Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Eucalyptus globulus subsp. globulus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_008115ACT484951233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_008115ATTTT3961091420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_008115TAAAAA41191432583.33 %16.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_008115AGA42462571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
5NC_008115CAG4118211931233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %108802623
6NC_008115AAGT3128812981150 %25 %25 %0 %9 %108802623
7NC_008115CATT3426742781225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
8NC_008115A184661467818100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
9NC_008115AAT4468646971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_008115TCTCT352725285140 %60 %0 %40 %7 %108802625
11NC_008115GTTC363036314120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
12NC_008115ATAG3666366741250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
13NC_008115CTTT373497359110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
14NC_008115A168836885116100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
15NC_008115A148868888114100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
16NC_008115A179177919317100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
17NC_008115CTTT392219232120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
18NC_008115TTA4935493661333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
19NC_008115TAT6944394601833.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
20NC_008115A139498951013100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
21NC_008115ACAAA3967796921680 %0 %0 %20 %6 %Non-Coding
22NC_008115AT610664106741150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
23NC_008115AAAG310865108751175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
24NC_008115ATT411211112211133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_008115TTAA411224112391650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_008115ATTT311275112861225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
27NC_008115TACG311419114301225 %25 %25 %25 %8 %108802628
28NC_008115A14128411285414100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_008115TTTC31356113572120 %75 %0 %25 %8 %108802629
30NC_008115AAAT314206142171275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_008115TTTA314279142901225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
32NC_008115TAAA314368143801375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_008115TAA414426144371266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_008115A13145061451813100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
35NC_008115ATAA314676146871275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
36NC_008115A12146891470012100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
37NC_008115A12149831499412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_008115ATTC315213152231125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
39NC_008115TTTC31522615237120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
40NC_008115ATTCA315246152591440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
41NC_008115TAG415322153321133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
42NC_008115CAGAT315335153491540 %20 %20 %20 %6 %Non-Coding
43NC_008115T141574115754140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
44NC_008115TTTA315784157941125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
45NC_008115T131579915811130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
46NC_008115TTCT31864618656110 %75 %0 %25 %9 %108802633
47NC_008115T132001120023130 %100 %0 %0 %7 %108802633
48NC_008115TTCT42038420399160 %75 %0 %25 %6 %108802633
49NC_008115T122264022651120 %100 %0 %0 %8 %108802634
50NC_008115TTCA324124241351225 %50 %0 %25 %8 %108802634
51NC_008115GTT42508625097120 %66.67 %33.33 %0 %8 %108802634
52NC_008115CCTA326007260171125 %25 %0 %50 %9 %108802635
53NC_008115T122771327724120 %100 %0 %0 %8 %108802635
54NC_008115CTTT32884228853120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
55NC_008115CTTG32977529786120 %50 %25 %25 %0 %Non-Coding
56NC_008115GATT329889299001225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
57NC_008115AAT430516305261166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
58NC_008115TTA430786307961133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
59NC_008115T153137731391150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
