ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Zea perennis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008331	ATG	4	1997	2008	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415156
2	NC_008331	CAAG	3	7446	7457	12	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008331	T	13	8988	9000	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008331	CTTG	3	15511	15522	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415157
5	NC_008331	TAAGTG	3	18292	18309	18	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415157
6	NC_008331	TTGC	3	18323	18334	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415157
7	NC_008331	TAC	4	26518	26529	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11415157
8	NC_008331	AGT	10	33030	33059	30	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415157
9	NC_008331	TCT	4	35595	35606	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415157
10	NC_008331	TTTC	4	37256	37271	16	0 %	75 %	0 %	25 %	11415157
11	NC_008331	CCAGAA	3	38484	38501	18	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	11415157
12	NC_008331	CTTTA	19	38826	38920	95	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
13	NC_008331	AT	6	41356	41367	12	50 %	50 %	0 %	0 %	11415157
14	NC_008331	AGT	4	44147	44158	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415157
15	NC_008331	GTATA	3	47454	47468	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
16	NC_008331	AAAGCT	3	48678	48695	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	11415157
17	NC_008331	ATAGT	3	51768	51782	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
18	NC_008331	TGGAA	3	54911	54925	15	40 %	20 %	40 %	0 %	11415157
19	NC_008331	AGGC	3	56900	56911	12	25 %	0 %	50 %	25 %	11415157
20	NC_008331	GCGTA	3	58239	58253	15	20 %	20 %	40 %	20 %	11415157
21	NC_008331	CTAGG	3	60012	60026	15	20 %	20 %	40 %	20 %	11415157
22	NC_008331	TACTT	3	61778	61792	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
23	NC_008331	CAAG	3	62476	62487	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415157
24	NC_008331	TTC	4	64487	64498	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415157
25	NC_008331	CTATA	4	67823	67842	20	40 %	40 %	0 %	20 %	11415157
26	NC_008331	TGCC	3	67874	67885	12	0 %	25 %	25 %	50 %	11415157
27	NC_008331	GAT	4	77004	77015	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415157
28	NC_008331	TTTGA	8	82692	82731	40	20 %	60 %	20 %	0 %	11415157
29	NC_008331	TTC	4	83436	83447	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415157
30	NC_008331	TATAG	3	89119	89133	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
31	NC_008331	ATTC	3	89535	89546	12	25 %	50 %	0 %	25 %	11415157
32	NC_008331	ATAGA	3	90473	90487	15	60 %	20 %	20 %	0 %	11415157
33	NC_008331	TAGA	3	94545	94556	12	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
34	NC_008331	TATAT	11	98883	98937	55	40 %	60 %	0 %	0 %	11415157
35	NC_008331	ATT	4	100078	100089	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11415157
36	NC_008331	TCTTTA	3	106085	106102	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415157
37	NC_008331	CTTT	3	109946	109957	12	0 %	75 %	0 %	25 %	11415157
38	NC_008331	TGGAT	3	111429	111443	15	20 %	40 %	40 %	0 %	11415157
39	NC_008331	ACTTAG	3	116457	116474	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415157
40	NC_008331	TATAGA	4	117344	117367	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	11415157
41	NC_008331	ACTTT	13	119072	119136	65	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
42	NC_008331	GAAA	3	119432	119443	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
43	NC_008331	TTGC	3	122357	122368	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415157
44	NC_008331	GGCC	3	123842	123853	12	0 %	0 %	50 %	50 %	11415157
45	NC_008331	AGTACT	6	124301	124336	36	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11415157
46	NC_008331	CCAC	3	125502	125513	12	25 %	0 %	0 %	75 %	11415157
47	NC_008331	TATTAC	5	125976	126005	30	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11415157
48	NC_008331	ATGGAA	8	126007	126054	48	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415157
49	NC_008331	TTAA	3	126482	126493	12	50 %	50 %	0 %	0 %	11415157
50	NC_008331	GTGA	3	128821	128832	12	25 %	25 %	50 %	0 %	11415157
51	NC_008331	AGGCAG	3	138258	138275	18	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	11415157
52	NC_008331	AAG	4	141072	141083	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415157
53	NC_008331	TCATA	3	141644	141658	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415157
54	NC_008331	GTC	4	142489	142500	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11415157
55	NC_008331	CT	6	143015	143026	12	0 %	50 %	0 %	50 %	11415157
56	NC_008331	GATAG	5	147056	147080	25	40 %	20 %	40 %	0 %	11415157
57	NC_008331	GTATA	3	152603	152617	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
58	NC_008331	ACCCA	17	153001	153085	85	40 %	0 %	0 %	60 %	11415157
