214
60	NC_010222	TTTA	3	26200	26211	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010222	ATT	4	26497	26508	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_010222	AT	6	26785	26795	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_010222	AAAG	3	27889	27899	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	16442214
64	NC_010222	T	16	28283	28298	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010222	ATA	4	28439	28450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	16442214
66	NC_010222	ATT	4	28688	28699	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	16442214
67	NC_010222	T	15	29584	29598	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_010222	AATT	3	30021	30032	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_010222	T	16	31333	31348	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010222	ATTAA	3	31351	31365	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	16442214
71	NC_010222	ATT	4	32423	32434	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	16442214
72	NC_010222	A	14	32806	32819	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_010222	CTA	5	33734	33747	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	16442214
74	NC_010222	AAT	4	34408	34419	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_010222	AAGA	3	35014	35024	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_010222	AAAT	6	35207	35230	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_010222	A	13	35227	35239	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_010222	ATTTA	5	35378	35402	25	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_010222	GTAG	3	35405	35416	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_010222	AGT	4	35418	35428	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_010222	ATA	4	35775	35785	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_010222	TCTT	3	35786	35797	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_010222	AATAT	3	35948	35967	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_010222	ATT	4	36348	36359	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	16442214
85	NC_010222	A	23	36739	36761	23	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_010222	A	14	37051	37064	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010222	AATT	5	37696	37714	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
88	NC_010222	AAT	4	37923	37934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_010222	GAGAAA	6	37965	38000	36	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_010222	AT	6	38074	38085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_010222	AAGT	3	38900	38911	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_010222	AT	6	41015	41025	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_010222	CGTT	3	41169	41181	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
94	NC_010222	TAAT	3	41637	41648	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010222	AGG	4	41831	41842	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_010222	TA	6	41848	41858	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_010222	A	12	41884	41895	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010222	TAT	4	42644	42654	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_010222	ATAAG	3	42738	42752	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_010222	ATAATG	3	42933	42950	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding

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