60NC_008115T143172631739140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
61NC_008115TTCA331992320021125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
62NC_008115A15321703218415100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
63NC_008115AAATAA332281322981883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
64NC_008115A25326903271425100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_008115TTTC33326033272130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
66NC_008115TCTT33366133672120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
67NC_008115ATTC333790338001125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
68NC_008115AAAAGA333869338861883.33 %0 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
69NC_008115TTCA333964339751225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
70NC_008115ATTA434222342371650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
71NC_008115AT1134401344212150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
72NC_008115TTATA334723347361440 %60 %0 %0 %7 %Non-Coding
73NC_008115CGATA335206352191440 %20 %20 %20 %7 %Non-Coding
74NC_008115AT1335881359052550 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_008115GAAA337446374571275 %0 %25 %0 %8 %108802639
76NC_008115GGA437648376591233.33 %0 %66.67 %0 %8 %108802639
77NC_008115TTGC33784737857110 %50 %25 %25 %9 %108802639
78NC_008115GA638656386671250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
79NC_008115TC63926939279110 %50 %0 %50 %9 %108802640
80NC_008115A17395063952217100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
81NC_008115ATTT339645396551125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
82NC_008115TAT539839398521433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
83NC_008115ATG442257422671133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %108802642
84NC_008115AATG343750437611250 %25 %25 %0 %8 %108802643
85NC_008115TG64419244202110 %50 %50 %0 %9 %108802643
86NC_008115ATG444481444911133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %108802643
87NC_008115ATT445805458171333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_008115TAA446453464641266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108802644
89NC_008115TATC346713467231125 %50 %0 %25 %9 %108802644
90NC_008115TAAG346730467411250 %25 %25 %0 %0 %108802644
91NC_008115CTTT34699547005110 %75 %0 %25 %9 %108802644
92NC_008115CTTT34790247913120 %75 %0 %25 %8 %108802644
93NC_008115A18479844800118100 %0 %0 %0 %5 %108802644
94NC_008115A12482604827112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
95NC_008115ATAA349994500051275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
96NC_008115TA650819508291150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
97NC_008115TA651229512391150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
98NC_008115AAAAT352091521041480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
99NC_008115ATG452178521891233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
100NC_008115TTTC35271152721110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
101NC_008115TTTG35357953589110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
102NC_008115GTCT35407754088120 %50 %25 %25 %8 %108802647
103NC_008115ATTT355058550691225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
104NC_008115TCTT35538255392110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
105NC_008115ATA458306583171266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108802650
106NC_008115TTTC35867358683110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
107NC_008115TTG45906359073110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
108NC_008115TGCA359993600051325 %25 %25 %25 %7 %108802651
109NC_008115A14609896100214100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
110NC_008115A13610216103313100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
111NC_008115CTTT46284962863150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
112NC_008115T126292162932120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
113NC_008115TCTT36304363054120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
114NC_008115TA763065630771350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
115NC_008115TTAT363211632211125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
116NC_008115AATTCG363239632551733.33 %33.33 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
117NC_008115AAG463320633311266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
118NC_008115TA663371633811150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
119NC_008115AAAC363945639561275 %0 %0 %25 %8 %Non-Coding
