Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Vitis vinifera chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_007957AAC41781881166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
2NC_007957GAAA32562671275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
3NC_007957CAG5100510191533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %91983972
4NC_007957AAGT3111111211150 %25 %25 %0 %9 %91983972
5NC_007957GATA3175517671350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
6NC_007957A124423443412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_007957TTAG3449745071125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
8NC_007957AAATA3478047941580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_007957TCTCT353355348140 %60 %0 %40 %7 %91983974
10NC_007957T1264286439120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_007957ATA4668166921266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
12NC_007957TA6670667181350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_007957TAT4676167731333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
14NC_007957GAAT3752275331250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
15NC_007957TTTA3792579351125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
16NC_007957ATTA3795579651150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_007957CTAA3808380941250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
18NC_007957TTCT387328742110 %75 %0 %25 %9 %91983975
19NC_007957TGAA3928992991150 %25 %25 %0 %9 %91983976
20NC_007957AATA3930193111175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
21NC_007957GAAA3937893881175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
22NC_007957TA6959996101250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_007957CAA4984198521266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
24NC_007957TTA4991699261133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_007957TTCT399309941120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
26NC_007957TTTACT3995299701916.67 %66.67 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
27NC_007957AAGA3998799981275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
28NC_007957A12102661027712100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
29NC_007957GTTA310383103941225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
30NC_007957T141112211135140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
31NC_007957CCAT311164111741125 %25 %0 %50 %9 %Non-Coding
32NC_007957AATT311696117071250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
33NC_007957TAAA312479124901275 %25 %0 %0 %8 %91983977
34NC_007957A15132891330315100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
35NC_007957TTAT314709147191125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_007957T121478914800120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
37NC_007957AAAT315396154071275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
38NC_007957ATTCA315667156801440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
39NC_007957AT615746157561150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
40NC_007957AT616171161811150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
41NC_007957AAGT316895169051150 %25 %25 %0 %9 %91983980
42NC_007957ACTT317085170961225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
43NC_007957A12179771798812100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_007957TTA418100181111233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_007957T121956219573120 %100 %0 %0 %8 %91983982
46NC_007957T132019920211130 %100 %0 %0 %7 %91983982
47NC_007957TTCA324314243251225 %50 %0 %25 %8 %91983983
48NC_007957GAAT324409244191150 %25 %25 %0 %9 %91983983
49NC_007957GTT42530225313120 %66.67 %33.33 %0 %8 %91983983
50NC_007957T122792827939120 %100 %0 %0 %8 %91983984
51NC_007957ATT428604286151233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
52NC_007957A15289262894015100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
53NC_007957GATA330231302411150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
54NC_007957AAAATA330756307731883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
55NC_007957ATTCT330787308011520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
56NC_007957TTTA331198312081125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
57NC_007957TCTA431747317611525 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
58NC_007957T123201532026120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
59NC_007957T153258532599150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
