ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Anopheles funestus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_008070	CATT	3	55	67	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
2	NC_008070	N	602	390	991	602	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008070	TTAA	3	1301	1312	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_008070	N	145	1445	1589	145	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	107736149
5	NC_008070	CTTC	3	1731	1741	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	107736149
6	NC_008070	TAG	5	1760	1773	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	107736149
7	NC_008070	AGG	4	2087	2098	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	107736149
8	NC_008070	TATT	3	2795	2806	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	107736149
9	NC_008070	N	79	3331	3409	79	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	107736150
10	NC_008070	N	53	3563	3615	53	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	107736150
11	NC_008070	N	530	3989	4518	530	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008070	TTA	4	4615	4626	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_008070	N	457	4912	5368	457	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008070	ATT	5	5582	5596	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	107736151
15	NC_008070	TTAA	3	5789	5799	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107736151
16	NC_008070	TATTTT	3	5835	5853	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	107736151
17	NC_008070	GAAT	3	5894	5906	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	107736151
18	NC_008070	TTTA	3	6219	6229	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_008070	TAA	7	6318	6337	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	107736152
20	NC_008070	ATAA	3	6592	6602	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	107736152
21	NC_008070	A	26	6882	6907	26	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	107736152
22	NC_008070	N	121	7071	7191	121	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	107736152
23	NC_008070	TAA	4	7287	7298	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	107736152
24	NC_008070	TGAA	3	7371	7381	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	107736152
25	NC_008070	ATT	4	7486	7497	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107736152
26	NC_008070	N	233	7632	7864	233	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	107736152
27	NC_008070	TAAA	3	7998	8008	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	107736152
28	NC_008070	TAA	4	8171	8182	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_008070	ATC	4	8404	8415	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_008070	ATAA	3	8890	8902	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_008070	AAAT	4	9014	9028	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_008070	N	644	9070	9713	644	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008070	AAGA	3	9818	9828	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_008070	CAT	4	10092	10103	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	107736153
35	NC_008070	ATT	4	10147	10158	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	107736153
36	NC_008070	AAT	4	10165	10176	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	107736153
37	NC_008070	ATTA	4	10324	10339	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	107736153
38	NC_008070	N	485	10469	10953	485	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	107736154
39	NC_008070	ATTT	3	10997	11007	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	107736154
40	NC_008070	ATTT	3	11145	11156	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	107736154
41	NC_008070	ATTA	5	11535	11555	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	107736154
42	NC_008070	AAAC	3	12025	12035	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	107736155
43	NC_008070	TAAA	3	12093	12104	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	107736155
44	NC_008070	N	268	12142	12409	268	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	107736155
45	NC_008070	CTA	4	12509	12520	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	107736155
46	NC_008070	TAA	4	12530	12542	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	107736155
47	NC_008070	AAT	4	12713	12723	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_008070	N	157	12860	13016	157	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008070	N	275	13523	13797	275	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008070	ATT	4	13921	13932	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_008070	N	177	14142	14318	177	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008070	ATA	5	14800	14813	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_008070	AAT	4	14823	14833	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_008070	ATT	4	14834	14848	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_008070	T	19	14979	14997	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_008070	ATATA	3	15112	15126	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008070	TAA	4	15160	15172	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_008070	ATA	4	15326	15336	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Anopheles funestus mitochondrion