120NC_008115T126495664967120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
121NC_008115T126516265173120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
122NC_008115TTC46559365604120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802655
123NC_008115AATA366392664041375 %25 %0 %0 %7 %Non-Coding
124NC_008115AT666552665621150 %50 %0 %0 %9 %108802656
125NC_008115CTT46781667827120 %66.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
126NC_008115TA667976679871250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
127NC_008115TTCT36869668706110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
128NC_008115CTTG36947469484110 %50 %25 %25 %9 %Non-Coding
129NC_008115A13697216973313100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
130NC_008115TGAT370309703201225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
131NC_008115AATT370978709891250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
132NC_008115A13711367114813100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
133NC_008115ATA471484714951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
134NC_008115AT771693717051350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
135NC_008115GTTT37223172241110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
136NC_008115ATTT372250722611225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
137NC_008115ATAA473018730331675 %25 %0 %0 %6 %108802664
138NC_008115GAA473132731431266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
139NC_008115TGAA373662736731250 %25 %25 %0 %8 %108802665
140NC_008115TTTC37369673708130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
141NC_008115GATA374299743101250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
142NC_008115CCTT37431974329110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
143NC_008115GTAA374639746491150 %25 %25 %0 %9 %108802702
144NC_008115TTC47485474865120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802702
145NC_008115TTTA375202752131225 %75 %0 %0 %8 %108802702
146NC_008115T157524675260150 %100 %0 %0 %0 %108802702
147NC_008115T137595375965130 %100 %0 %0 %0 %108802702
148NC_008115AGT476431764421233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %108802702
149NC_008115TCCAA376503765161440 %20 %0 %40 %7 %108802702
150NC_008115TTCAC476592766112020 %40 %0 %40 %10 %108802702
151NC_008115TCT47857978590120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802702
152NC_008115TGA481694817051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %108802702
153NC_008115T128263282643120 %100 %0 %0 %8 %108802702
154NC_008115TTTC38289582905110 %75 %0 %25 %9 %108802702
155NC_008115TCT48298782998120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802702
156NC_008115ATA483692837031266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108802702
157NC_008115TTCT38475684767120 %75 %0 %25 %8 %108802702
158NC_008115TCCTT38507785092160 %60 %0 %40 %6 %108802702
159NC_008115ATC485604856141133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %108802702
160NC_008115A14858938590614100 %0 %0 %0 %7 %108802702
161NC_008115CTT48595385963110 %66.67 %0 %33.33 %9 %108802702
162NC_008115AAAT385985859951175 %25 %0 %0 %9 %108802702
163NC_008115T128657686587120 %100 %0 %0 %8 %108802702
164NC_008115GAAT386779867901250 %25 %25 %0 %8 %108802702
165NC_008115TTCT38711287123120 %75 %0 %25 %0 %108802702
166NC_008115T148717487187140 %100 %0 %0 %7 %108802702
167NC_008115AT687226872361150 %50 %0 %0 %9 %108802702
168NC_008115T128748787498120 %100 %0 %0 %8 %108802702
169NC_008115CAAT387603876131150 %25 %0 %25 %9 %108802702
170NC_008115ACTA388411884211150 %25 %0 %25 %9 %108802702
171NC_008115T158901489028150 %100 %0 %0 %0 %108802702
172NC_008115CTT48911189122120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802702
173NC_008115ATATG390917909311540 %40 %20 %0 %6 %108802702
174NC_008115TTCT49264792661150 %75 %0 %25 %6 %108802702
175NC_008115CTTT39384493854110 %75 %0 %25 %9 %108802702
176NC_008115GAT493999940101233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %108802702
177NC_008115TGAT395669956811325 %50 %25 %0 %7 %108802702
178NC_008115TGAT395711957231325 %50 %25 %0 %7 %108802702
179NC_008115AATA396558965701375 %25 %0 %0 %7 %108802702
180NC_008115GAAGGA397344973611850 %0 %50 %0 %5 %108802702
181NC_008115AATA398407984181275 %25 %0 %0 %8 %108802702
182NC_008115TGGG39885198862120 %25 %75 %0 %8 %108802702
183NC_008115TCCGG39946599479150 %20 %40 %40 %6 %108802702
184NC_008115A1410295810297114100 %0 %0 %0 %7 %108802702
185NC_008115TTC4103883103894120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802702
