Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Cuscuta obtusiflora chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_009949AT6131813281150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
2NC_009949ATTT3155815691225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
3NC_009949CGAT3175517651125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
4NC_009949ATTT3178417961325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_009949AAAT3184918601275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
6NC_009949ATT4200220131233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_009949TAAT4214421591650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
8NC_009949TTA4228122921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_009949ATTT3353535451125 %75 %0 %0 %9 %159106785
10NC_009949T1449794992140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_009949T1451945207140 %100 %0 %0 %0 %159106786
12NC_009949TA7803080431450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_009949CTTA3997899881125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
14NC_009949GAAA310347103581275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
15NC_009949GAAA312348123591275 %0 %25 %0 %8 %159106793
16NC_009949TTA412388123991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %159106793
17NC_009949GC61267312683110 %0 %50 %50 %9 %159106793
18NC_009949AG613422134321150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
19NC_009949TTC41357513586120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
20NC_009949TCG41383213843120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
21NC_009949TAAA313849138591175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_009949A14142651427814100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
23NC_009949AATA315772157821175 %25 %0 %0 %9 %159106796
24NC_009949TAT421201212111133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_009949TATT421551215671725 %75 %0 %0 %5 %Non-Coding
26NC_009949T142463424647140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_009949TGCA325772257841325 %25 %25 %25 %7 %159106802
28NC_009949AAC427724277351266.67 %0 %0 %33.33 %8 %159106803
29NC_009949GAA428263282741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %159106803
30NC_009949TAT428664286751233.33 %66.67 %0 %0 %8 %159106803
31NC_009949AATA329903299141275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_009949T132997529987130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_009949GATTC329993300061420 %40 %20 %20 %7 %Non-Coding
34NC_009949ATTT330794308041125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_009949ATTA332153321631150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_009949AATG332971329811150 %25 %25 %0 %9 %159106810
37NC_009949TA633541335511150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
38NC_009949TATT333916339271225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
39NC_009949A16341513416616100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
40NC_009949TAAA335055350651175 %25 %0 %0 %9 %159106815
41NC_009949TAT435694357041133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
42NC_009949ACA435888358991266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
43NC_009949ACA436591366021266.67 %0 %0 %33.33 %8 %159106817
44NC_009949T123713237143120 %100 %0 %0 %0 %159106817
45NC_009949A15375633757715100 %0 %0 %0 %6 %159106817
46NC_009949ATTG337848378591225 %50 %25 %0 %8 %159106817
47NC_009949TA637973379831150 %50 %0 %0 %9 %159106817
48NC_009949T153800438018150 %100 %0 %0 %6 %159106817
49NC_009949ATAAA338367383811580 %20 %0 %0 %6 %159106817
50NC_009949GCTGG33871238725140 %20 %60 %20 %7 %159106817
51NC_009949TATT339041390521225 %75 %0 %0 %8 %159106817
52NC_009949CTT44000240012110 %66.67 %0 %33.33 %9 %159106817
53NC_009949AAAT340353403651375 %25 %0 %0 %7 %159106817
54NC_009949AATC341309413191150 %25 %0 %25 %9 %159106817
55NC_009949A13414044141613100 %0 %0 %0 %0 %159106817
56NC_009949AAT441503415141266.67 %33.33 %0 %0 %8 %159106817
57NC_009949TAAA343921439321275 %25 %0 %0 %0 %159106817
58NC_009949A12442194423012100 %0 %0 %0 %0 %159106817
59NC_009949TA644233442431150 %50 %0 %0 %9 %159106817
60NC_009949T204499745016200 %100 %0 %0 %5 %159106817
61NC_009949AAAAG345290453041580 %0 %20 %0 %6 %159106817
62NC_009949TA645842458521150 %50 %0 %0 %9 %159106817
63NC_009949AAAG346387463971175 %0 %25 %0 %9 %159106817
64NC_009949TATTT346451464651520 %80 %0 %0 %0 %159106817
65NC_009949TTGA346867468771125 %50 %25 %0 %9 %159106817
66NC_009949TTTA346978469891225 %75 %0 %0 %0 %159106817
67NC_009949TTA448934489461333.33 %66.67 %0 %0 %7 %159106817
68NC_009949TTAA349296493071250 %50 %0 %0 %8 %159106817
69NC_009949TAAA350601506111175 %25 %0 %0 %9 %159106817
70NC_009949TAG450886508971233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %159106817
71NC_009949CAA451416514271266.67 %0 %0 %33.33 %8 %159106817
72NC_009949AAAT353480534911275 %25 %0 %0 %8 %159106817
73NC_009949T135697756989130 %100 %0 %0 %7 %159106817
74NC_009949TAG459755597651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %159106840
75NC_009949ACAA360854608651275 %0 %0 %25 %8 %159106840
76NC_009949GAGG361376613871225 %0 %75 %0 %8 %159106840
77NC_009949AGGT361582615931225 %25 %50 %0 %8 %159106840
78NC_009949TAAG362707627171150 %25 %25 %0 %9 %159106840
79NC_009949AAAT363452634621175 %25 %0 %0 %9 %159106840
80NC_009949GAT464981649921233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %159106840
81NC_009949A12653406535112100 %0 %0 %0 %0 %159106840
82NC_009949TTTG36583465844110 %75 %25 %0 %9 %159106840
83NC_009949AAAG365968659781175 %0 %25 %0 %9 %159106840
84NC_009949A12669086691912100 %0 %0 %0 %0 %159106840
85NC_009949A14681826819514100 %0 %0 %0 %0 %159106840
86NC_009949ATTT368283682931125 %75 %0 %0 %9 %159106840
87NC_009949AAAGT369004690171460 %20 %20 %0 %7 %159106840
88NC_009949ATT469051690611133.33 %66.67 %0 %0 %9 %159106840
89NC_009949ATTT369407694171125 %75 %0 %0 %9 %159106840
90NC_009949TAT469485694951133.33 %66.67 %0 %0 %9 %159106840
91NC_009949TAAA369751697621275 %25 %0 %0 %8 %159106840
92NC_009949CAT469940699511233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %159106840
93NC_009949ATAA370379703891175 %25 %0 %0 %9 %159106840
94NC_009949TTAA370666706761150 %50 %0 %0 %9 %159106840
95NC_009949AAAAT370740707531480 %20 %0 %0 %7 %159106840
96NC_009949AAT470934709451266.67 %33.33 %0 %0 %8 %159106840
97NC_009949ATTT372032720421125 %75 %0 %0 %9 %159106840
98NC_009949CTTA372777727871125 %50 %0 %25 %9 %159106840
99NC_009949CTA475729757391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %159106840
100NC_009949AGAT380237802481250 %25 %25 %0 %8 %159106842
101NC_009949A12842928430312100 %0 %0 %0 %8 %159106842
102NC_009949ACT484596846071233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %159106842