ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aspergillus oryzae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008282	AAT	4	18	29	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_008282	AATT	3	164	175	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_008282	AAT	4	177	189	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_008282	AATA	3	368	380	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_008282	ATA	6	570	586	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_008282	TA	6	1596	1606	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_008282	A	15	1713	1727	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_008282	T	18	1728	1745	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_008282	AGT	4	1914	1925	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_008282	GATAAT	3	2247	2264	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_008282	AATG	3	2562	2572	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_008282	AT	6	3147	3157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_008282	TA	6	3283	3296	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_008282	AT	6	3297	3308	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_008282	TA	8	3375	3389	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_008282	GTTT	3	3401	3412	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_008282	TA	6	3503	3514	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_008282	TTA	4	3715	3726	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_008282	ATC	4	4946	4957	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
20	NC_008282	T	19	5063	5081	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_008282	ATT	4	7133	7145	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_008282	TATT	3	7184	7195	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008282	TAT	4	7209	7220	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_008282	ATTT	3	7480	7490	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_008282	AGTA	3	7654	7665	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_008282	AGT	4	8793	8804	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_008282	TAA	4	8948	8959	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_008282	TAT	4	9015	9026	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008282	ACTT	3	9400	9411	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
30	NC_008282	AAGAA	3	9811	9824	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_008282	AATA	3	9962	9973	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_008282	AACAA	3	9975	9989	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
33	NC_008282	TTAA	3	10270	10280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_008282	TAT	4	10642	10654	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_008282	TAAT	3	10882	10892	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_008282	AATTA	3	11911	11925	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_008282	TTAA	3	11947	11959	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_008282	TAATTT	4	12231	12254	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_008282	TAT	4	12262	12273	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_008282	TA	6	12444	12455	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_008282	TTA	6	13332	13349	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_008282	ATA	5	13900	13913	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_008282	TAA	4	13926	13937	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_008282	AATTA	4	14043	14063	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_008282	A	14	14165	14178	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_008282	TAA	5	14340	14354	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_008282	ATT	4	14468	14480	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_008282	T	13	14706	14718	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_008282	TAA	5	14723	14737	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_008282	ATA	4	14973	14984	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_008282	T	18	15609	15626	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_008282	GA	6	16181	16191	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_008282	AT	6	16419	16431	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_008282	TAT	4	16721	16732	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_008282	T	19	16729	16747	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_008282	TAA	4	16819	16830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_008282	AT	12	16840	16861	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_008282	TTTC	3	17033	17044	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
59	NC_008282	TAT	5	17094	17108	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
60	NC_008282	TTATAA	3	17266	17283	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_008282	ATT	4	17399	17410	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_008282	ATA	4	17616	17627	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_008282	ATT	4	17809	17819	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_008282	TTA	4	18236	18247	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_008282	TTAA	3	18265	18277	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_008282	ATA	4	18491	18501	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_008282	TTTA	3	19143	19154	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_008282	ATT	4	19814	19825	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_008282	AATT	4	20401	20415	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_008282	TTA	4	20718	20729	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_008282	AAT	4	20757	20768	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_008282	TTTAA	4	20810	20829	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_008282	ATT	4	20934	20944	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_008282	TATC	3	20946	20957	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_008282	TTAT	3	21241	21251	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_008282	TA	6	21720	21730	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_008282	TTA	5	21772	21786	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_008282	AATC	3	21896	21908	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
79	NC_008282	TTAA	3	22307	22318	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_008282	TA	7	22625	22637	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_008282	AATT	3	23998	24008	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_008282	TAA	4	24013	24024	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_008282	ATTA	5	24093	24113	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_008282	TAT	5	24160	24174	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_008282	TAA	4	24193	24205	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_008282	AAAT	3	24240	24251	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_008282	A	13	24320	24332	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_008282	AT	6	24334	24344	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_008282	TTA	4	24799	24809	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_008282	TTC	4	25017	25028	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
91	NC_008282	TCT	4	25185	25196	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
92	NC_008282	CTTT	3	25645	25656	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_008282	TAATAT	3	25862	25878	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
94	NC_008282	TTTA	3	25901	25911	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_008282	TA	6	25970	25981	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_008282	TATAAA	3	25985	26002	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_008282	TAA	4	26065	26076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_008282	AGA	4	26337	26347	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_008282	GAAA	3	26457	26468	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_008282	ATA	4	26881	26892	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_008282	AAT	5	26904	26918	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_008282	AAT	4	27045	27056	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008282	TA	6	27092	27102	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_008282	TTAA	3	27488	27500	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_008282	TAT	5	27596	27610	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_008282	TATAA	3	27666	27679	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_008282	TAT	4	27986	27999	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_008282	ATT	4	28206	28217	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_008282	AT	10	29129	29150	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aspergillus oryzae mitochondrion