186NC_008115TATTAG31044651044872333.33 %50 %16.67 %0 %4 %108802702
187NC_008115ATCC31077591077701225 %25 %0 %50 %8 %108802702
188NC_008115CTAT31081561081671225 %50 %0 %25 %8 %108802702
189NC_008115AAGG31082981083081150 %0 %50 %0 %9 %108802702
190NC_008115GAGG31110241110351225 %0 %75 %0 %8 %108802702
191NC_008115AGGT31112361112471225 %25 %50 %0 %8 %108802702
192NC_008115TAAG31123561123661150 %25 %25 %0 %9 %108802702
193NC_008115T15113454113468150 %100 %0 %0 %6 %108802702
194NC_008115GAA51144491144631566.67 %0 %33.33 %0 %6 %108802702
195NC_008115AAAAT31153931154061480 %20 %0 %0 %7 %108802702
196NC_008115A1311541711542913100 %0 %0 %0 %7 %108802702
197NC_008115AAAT31154311154411175 %25 %0 %0 %9 %108802702
198NC_008115A1211555211556312100 %0 %0 %0 %8 %108802702
199NC_008115ATT41163131163251333.33 %66.67 %0 %0 %7 %108802702
200NC_008115TTGAAA31164301164481950 %33.33 %16.67 %0 %10 %108802702
201NC_008115AAG41169701169811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108802702
202NC_008115ATAG31176401176511250 %25 %25 %0 %0 %108802702
203NC_008115ATGAT31180021180171640 %40 %20 %0 %6 %108802702
204NC_008115A2411895411897724100 %0 %0 %0 %8 %108802702
205NC_008115TCA41190511190611133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %108802702
206NC_008115TAA41190621190741366.67 %33.33 %0 %0 %7 %108802702
207NC_008115A1211943511944612100 %0 %0 %0 %0 %108802702
208NC_008115ATT41194881194991233.33 %66.67 %0 %0 %0 %108802702
209NC_008115TAA41196801196911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108802702
210NC_008115ATA41209271209381266.67 %33.33 %0 %0 %8 %108802702
211NC_008115GAAA31210271210381275 %0 %25 %0 %8 %108802702
212NC_008115AAGA31214351214461275 %0 %25 %0 %8 %108802702
213NC_008115AAAG31225211225311175 %0 %25 %0 %9 %108802702
214NC_008115TAAT31231081231191250 %50 %0 %0 %0 %108802702
215NC_008115TATT41231261231411625 %75 %0 %0 %6 %108802702
216NC_008115TAT41246131246231133.33 %66.67 %0 %0 %9 %108802702
217NC_008115ATATT31258611258741440 %60 %0 %0 %7 %108802702
218NC_008115T12126208126219120 %100 %0 %0 %0 %108802702
219NC_008115ATT41263701263811233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108802702
220NC_008115AATC31265751265861250 %25 %0 %25 %8 %108802702
221NC_008115T13126615126627130 %100 %0 %0 %7 %108802702
222NC_008115TGAA31267181267281150 %25 %25 %0 %9 %108802702
223NC_008115AATA31286221286331275 %25 %0 %0 %8 %108802702
224NC_008115TTC4128880128891120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802702
225NC_008115TCT4128890128901120 %66.67 %0 %33.33 %8 %108802702
226NC_008115TAA41291631291751366.67 %33.33 %0 %0 %7 %108802702
227NC_008115TTCT4130117130131150 %75 %0 %25 %6 %108802702
228NC_008115ATC41307551307661233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108802702
229NC_008115TTTA31308511308611125 %75 %0 %0 %9 %108802702
230NC_008115TAAT31310081310191250 %50 %0 %0 %0 %108802702
231NC_008115AAGA31312681312791275 %0 %25 %0 %8 %108802702
232NC_008115ATA41324701324801166.67 %33.33 %0 %0 %9 %108802702
233NC_008115TTTC3132671132681110 %75 %0 %25 %9 %108802702
234NC_008115AAAG31327721327821175 %0 %25 %0 %9 %108802702
235NC_008115ATT41329511329621233.33 %66.67 %0 %0 %8 %108802702
236NC_008115T13133149133161130 %100 %0 %0 %7 %108802702
237NC_008115TATTT31334921335061520 %80 %0 %0 %6 %108802702
238NC_008115TTC6134813134831190 %66.67 %0 %33.33 %10 %108802702
239NC_008115A1213581713582812100 %0 %0 %0 %8 %108802702
240NC_008115AAAG31358831358931175 %0 %25 %0 %9 %108802702
241NC_008115T16136275136290160 %100 %0 %0 %6 %108802702
242NC_008115CTTA31369141369241125 %50 %0 %25 %9 %108802702
243NC_008115CCTT3140972140982110 %50 %0 %50 %9 %108802702
244NC_008115GGAT31415101415211225 %25 %50 %0 %8 %108802702
245NC_008115ACTAAT41447921448142350 %33.33 %0 %16.67 %4 %108802702
246NC_008115AAAAGA31453311453491983.33 %0 %16.67 %0 %10 %108802702
247NC_008115GAA41453861453971266.67 %0 %33.33 %0 %8 %108802702
248NC_008115CATAC31510481510611440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
249NC_008115CTCCTT3151918151935180 %50 %0 %50 %5 %108802705
250NC_008115ATCA31535991536111350 %25 %0 %25 %7 %108802705
251NC_008115ACC41537941538041133.33 %0 %0 %66.67 %9 %108802705
252NC_008115ATC41552701552811233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %108802705
253NC_008115AAAG31554261554361175 %0 %25 %0 %9 %108802705
254NC_008115TATT31564911565021225 %75 %0 %0 %8 %108802705
255NC_008115GAA51601571601711566.67 %0 %33.33 %0 %6 %108802707
256NC_008115A1716025216026817100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding