ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetrahymena paravorax mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008338	TTTA	3	63	74	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008338	AT	18	81	114	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008338	ATA	5	199	213	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_008338	TA	9	283	299	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_008338	AAATAT	3	305	323	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_008338	TATT	3	478	488	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008338	ATT	4	500	511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_008338	AAT	4	533	544	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_008338	AT	7	547	560	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_008338	AAAT	4	821	836	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_008338	CTAT	3	1685	1696	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
12	NC_008338	TAATTT	3	1709	1726	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_008338	ATAG	3	1804	1814	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_008338	CAG	4	1900	1910	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
15	NC_008338	CT	6	2114	2124	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_008338	TTTA	3	2274	2285	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_008338	TAT	7	2601	2621	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_008338	ATTAAT	3	2691	2707	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_008338	TAT	4	2717	2729	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_008338	TAT	4	2880	2890	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_008338	AAAAAT	3	3405	3423	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_008338	AATT	3	3441	3451	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_008338	ATT	5	3605	3618	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432985
24	NC_008338	TTTTAT	3	3840	3857	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11432985
25	NC_008338	ATTC	4	4067	4082	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	11432985
26	NC_008338	TAAA	3	4671	4682	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11432985
27	NC_008338	TAAA	3	4916	4926	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432985
28	NC_008338	TAAA	3	5194	5205	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008338	TTAA	3	5311	5323	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_008338	TTTA	3	5666	5676	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432986
31	NC_008338	TTTTAA	3	5729	5745	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11432986
32	NC_008338	TTTAT	4	5990	6009	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	11432986
33	NC_008338	T	12	6059	6070	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11432986
34	NC_008338	T	14	6215	6228	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11432986
35	NC_008338	T	12	6323	6334	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432986
36	NC_008338	T	12	6381	6392	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432986
37	NC_008338	ATA	5	6455	6470	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432986
38	NC_008338	TAAA	3	6511	6521	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432986
39	NC_008338	ATTTTT	3	6563	6580	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11432986
40	NC_008338	T	14	6570	6583	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432986
41	NC_008338	AAATTA	3	6618	6636	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11432986
42	NC_008338	T	16	6650	6665	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432986
43	NC_008338	T	14	6690	6703	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432986
44	NC_008338	T	15	6848	6862	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432986
45	NC_008338	A	12	7214	7225	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11432986
46	NC_008338	ATTT	3	8011	8021	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432986
47	NC_008338	TA	7	8046	8059	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432986
48	NC_008338	ATTT	3	8207	8218	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432986
49	NC_008338	TTTTA	3	8477	8490	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11432986
50	NC_008338	ATAA	3	9029	9040	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11432986
51	NC_008338	ATT	5	9319	9333	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432986
52	NC_008338	A	16	9481	9496	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_008338	T	15	10030	10044	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11432986
54	NC_008338	CAC	4	10156	10167	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432986
55	NC_008338	ATA	5	10667	10680	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432986
56	NC_008338	TAAA	3	10945	10956	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11432986
57	NC_008338	TATG	3	11225	11236	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11432986
58	NC_008338	ATT	4	11745	11756	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432986
59	NC_008338	AAT	4	11906	11916	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432986
60	NC_008338	A	16	12321	12336	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	11432987
61	NC_008338	TTTA	3	12445	12456	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432987
62	NC_008338	ATA	6	12676	12692	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11432987
63	NC_008338	TAA	4	12704	12715	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432987
64	NC_008338	AATT	3	12823	12834	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432987
65	NC_008338	ATT	4	12999	13009	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
66	NC_008338	ACC	4	13290	13301	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11432987
67	NC_008338	TTA	4	13759	13770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11432987
68	NC_008338	AT	7	14292	14304	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432987
69	NC_008338	TAA	4	14403	14413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432987
70	NC_008338	ATTTTT	3	14474	14491	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11432987