59	NC_008331	GCCT	5	153595	153614	20	0 %	25 %	25 %	50 %	11415157
60	NC_008331	ACTAT	9	154799	154843	45	40 %	40 %	0 %	20 %	11415157
61	NC_008331	A	14	157689	157702	14	100 %	0 %	0 %	0 %	11415157
62	NC_008331	TCCAA	4	158588	158607	20	40 %	20 %	0 %	40 %	11415157
63	NC_008331	T	12	167966	167977	12	0 %	100 %	0 %	0 %	11415157
64	NC_008331	GAAAT	3	169518	169532	15	60 %	20 %	20 %	0 %	11415157
65	NC_008331	CTAC	4	170043	170058	16	25 %	25 %	0 %	50 %	11415157
66	NC_008331	TATGT	5	170215	170239	25	20 %	60 %	20 %	0 %	11415157
67	NC_008331	CTCA	3	172754	172765	12	25 %	25 %	0 %	50 %	11415157
68	NC_008331	AAAG	3	176815	176826	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
69	NC_008331	TTGAA	3	177488	177502	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
70	NC_008331	AAAG	3	188138	188149	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
71	NC_008331	GA	6	190172	190183	12	50 %	0 %	50 %	0 %	11415157
72	NC_008331	CTTG	3	191857	191868	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415157
73	NC_008331	TTACTT	3	192783	192800	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415157
74	NC_008331	TTTAC	3	193077	193091	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
75	NC_008331	CTAAC	4	200277	200296	20	40 %	20 %	0 %	40 %	11415157
76	NC_008331	TCCTT	7	203281	203315	35	0 %	60 %	0 %	40 %	11415157
77	NC_008331	TATGGT	5	204894	204923	30	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	11415157
78	NC_008331	TGCCAT	7	208440	208481	42	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	11415157
79	NC_008331	AGCC	3	209289	209300	12	25 %	0 %	25 %	50 %	11415157
80	NC_008331	AAGA	3	212341	212352	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
81	NC_008331	ATGGAA	3	213605	213622	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	11415157
82	NC_008331	ATACA	3	213866	213880	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415157
83	NC_008331	TACTA	7	214077	214111	35	40 %	40 %	0 %	20 %	11415157
84	NC_008331	CT	6	217842	217853	12	0 %	50 %	0 %	50 %	11415157
85	NC_008331	CCTAT	26	218199	218328	130	20 %	40 %	0 %	40 %	11415157
86	NC_008331	AGGA	3	219969	219980	12	50 %	0 %	50 %	0 %	11415157
87	NC_008331	ACTTT	3	228829	228843	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
88	NC_008331	GAA	4	234708	234719	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415157
89	NC_008331	TCAAA	8	235424	235463	40	60 %	20 %	0 %	20 %	11415157
90	NC_008331	ATC	4	241140	241151	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11415157
91	NC_008331	TACTT	6	249020	249049	30	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
92	NC_008331	ATAGT	6	249563	249592	30	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
93	NC_008331	ATAGT	3	249597	249611	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
94	NC_008331	ACAG	3	251797	251808	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415157
95	NC_008331	TCTA	4	253001	253016	16	25 %	50 %	0 %	25 %	11415157
96	NC_008331	ATGC	3	253168	253179	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415157
97	NC_008331	CTTT	3	256133	256144	12	0 %	75 %	0 %	25 %	11415157
98	NC_008331	ATCAA	3	259625	259639	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415157
99	NC_008331	GAAA	3	264404	264415	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
100	NC_008331	ACA	4	265556	265567	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11415157
101	NC_008331	TCT	4	267684	267695	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415157
102	NC_008331	GCAA	3	273386	273397	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415157
103	NC_008331	CTTA	3	277385	277396	12	25 %	50 %	0 %	25 %	11415157
104	NC_008331	TTGG	3	280816	280827	12	0 %	50 %	50 %	0 %	11415157
105	NC_008331	ACCTT	3	281189	281203	15	20 %	40 %	0 %	40 %	11415157
106	NC_008331	CCCCA	3	284551	284565	15	20 %	0 %	0 %	80 %	11415157
107	NC_008331	GATT	3	285656	285667	12	25 %	50 %	25 %	0 %	11415157
108	NC_008331	TGGGA	5	292536	292560	25	20 %	20 %	60 %	0 %	11415157
109	NC_008331	TCGC	3	303584	303595	12	0 %	25 %	25 %	50 %	11415157
110	NC_008331	TTTCA	3	305041	305055	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
111	NC_008331	TACTCA	3	308215	308232	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11415157
112	NC_008331	CTAAG	3	310710	310724	15	40 %	20 %	20 %	20 %	11415157
113	NC_008331	ACTAT	3	312038	312052	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415157
114	NC_008331	ATCTAA	3	312499	312516	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	11415157
115	NC_008331	ATACA	4	313256	313275	20	60 %	20 %	0 %	20 %	11415157
116	NC_008331	GGAT	3	315018	315029	12	25 %	25 %	50 %	0 %	11415157
117	NC_008331	GGCT	3	317859	317870	12	0 %	25 %	50 %	25 %	11415157
118	NC_008331	CTACA	3	323192	323206	15	40 %	20 %	0 %	40 %	11415157
119	NC_008331	AAAG	3	325399	325410	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
120	NC_008331	TTGGA	3	326394	326408	15	20 %	40 %	40 %	0 %	11415157