60NC_007957AT833028330421550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
61NC_007957TTTAT333095331091520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
62NC_007957CTTC33376333774120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
63NC_007957TTTC33394433955120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
64NC_007957TAAA334116341261175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
65NC_007957AATT334172341821150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
66NC_007957TTCT33438334393110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
67NC_007957TA634708347191250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_007957A14349273494014100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
69NC_007957GAAA337565375761275 %0 %25 %0 %8 %91983988
70NC_007957GGA437767377781233.33 %0 %66.67 %0 %8 %91983988
71NC_007957TTGC33796637976110 %50 %25 %25 %9 %91983988
72NC_007957T123866838679120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
73NC_007957AG638783387931150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
74NC_007957GATCT338988390011420 %40 %20 %20 %7 %Non-Coding
75NC_007957TAGA439009390241650 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
76NC_007957TC63941239422110 %50 %0 %50 %9 %91983989
77NC_007957T153958839602150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
78NC_007957AT639647396591350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
79NC_007957AATA339660396711275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
80NC_007957TAT739682397022133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_007957AATAT339709397241660 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
82NC_007957AT839743397591750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
83NC_007957TTA439879398911333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
84NC_007957TA639911399211150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
85NC_007957TAT439924399341133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_007957TTAAA339973399871560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
87NC_007957AAAT339990400011275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
88NC_007957AT840062400761550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
89NC_007957GATC340520405301125 %25 %25 %25 %9 %Non-Coding
90NC_007957ATA440992410031266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91983991
91NC_007957ATG442376423861133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91983991
92NC_007957AATG343869438801250 %25 %25 %0 %8 %91983992
93NC_007957GCA444274442851233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %91983992
94NC_007957TG64431144321110 %50 %50 %0 %9 %91983992
95NC_007957TAG445922459331233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
96NC_007957TAAA346160461701175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
97NC_007957GTA448348483581133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
98NC_007957T125040850419120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
99NC_007957AG650974509841150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
100NC_007957AAGG351009510191150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
101NC_007957TATCC351762517761520 %40 %0 %40 %0 %Non-Coding
102NC_007957TA851820518341550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
103NC_007957ATG452035520461233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
104NC_007957CATA352392524031250 %25 %0 %25 %0 %Non-Coding
105NC_007957CTTT35251652528130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
106NC_007957T145270852721140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
107NC_007957AAAT354427544371175 %25 %0 %0 %9 %91983997
108NC_007957GTTT35462954641130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
109NC_007957AT1054718547361950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
110NC_007957TTA455097551091333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
111NC_007957GTTT35558555595110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
112NC_007957ATTT355599556101225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
113NC_007957ATA658655586711766.67 %33.33 %0 %0 %5 %91983999
114NC_007957TAT459142591541333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
115NC_007957TGT55938659399140 %66.67 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
116NC_007957TGCA360320603321325 %25 %25 %25 %7 %91984000
117NC_007957GTTA361393614031125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