71	NC_008338	TAT	4	14554	14564	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
72	NC_008338	TTAA	3	15032	15043	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	11432987
73	NC_008338	TAAC	3	15255	15265	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11432987
74	NC_008338	ATT	4	15690	15701	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432987
75	NC_008338	TAA	4	15708	15720	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432987
76	NC_008338	TAT	4	16025	16035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
77	NC_008338	TTTAA	4	16039	16057	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	11432987
78	NC_008338	ATTTT	3	16080	16093	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11432987
79	NC_008338	TTAA	3	16144	16154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432987
80	NC_008338	AAAAT	3	16348	16361	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11432987
81	NC_008338	TAAA	3	16364	16374	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11432987
82	NC_008338	ATA	4	16479	16491	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432987
83	NC_008338	TAT	4	16708	16719	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432987
84	NC_008338	TAAAAA	3	17008	17026	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	11432987
85	NC_008338	TAT	4	17287	17297	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432987
86	NC_008338	AT	7	17396	17408	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432987
87	NC_008338	T	15	18231	18245	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11432988
88	NC_008338	TTTTA	3	18460	18474	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11432988
89	NC_008338	AAAT	6	18514	18537	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432988
90	NC_008338	ATTT	3	18603	18613	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432988
91	NC_008338	AT	6	18766	18776	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432988
92	NC_008338	ATA	7	18833	18853	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11432988
93	NC_008338	TAAA	3	18855	18866	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432988
94	NC_008338	TAT	4	18918	18930	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11432988
95	NC_008338	ATAA	5	18952	18971	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	11432988
96	NC_008338	ATAA	6	18979	19003	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432988
97	NC_008338	AT	8	19099	19114	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432988
98	NC_008338	AT	8	19119	19134	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432988
99	NC_008338	TAAA	3	19308	19319	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432988
100	NC_008338	AAT	4	19390	19402	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432988
101	NC_008338	AAT	4	19498	19509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
102	NC_008338	TA	6	19597	19608	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432988
103	NC_008338	TAA	7	19704	19723	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	11432988
104	NC_008338	TTAAT	3	19778	19791	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11432988
105	NC_008338	TAAA	3	20632	20643	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432988
106	NC_008338	ATAA	3	20698	20709	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11432988
107	NC_008338	TA	6	20988	20998	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432988
108	NC_008338	TTAATT	3	21034	21052	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	11432988
109	NC_008338	AACT	3	21182	21192	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11432988
110	NC_008338	AT	7	21303	21316	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432988
111	NC_008338	ATA	4	21437	21448	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
112	NC_008338	ATTA	3	21593	21604	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008338	ATA	5	21910	21923	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432988
114	NC_008338	AAT	5	22270	22284	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432988
115	NC_008338	AATTTT	3	22514	22532	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	11432988
116	NC_008338	TAT	4	22867	22877	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432988
117	NC_008338	T	13	23098	23110	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11432988
118	NC_008338	AAT	4	23530	23541	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
119	NC_008338	TA	9	24400	24416	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11432988
120	NC_008338	T	12	24515	24526	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11432988
121	NC_008338	ATA	4	24591	24602	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
122	NC_008338	TTAT	3	24603	24613	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432988
123	NC_008338	TATT	4	24732	24748	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	11432988
124	NC_008338	AATTTT	3	24750	24768	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	11432988
125	NC_008338	AT	6	24807	24817	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432988
126	NC_008338	ATT	4	24896	24907	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
127	NC_008338	TTATAT	3	24970	24986	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11432988
128	NC_008338	TTAA	3	25053	25063	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432988
129	NC_008338	T	13	25090	25102	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11432988
130	NC_008338	T	25	25132	25156	25	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11432988
131	NC_008338	ATTT	3	25159	25169	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432988
132	NC_008338	TTTA	3	25184	25194	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432988
133	NC_008338	TAT	4	25246	25257	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
134	NC_008338	AAT	4	25319	25331	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11432988
135	NC_008338	TAT	5	25415	25429	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432988
136	NC_008338	ATA	5	25495	25509	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11432988
137	NC_008338	TTA	4	25540	25550	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432988