121	NC_008331	TGAG	3	328352	328363	12	25 %	25 %	50 %	0 %	11415157
122	NC_008331	TATAG	3	343601	343615	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
123	NC_008331	TAAA	3	345859	345870	12	75 %	25 %	0 %	0 %	11415157
124	NC_008331	AGT	4	346520	346531	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415157
125	NC_008331	CTTAAT	4	350160	350183	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	11415157
126	NC_008331	AGA	4	353585	353596	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11415157
127	NC_008331	CAGT	3	355694	355705	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415157
128	NC_008331	CTGT	3	356530	356541	12	0 %	50 %	25 %	25 %	11415157
129	NC_008331	TTAGT	3	357004	357018	15	20 %	60 %	20 %	0 %	11415157
130	NC_008331	ATG	4	357461	357472	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415157
131	NC_008331	CAAG	3	362910	362921	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415157
132	NC_008331	AATG	3	368079	368090	12	50 %	25 %	25 %	0 %	11415157
133	NC_008331	AGAA	3	369429	369440	12	75 %	0 %	25 %	0 %	11415157
134	NC_008331	CTGA	3	371787	371798	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415157
135	NC_008331	TAATA	3	375612	375626	15	60 %	40 %	0 %	0 %	11415157
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140	NC_008331	TCTT	3	391042	391053	12	0 %	75 %	0 %	25 %	11415157
141	NC_008331	AATGAA	3	391127	391144	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11415157
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143	NC_008331	TAAGT	3	394253	394267	15	40 %	40 %	20 %	0 %	11415157
144	NC_008331	GACT	3	401736	401747	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415157
145	NC_008331	CTAAT	3	402572	402586	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415157
146	NC_008331	TTAGT	4	410345	410364	20	20 %	60 %	20 %	0 %	11415157
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149	NC_008331	TATAG	3	413249	413263	15	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008331	TATAT	3	414065	414079	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008331	AACAA	4	419513	419532	20	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_008331	GGAT	3	421112	421123	12	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008331	GGCT	3	423953	423964	12	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_008331	CTACA	3	429286	429300	15	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_008331	AAAG	3	431493	431504	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008331	TCTTT	3	437719	437733	15	0 %	80 %	0 %	20 %	11415157
157	NC_008331	TTCTT	3	437764	437778	15	0 %	80 %	0 %	20 %	11415157
158	NC_008331	AG	6	438600	438611	12	50 %	0 %	50 %	0 %	11415157
159	NC_008331	GAGC	3	441310	441321	12	25 %	0 %	50 %	25 %	11415157
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161	NC_008331	TTCTA	3	450098	450112	15	20 %	60 %	0 %	20 %	11415157
162	NC_008331	TTCTAT	3	451696	451713	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415157
163	NC_008331	TAGCC	3	451990	452004	15	20 %	20 %	20 %	40 %	11415157
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165	NC_008331	TCTTAT	24	456309	456452	144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	11415157
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168	NC_008331	ATACA	3	469973	469987	15	60 %	20 %	0 %	20 %	11415157
169	NC_008331	TAGC	3	471154	471165	12	25 %	25 %	25 %	25 %	11415157
170	NC_008331	GCTG	3	471174	471185	12	0 %	25 %	50 %	25 %	11415157
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172	NC_008331	AACG	3	478658	478669	12	50 %	0 %	25 %	25 %	11415157
173	NC_008331	AACTT	3	480227	480241	15	40 %	40 %	0 %	20 %	11415157
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176	NC_008331	TGTT	3	492803	492814	12	0 %	75 %	25 %	0 %	11415157
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181	NC_008331	TAG	4	503740	503751	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11415157
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199	NC_008331	TTCCTT	3	538205	538222	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11415157
200	NC_008331	TGGT	3	538404	538415	12	0 %	50 %	50 %	0 %	11415157
201	NC_008331	AAGTA	4	538936	538955	20	60 %	20 %	20 %	0 %	11415157
202	NC_008331	GCCC	3	542619	542630	12	0 %	0 %	25 %	75 %	11415157
203	NC_008331	GAAAT	3	547652	547666	15	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
204	NC_008331	ATTTC	3	548380	548394	15	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
205	NC_008331	TAGAG	7	548401	548435	35	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
206	NC_008331	GAA	4	552618	552629	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
207	NC_008331	TCAAA	8	553334	553373	40	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
208	NC_008331	ATC	4	559050	559061	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
209	NC_008331	GTA	4	566911	566922	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Zea perennis mitochondrion