ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Paracoccidioides brasiliensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007935	TTA	5	224	238	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_007935	AT	7	279	291	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_007935	CT	6	306	317	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
4	NC_007935	AT	14	409	435	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007935	TA	7	480	492	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_007935	TAA	9	569	595	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_007935	TAA	4	629	639	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_007935	GAG	8	646	669	24	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007935	GAG	8	667	690	24	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_007935	ATTA	3	764	775	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_007935	ATTTAT	3	848	864	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_007935	T	13	947	959	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_007935	TC	8	991	1006	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
14	NC_007935	TTTA	5	1069	1087	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
15	NC_007935	ATT	4	1102	1116	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_007935	TAT	4	1196	1208	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_007935	TA	21	1260	1302	43	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_007935	ATTT	3	1356	1367	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_007935	AT	6	1378	1388	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_007935	TTA	4	1449	1460	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_007935	ATT	7	1463	1483	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_007935	AAG	4	1486	1497	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_007935	AAT	5	1507	1521	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_007935	TGAT	6	1576	1599	24	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_007935	TTAA	3	1624	1634	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_007935	AATT	6	1716	1739	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_007935	TATAT	7	2104	2136	33	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_007935	ATA	4	2146	2158	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_007935	TAA	4	2163	2175	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_007935	AAT	5	2178	2191	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_007935	ATA	4	2196	2207	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007935	TAA	4	2212	2224	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_007935	G	17	2254	2270	17	0 %	0 %	100 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_007935	TAAA	4	2274	2289	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007935	ATTA	3	2325	2336	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_007935	TTTAA	3	2391	2404	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_007935	TATC	8	2433	2464	32	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
38	NC_007935	TA	7	2465	2478	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_007935	TTAA	3	2528	2540	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_007935	TAT	4	2558	2570	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_007935	TTTA	14	2622	2677	56	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_007935	TTA	4	2687	2698	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_007935	ATT	6	2752	2769	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_007935	TAT	4	2817	2828	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_007935	ATATAA	3	2876	2893	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_007935	TAA	4	2992	3006	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_007935	TTA	4	3266	3276	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_007935	TAT	4	3290	3301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_007935	TCT	4	3299	3310	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_007935	ATT	5	3387	3401	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_007935	ATA	4	3409	3423	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_007935	TAT	7	3426	3446	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_007935	AATTC	18	3462	3551	90	40 %	40 %	0 %	20 %	8 %	Non-Coding
54	NC_007935	TA	6	3637	3648	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_007935	TTA	11	3652	3684	33	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_007935	TA	13	3726	3750	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_007935	ATA	6	3841	3859	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
58	NC_007935	TAAA	4	3890	3905	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_007935	TAAA	3	4059	4070	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_007935	TA	20	4134	4171	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_007935	TA	6	4237	4247	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_007935	AT	7	4254	4266	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_007935	ATTTA	4	4282	4300	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_007935	ATA	5	4453	4467	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_007935	AT	14	4529	4555	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_007935	TAT	4	4610	4621	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_007935	TAA	5	4642	4656	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_007935	TTTA	3	4735	4746	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_007935	A	12	4786	4797	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_007935	ATT	4	5207	5218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
71	NC_007935	TTTA	3	5425	5435	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
72	NC_007935	TATT	6	6305	6327	23	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
73	NC_007935	TA	13	6352	6376	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
74	NC_007935	TTATT	4	6488	6508	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	91176247
75	NC_007935	TTTAA	4	6662	6681	20	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	91176247
76	NC_007935	TA	6	6975	6985	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	91176247
77	NC_007935	TA	6	6988	6998	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	91176247
78	NC_007935	TATT	3	7034	7044	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
79	NC_007935	TTC	4	7165	7176	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
