ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Physcomitrella patens mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007945	TTCT	3	69	79	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007945	AT	7	1060	1073	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_007945	AT	7	1247	1260	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_007945	CTT	4	1288	1299	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_007945	AT	6	2517	2527	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_007945	AATT	3	2575	2586	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_007945	CGGGG	3	2802	2816	15	0 %	0 %	80 %	20 %	6 %	Non-Coding
8	NC_007945	ACAA	3	3044	3055	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	17125915
9	NC_007945	AG	6	3624	3635	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	17125915
10	NC_007945	TA	6	3925	3935	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	17125915
11	NC_007945	ATTT	3	5892	5902	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	17125915
12	NC_007945	CTTT	3	7574	7585	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	17125915
13	NC_007945	CTC	4	7799	7810	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	17125915
14	NC_007945	TAAA	3	11021	11033	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	91208841
15	NC_007945	T	12	11054	11065	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	91208842
16	NC_007945	ATTT	3	11244	11255	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91208842
17	NC_007945	AT	6	11743	11754	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_007945	A	12	11818	11829	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_007945	TCCAT	3	11883	11897	15	20 %	40 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007945	T	14	12207	12220	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	91208843
21	NC_007945	CTTT	3	12850	12860	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_007945	AT	7	13411	13424	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_007945	TAA	4	14123	14134	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	91208844
24	NC_007945	A	12	14379	14390	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007945	TTTA	3	15008	15019	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91208845
26	NC_007945	ATT	4	15494	15504	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_007945	TTTA	3	15720	15731	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91208846
28	NC_007945	TTA	4	15757	15768	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91208846
29	NC_007945	TTTA	3	15928	15939	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	91208846
30	NC_007945	ATTTT	3	16150	16163	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	91208846
31	NC_007945	CAA	4	16225	16235	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	91208846
32	NC_007945	GCTT	3	16785	16797	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	91208847
33	NC_007945	T	15	18548	18562	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	91208848
34	NC_007945	ATTT	3	18858	18869	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91208848
35	NC_007945	AGAAA	3	19003	19017	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	91208848
36	NC_007945	GAAA	5	19070	19089	20	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	91208848
37	NC_007945	TTTA	3	20044	20054	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91208848
38	NC_007945	AT	6	20414	20425	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91208848
39	NC_007945	AT	6	20755	20767	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_007945	TGTT	4	21356	21370	15	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_007945	ATT	4	21634	21645	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_007945	TAA	4	21670	21681	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_007945	TAA	4	21726	21737	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_007945	TTTC	3	22244	22254	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
45	NC_007945	ATCA	3	22335	22345	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_007945	AAAAG	3	24447	24461	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_007945	AT	6	24539	24550	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_007945	TTTG	3	24552	24562	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_007945	CTTT	4	25705	25719	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
50	NC_007945	CATA	4	25914	25930	17	50 %	25 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
51	NC_007945	CTTT	4	26820	26834	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	17125915
52	NC_007945	CAT	4	27802	27812	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	17125915
53	NC_007945	TA	7	28184	28197	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_007945	AAAC	5	28276	28294	19	75 %	0 %	0 %	25 %	10 %	91208852
55	NC_007945	AT	6	29777	29790	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	91208853
56	NC_007945	AT	8	29792	29807	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	91208853
57	NC_007945	TTGA	3	29842	29852	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	91208853
58	NC_007945	CTTC	3	29915	29927	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	91208853
59	NC_007945	TTGACT	3	30109	30126	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
60	NC_007945	ATG	4	30950	30961	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_007945	AT	6	33220	33231	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_007945	AAAT	3	34313	34324	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007945	GCG	4	34693	34703	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
64	NC_007945	TAA	4	37867	37878	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_007945	ATATT	3	38897	38910	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_007945	A	12	39675	39686	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_007945	ATA	4	40057	40068	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_007945	TTTC	3	40687	40698	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_007945	AT	12	41225	41247	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_007945	AAGG	3	41572	41582	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_007945	GC	6	44521	44531	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	17125916