118NC_007957TATT361479614901225 %75 %0 %0 %8 %91984001
119NC_007957ATTA362017620271150 %50 %0 %0 %9 %91984001
120NC_007957ATT463014630241133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
121NC_007957TATAGA363319633371950 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
122NC_007957GAA463506635161166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
123NC_007957TTA464120641301133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
124NC_007957A12656716568212100 %0 %0 %0 %0 %91984004
125NC_007957CTT46607266083120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91984004
126NC_007957AT666668666781150 %50 %0 %0 %9 %91984005
127NC_007957A12676296764012100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
128NC_007957A12681356814612100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
129NC_007957AT768284682961350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
130NC_007957AATC368383683941250 %25 %0 %25 %0 %Non-Coding
131NC_007957TTA468498685091233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
132NC_007957TAT468849688611333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
133NC_007957TTCT46962169636160 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
134NC_007957T136987169883130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
135NC_007957AGT469938699501333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
136NC_007957ACCT370047700581225 %25 %0 %50 %8 %Non-Coding
137NC_007957T137018870200130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
138NC_007957T137164871660130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
139NC_007957TAT471663716751333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
140NC_007957ATA471682716931266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
141NC_007957TA671698717091250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
142NC_007957A14724857249814100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
143NC_007957AT772786727981350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
144NC_007957GAA473326733371266.67 %0 %33.33 %0 %0 %Non-Coding
145NC_007957T137334273354130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
146NC_007957TGAA373846738571250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
147NC_007957TTTC37388073892130 %75 %0 %25 %7 %Non-Coding
148NC_007957T177400074016170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
149NC_007957T127451574526120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
150NC_007957AAGA375184751951275 %0 %25 %0 %8 %91984052
151NC_007957A13756157562713100 %0 %0 %0 %7 %91984052
152NC_007957AT776222762341350 %50 %0 %0 %7 %91984052
153NC_007957A15762507626415100 %0 %0 %0 %6 %91984052
154NC_007957AGAA376927769371175 %0 %25 %0 %9 %91984052
155NC_007957TCT47874378754120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91984052
156NC_007957ACA478890789001166.67 %0 %0 %33.33 %9 %91984052
157NC_007957CAAA379023790341275 %0 %0 %25 %8 %91984052
158NC_007957AT679932799421150 %50 %0 %0 %9 %91984052
159NC_007957ACTTA381588816011440 %40 %0 %20 %7 %91984052
160NC_007957A18827188273518100 %0 %0 %0 %5 %91984052
161NC_007957T178542585441170 %100 %0 %0 %5 %91984052
162NC_007957A14859518596414100 %0 %0 %0 %7 %91984052
163NC_007957ATA486730867421366.67 %33.33 %0 %0 %7 %91984052
164NC_007957TC68722087231120 %50 %0 %50 %8 %91984052
165NC_007957AT687352873621150 %50 %0 %0 %9 %91984052
166NC_007957TTA487672876821133.33 %66.67 %0 %0 %9 %91984052
167NC_007957CAAT387750877601150 %25 %0 %25 %9 %91984052
168NC_007957TCT48879988810120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91984052
169NC_007957T168920289217160 %100 %0 %0 %6 %91984052
170NC_007957TTAC389253892631125 %50 %0 %25 %9 %91984052
171NC_007957CTT48930889319120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91984052
172NC_007957GAT489776897861133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91984052
173NC_007957ATATG391104911181540 %40 %20 %0 %6 %91984052
174NC_007957GAT491147911571133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %91984052
175NC_007957TTCT39285392863110 %75 %0 %25 %9 %91984052
176NC_007957CTTT39404694056110 %75 %0 %25 %9 %91984052
177NC_007957GAT494201942121233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %91984052
178NC_007957TGAT395880958921325 %50 %25 %0 %7 %91984052
179NC_007957TGA495931959421233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %91984052
180NC_007957AATA396805968171375 %25 %0 %0 %7 %91984052
181NC_007957TA799527995391350 %50 %0 %0 %7 %91984052
182NC_007957TCCGG39976099774150 %20 %40 %40 %6 %91984052