80	NC_007935	TAT	4	7360	7370	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
81	NC_007935	TAT	4	7506	7517	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
82	NC_007935	AT	17	8161	8195	35	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
83	NC_007935	ATAA	10	8197	8235	39	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	91176247
84	NC_007935	ATCT	3	8316	8327	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	91176247
85	NC_007935	ACTT	3	8615	8625	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
86	NC_007935	ATTAT	3	8643	8657	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	91176247
87	NC_007935	TAT	4	8659	8670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
88	NC_007935	TTA	4	8688	8699	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
89	NC_007935	A	12	8978	8989	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	91176247
90	NC_007935	TA	6	8990	9000	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	91176247
91	NC_007935	TAT	9	9224	9249	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
92	NC_007935	TTA	5	9269	9283	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
93	NC_007935	TAT	4	9356	9368	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
94	NC_007935	ATA	6	9420	9436	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	91176247
95	NC_007935	TTA	9	9483	9509	27	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
96	NC_007935	ATT	8	9506	9529	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
97	NC_007935	ATT	4	9605	9615	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
98	NC_007935	GATT	3	10562	10572	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	91176247
99	NC_007935	AAATAT	6	10665	10700	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	2 %	91176247
100	NC_007935	GAA	4	10835	10846	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	91176247
101	NC_007935	TGT	4	12117	12129	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	91176247
102	NC_007935	AT	8	12391	12406	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	91176247
103	NC_007935	TA	11	12404	12426	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
104	NC_007935	ATAA	5	13236	13255	20	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	91176247
105	NC_007935	ATTT	3	13319	13329	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	91176247
106	NC_007935	TAA	5	13647	13661	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	91176247
107	NC_007935	TTTCC	3	13789	13803	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	91176247
108	NC_007935	TTCCT	3	13804	13818	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	91176247
109	NC_007935	TTCC	3	13865	13876	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	91176247
110	NC_007935	TTCC	3	13900	13912	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	91176247
111	NC_007935	TTCC	3	13940	13952	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	91176247
112	NC_007935	TTC	5	14085	14099	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	91176247
113	NC_007935	TTA	4	14106	14119	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	91176247
114	NC_007935	TTC	4	14127	14138	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	91176247
115	NC_007935	ATT	14	14144	14185	42	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
116	NC_007935	AGT	15	14180	14224	45	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	91176247
117	NC_007935	TTA	5	14273	14287	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
118	NC_007935	ATA	5	14323	14337	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	91176247
119	NC_007935	TTAA	3	14418	14429	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
120	NC_007935	TA	8	14654	14669	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	91176247
121	NC_007935	TAATC	3	14693	14707	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	91176247
122	NC_007935	ATCTA	3	14710	14724	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	91176247
123	NC_007935	ATA	4	14779	14789	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	91176247
124	NC_007935	TA	23	14793	14837	45	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
125	NC_007935	TA	6	14854	14865	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
126	NC_007935	ATCG	8	15004	15035	32	25 %	25 %	25 %	25 %	6 %	91176247
127	NC_007935	TAA	4	15106	15116	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	91176247
128	NC_007935	TTA	4	15121	15132	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
129	NC_007935	AT	7	15150	15163	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	91176247
130	NC_007935	TTTA	3	15284	15295	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	91176247
131	NC_007935	TAT	4	15301	15312	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
132	NC_007935	TTTA	3	15321	15333	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	91176247
133	NC_007935	CCTCC	4	15490	15508	19	0 %	20 %	0 %	80 %	10 %	91176247
134	NC_007935	CCCT	3	15575	15586	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	91176247
135	NC_007935	TACT	3	15598	15608	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	91176247
136	NC_007935	TAT	5	15720	15734	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
137	NC_007935	TAT	4	15756	15767	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
138	NC_007935	TTA	7	15767	15787	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	91176247
139	NC_007935	TTA	5	15791	15805	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	91176247
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142	NC_007935	ATT	4	15856	15867	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	91176247
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255	NC_007935	TA	11	30136	30156	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	91176247
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258	NC_007935	TA	6	30429	30440	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
259	NC_007935	AT	12	30524	30547	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
260	NC_007935	AT	6	30554	30565	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	91176247
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600	NC_007935	AT	9	71260	71277	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
601	NC_007935	TAATTA	3	71302	71319	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Paracoccidioides brasiliensis mitochondrion