138	NC_008338	TA	6	25619	25629	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432988
139	NC_008338	ATT	4	25634	25645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
140	NC_008338	ATT	4	25670	25680	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432988
141	NC_008338	TA	7	25696	25708	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432988
142	NC_008338	TAT	5	25729	25744	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11432988
143	NC_008338	TA	7	25750	25762	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432988
144	NC_008338	AT	6	25768	25778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432988
145	NC_008338	AT	13	25782	25808	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432988
146	NC_008338	AT	8	25813	25827	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432988
147	NC_008338	AT	9	25830	25847	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11432988
148	NC_008338	TTAT	4	25848	25863	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11432988
149	NC_008338	AT	7	25876	25890	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432988
150	NC_008338	AT	8	25897	25911	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11432988
151	NC_008338	AAAT	3	25912	25923	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11432988
152	NC_008338	TTTA	3	25949	25959	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11432988
153	NC_008338	AATT	3	25967	25979	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11432988
154	NC_008338	AATT	3	26192	26203	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432988
155	NC_008338	TAAAT	3	26448	26462	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	11432988
156	NC_008338	ATTT	3	26592	26603	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432988
157	NC_008338	AAAAT	3	26952	26966	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
158	NC_008338	AGA	5	27231	27244	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11432988
159	NC_008338	ATTA	3	27935	27946	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432988
160	NC_008338	TTTTA	3	27950	27964	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11432988
161	NC_008338	AAT	4	27996	28007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432988
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163	NC_008338	ATT	4	28513	28524	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
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165	NC_008338	ATT	4	28778	28789	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
166	NC_008338	TTA	4	28853	28864	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
167	NC_008338	TGATTT	3	28962	28980	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	10 %	11432988
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169	NC_008338	TTAA	3	29346	29357	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11432988
170	NC_008338	T	12	29506	29517	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11432988
171	NC_008338	TA	6	30074	30084	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432988
172	NC_008338	TTA	4	30382	30393	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432988
173	NC_008338	TTTAT	3	30538	30552	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11432988
174	NC_008338	GTTAGA	3	30935	30952	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	11432989
175	NC_008338	ATTT	3	31275	31286	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11432989
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177	NC_008338	ATA	7	31371	31391	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	11432989
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181	NC_008338	AT	6	31806	31816	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11432989
182	NC_008338	AATTT	3	32514	32527	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
183	NC_008338	CTAA	3	32606	32616	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
184	NC_008338	AATAT	3	34021	34035	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
185	NC_008338	ATT	4	34341	34351	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11432989
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190	NC_008338	TAA	4	35074	35085	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11432989
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209	NC_008338	TAAA	3	38495	38507	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11432989
210	NC_008338	TATTT	3	38529	38542	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11432989
211	NC_008338	TTCT	3	38576	38586	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11432989
212	NC_008338	TAT	4	39588	39599	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11432989
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214	NC_008338	T	13	39805	39817	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11432989
215	NC_008338	GCA	4	40315	40326	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11432989
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226	NC_008338	CAAT	3	44267	44278	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11432990
227	NC_008338	TTTA	3	44675	44686	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
228	NC_008338	ATA	5	44909	44922	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
229	NC_008338	ATTAT	3	44981	44995	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
230	NC_008338	ATA	4	45068	45080	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
231	NC_008338	ATTAAT	3	45090	45106	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
232	NC_008338	ATA	7	45176	45196	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
233	NC_008338	AG	6	45673	45683	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
234	NC_008338	ATTT	4	46961	46976	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
235	NC_008338	ATTT	3	47142	47153	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
236	NC_008338	ATT	4	47323	47333	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
237	NC_008338	TTTAAT	3	47404	47422	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
238	NC_008338	TAAA	3	47423	47438	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetrahymena paravorax mitochondrion