ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Stigeoclonium helveticum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008372	ATTT	3	8703	8714	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008372	ATTT	3	8866	8877	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008372	ATTT	3	9482	9493	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008372	ATCA	3	10474	10485	12	50 %	25 %	0 %	25 %	115350009
5	NC_008372	ATTT	4	16759	16774	16	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008372	ATTT	3	18828	18839	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008372	ATTT	3	21663	21674	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350029
8	NC_008372	TTTCT	3	21787	21801	15	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008372	ATA	5	23453	23467	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115350026
10	NC_008372	A	12	27131	27142	12	100 %	0 %	0 %	0 %	115350026
11	NC_008372	ATTT	3	28256	28267	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
12	NC_008372	ATTT	3	28315	28326	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
13	NC_008372	ATTT	3	29160	29171	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
14	NC_008372	A	13	30040	30052	13	100 %	0 %	0 %	0 %	115350026
15	NC_008372	ATT	5	34849	34863	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115350026
16	NC_008372	TTAT	3	37803	37814	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
17	NC_008372	AAAT	3	41730	41741	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
18	NC_008372	AAAT	3	41941	41952	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
19	NC_008372	AAAT	3	43582	43593	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
20	NC_008372	AAAT	3	44136	44147	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
21	NC_008372	ATTT	3	46531	46542	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
22	NC_008372	TTA	4	48449	48460	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115350026
23	NC_008372	AAAT	3	49870	49881	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
24	NC_008372	AGAAA	3	52136	52150	15	80 %	0 %	20 %	0 %	115350026
25	NC_008372	AAAT	3	52263	52274	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
26	NC_008372	ATA	4	54345	54356	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115350026
27	NC_008372	AAAT	3	55109	55120	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
28	NC_008372	TAT	4	55672	55683	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115350026
29	NC_008372	TTTAA	3	57503	57517	15	40 %	60 %	0 %	0 %	115350026
30	NC_008372	AAAT	3	58801	58812	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
31	NC_008372	AAAT	3	59033	59044	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
32	NC_008372	ATTT	3	62125	62136	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
33	NC_008372	AAAT	3	62178	62189	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
34	NC_008372	TCT	4	72965	72976	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350026
35	NC_008372	AAAT	3	75254	75265	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
36	NC_008372	AAAT	3	87532	87543	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
37	NC_008372	T	12	87701	87712	12	0 %	100 %	0 %	0 %	115350026
38	NC_008372	AAAT	3	90434	90445	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
39	NC_008372	AAAT	3	90605	90616	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
40	NC_008372	AAAT	3	93090	93101	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
41	NC_008372	AAAT	3	93149	93160	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
42	NC_008372	AAAT	3	93334	93345	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
43	NC_008372	TTTTA	3	96733	96747	15	20 %	80 %	0 %	0 %	115350026
44	NC_008372	AAAT	3	97341	97352	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
45	NC_008372	AAAT	3	98161	98172	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
46	NC_008372	T	12	102902	102913	12	0 %	100 %	0 %	0 %	115350026
47	NC_008372	AATT	3	109647	109658	12	50 %	50 %	0 %	0 %	115350026
48	NC_008372	ATTT	3	117952	117963	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
49	NC_008372	ATTT	3	118011	118022	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
50	NC_008372	ATTT	3	118130	118141	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
51	NC_008372	AAAT	3	118377	118388	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
52	NC_008372	AAAT	3	118541	118552	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
53	NC_008372	ATTT	3	123632	123643	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
54	NC_008372	AAAT	3	124834	124845	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
55	NC_008372	AAAT	3	124982	124993	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
56	NC_008372	ATTT	3	125934	125945	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
57	NC_008372	TTA	4	132210	132221	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115350026
58	NC_008372	TAA	4	132220	132231	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115350026
59	NC_008372	AAAT	3	132256	132267	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
60	NC_008372	T	12	135068	135079	12	0 %	100 %	0 %	0 %	115350026
61	NC_008372	AAAT	3	142171	142182	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
62	NC_008372	AAAT	3	143059	143070	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
63	NC_008372	T	13	145921	145933	13	0 %	100 %	0 %	0 %	115350026
64	NC_008372	A	13	147232	147244	13	100 %	0 %	0 %	0 %	115350026
65	NC_008372	ATTT	3	149599	149610	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
66	NC_008372	AAAT	3	149828	149839	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
67	NC_008372	ATTT	3	149976	149987	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
68	NC_008372	TGAA	3	150624	150635	12	50 %	25 %	25 %	0 %	115350026
69	NC_008372	TCT	4	150717	150728	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115350026
70	NC_008372	TTCT	3	152346	152357	12	0 %	75 %	0 %	25 %	115350026
71	NC_008372	ATTT	3	158535	158546	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
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78	NC_008372	AAAT	3	165299	165310	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
79	NC_008372	ATTT	3	171635	171646	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
80	NC_008372	AAAT	3	171864	171875	12	75 %	25 %	0 %	0 %	115350026
81	NC_008372	ATTT	3	172329	172340	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
82	NC_008372	ATTT	3	177496	177507	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
83	NC_008372	A	12	180626	180637	12	100 %	0 %	0 %	0 %	115350026
84	NC_008372	A	13	181574	181586	13	100 %	0 %	0 %	0 %	115350026
85	NC_008372	ATTT	3	183859	183870	12	25 %	75 %	0 %	0 %	115350026
86	NC_008372	AAT	5	188183	188197	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115350026
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88	NC_008372	ATTT	3	193357	193368	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008372	TTTC	3	194244	194255	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008372	TTTCT	3	196438	196452	15	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008372	T	12	199345	199356	12	0 %	100 %	0 %	0 %	115349985
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94	NC_008372	AAAG	3	204775	204786	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008372	AAAT	3	205734	205745	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008372	ATTT	3	206152	206163	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008372	ATTT	3	206383	206394	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008372	AAAT	3	207469	207480	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008372	TAAA	3	208685	208696	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008372	ATTT	3	209132	209143	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008372	ATTT	3	209191	209202	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008372	ATTT	3	209376	209387	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008372	ATTT	3	209435	209446	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008372	ATTT	3	209620	209631	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008372	ATTT	3	209679	209690	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008372	ATTT	3	209864	209875	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008372	ATTT	3	209923	209934	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008372	ATTT	3	215385	215396	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008372	AAATA	3	217557	217571	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008372	TATT	3	218394	218405	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008372	ATAA	5	219115	219134	20	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008372	AAAT	3	219157	219168	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008372	AAAT	3	219193	219204	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008372	AAAT	3	219357	219368	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008372	AGAAA	3	219533	219547	15	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008372	T	12	220415	220426	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Stigeoclonium helveticum chloroplast