72	NC_007945	AT	8	44583	44598	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	17125916
73	NC_007945	ATA	4	46491	46501	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	17125916
74	NC_007945	AGA	4	46514	46524	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	17125916
75	NC_007945	A	12	46546	46557	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	17125916
76	NC_007945	GAT	4	48067	48077	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	17125916
77	NC_007945	GAA	4	48929	48939	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_007945	ATTTT	3	50602	50615	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	91208857
79	NC_007945	CG	6	52267	52277	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	91208858
80	NC_007945	ATCT	3	52852	52862	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91208858
81	NC_007945	TTTTAT	3	53326	53344	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	91208858
82	NC_007945	ATAA	3	53999	54010	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007945	CAA	4	54393	54403	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
84	NC_007945	AT	6	54739	54752	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_007945	A	13	54774	54786	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_007945	AT	6	55051	55062	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_007945	AGGAA	3	55439	55453	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007945	CAAT	3	55700	55711	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	91208859
89	NC_007945	T	12	57092	57103	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_007945	AT	7	57329	57344	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_007945	T	12	57349	57360	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007945	CATAG	3	57672	57685	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	91208861
93	NC_007945	CTC	4	58319	58331	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	91208861
94	NC_007945	GAAA	3	58819	58830	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	91208861
95	NC_007945	AT	8	59019	59035	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
96	NC_007945	TTTTCT	3	59204	59221	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
97	NC_007945	AT	6	59248	59259	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_007945	T	12	60796	60807	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_007945	T	12	60815	60826	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_007945	TGC	4	61080	61092	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
101	NC_007945	ATGC	3	61920	61930	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
102	NC_007945	GA	8	62052	62066	15	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_007945	AT	7	62193	62206	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_007945	A	13	65052	65064	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	91208863
105	NC_007945	ATC	4	65160	65170	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	91208863
106	NC_007945	AT	8	65255	65269	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	91208863
107	NC_007945	GAA	4	66227	66238	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	91208863
108	NC_007945	TCT	4	66259	66269	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	91208863
109	NC_007945	AGCG	3	67739	67749	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
110	NC_007945	ACAT	3	69203	69213	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	91208864
111	NC_007945	AGG	4	69812	69823	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	91208864
112	NC_007945	GGAC	3	69976	69986	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	91208864
113	NC_007945	C	13	71272	71284	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
114	NC_007945	AT	11	71463	71484	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_007945	TTTC	3	71485	71496	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
116	NC_007945	A	12	71906	71917	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_007945	TA	8	71916	71931	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
118	NC_007945	ATTT	3	72198	72209	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	91208865
119	NC_007945	TTGG	3	72245	72256	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	91208865
120	NC_007945	AT	8	72917	72932	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	91208865
121	NC_007945	TTA	4	73206	73217	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	91208865
122	NC_007945	TTCT	3	73316	73327	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	91208865
123	NC_007945	AT	16	74738	74768	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_007945	T	12	74766	74777	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_007945	TTGG	3	74989	75000	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	91208866
126	NC_007945	ATTTTT	4	76560	76583	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	91208866
127	NC_007945	CGTA	3	76780	76791	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	91208866
128	NC_007945	AT	6	78781	78791	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	91208867
129	NC_007945	AATT	3	81379	81390	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_007945	TTTA	3	81405	81416	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_007945	TAC	4	82789	82800	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	91208868
132	NC_007945	TTGA	3	84718	84728	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_007945	CTT	4	84941	84952	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91208869
134	NC_007945	TATTT	4	85050	85068	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	91208869
135	NC_007945	GCAAA	3	86473	86487	15	60 %	0 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
136	NC_007945	AT	6	86497	86507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_007945	AT	7	86612	86625	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Physcomitrella patens mitochondrion