183NC_007957TTTCG3102341102354140 %60 %20 %20 %7 %91984052
184NC_007957TTTGTT3102764102782190 %83.33 %16.67 %0 %10 %91984052
185NC_007957TTC4104158104169120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91984052
186NC_007957TTAT51041741041932025 %75 %0 %0 %5 %91984052
187NC_007957ATCC31078871078981225 %25 %0 %50 %8 %91984052
188NC_007957TCTA31082831082941225 %50 %0 %25 %8 %91984052
189NC_007957AAGG31084221084321150 %0 %50 %0 %9 %91984052
190NC_007957GAGG31111451111561225 %0 %75 %0 %8 %91984052
191NC_007957AGGT31113571113681225 %25 %50 %0 %8 %91984052
192NC_007957TAAG31124771124871150 %25 %25 %0 %9 %91984052
193NC_007957AGAAA31143491143631580 %0 %20 %0 %0 %91984052
194NC_007957GAA51145281145421566.67 %0 %33.33 %0 %6 %91984052
195NC_007957AAG41154381154491266.67 %0 %33.33 %0 %8 %91984052
196NC_007957TAA41161841161951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %91984052
197NC_007957AAAT31171031171131175 %25 %0 %0 %9 %91984052
198NC_007957ATT41171211171321233.33 %66.67 %0 %0 %8 %91984052
199NC_007957TTG4117684117695120 %66.67 %33.33 %0 %8 %91984052
200NC_007957ATAA31177821177931275 %25 %0 %0 %8 %91984052
201NC_007957A1211786611787712100 %0 %0 %0 %0 %91984052
202NC_007957TAT51188491188631533.33 %66.67 %0 %0 %6 %91984052
203NC_007957TTGT3119324119334110 %75 %25 %0 %9 %91984052
204NC_007957A1511933811935215100 %0 %0 %0 %6 %91984052
205NC_007957TA61198061198161150 %50 %0 %0 %9 %91984052
206NC_007957GATT31202641202761325 %50 %25 %0 %7 %91984052
207NC_007957ATGA31204421204521150 %25 %25 %0 %9 %91984052
208NC_007957CTT4121126121136110 %66.67 %0 %33.33 %9 %91984052
209NC_007957TA61215331215461450 %50 %0 %0 %7 %91984052
210NC_007957T13121638121650130 %100 %0 %0 %0 %91984052
211NC_007957ATTT31217331217431125 %75 %0 %0 %9 %91984052
212NC_007957TAGA31218561218671250 %25 %25 %0 %8 %91984052
213NC_007957CTA41224161224271233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %91984052
214NC_007957A1712330812332417100 %0 %0 %0 %5 %91984052
215NC_007957AAAATA31233571233741883.33 %16.67 %0 %0 %5 %91984052
216NC_007957ATGA31237241237351250 %25 %25 %0 %8 %91984052
217NC_007957TTC5126294126308150 %66.67 %0 %33.33 %6 %91984052
218NC_007957ATA51266691266841666.67 %33.33 %0 %0 %6 %91984052
219NC_007957AAGA31268791268901275 %0 %25 %0 %0 %91984052
220NC_007957AATC31273171273281250 %25 %0 %25 %0 %91984052
221NC_007957GAAT31274761274861150 %25 %25 %0 %9 %91984052
222NC_007957AAAAG31275341275471480 %0 %20 %0 %7 %91984052
223NC_007957CT6128907128918120 %50 %0 %50 %8 %91984052
224NC_007957ATA41297591297691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %91984052
225NC_007957TTATAA31297701297871850 %50 %0 %0 %5 %91984052
226NC_007957TAT41297851297961233.33 %66.67 %0 %0 %8 %91984052
227NC_007957TTTAA41301311301491940 %60 %0 %0 %10 %91984052
228NC_007957CTATTT31310071310241816.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %91984052
229NC_007957CATT31318471318581225 %50 %0 %25 %8 %91984052
230NC_007957TGAT31325731325831125 %50 %25 %0 %9 %91984052
231NC_007957AAAG31334191334301275 %0 %25 %0 %8 %91984052
232NC_007957TCT4134610134621120 %66.67 %0 %33.33 %8 %91984052
233NC_007957TTC6135514135532190 %66.67 %0 %33.33 %10 %91984052
234NC_007957TTTTC3135696135710150 %80 %0 %20 %0 %91984052
235NC_007957CTTA31375731375831125 %50 %0 %25 %9 %91984052
236NC_007957CCTT3141628141638110 %50 %0 %50 %9 %91984052
237NC_007957GGAT31421621421731225 %25 %50 %0 %8 %91984052
238NC_007957ACTAAT31453261453421750 %33.33 %0 %16.67 %5 %91984052
239NC_007957ATAA51458671458862075 %25 %0 %0 %5 %91984052
240NC_007957GAA41458911459021266.67 %0 %33.33 %0 %8 %91984052
241NC_007957ACCGG31502851502991520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
242NC_007957AT71505201505321350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
243NC_007957ATCA31541681541801350 %25 %0 %25 %7 %91984056
244NC_007957TGAT31542631542751325 %50 %25 %0 %7 %91984056
245NC_007957ATC41558481558591233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %91984056
246NC_007957AAAG31560041560141175 %0 %25 %0 %9 %91984056
247NC_007957ATTT31570701570811225 %75 %0 %0 %8 %91984056
248NC_007957ATC41589031589131133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
249NC_007957ATC41602741602841133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
250NC_007957GAA51607401607541566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
251NC_007957GTA41607941608061333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
252NC_007957A1616084516086016100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding