ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Triticum aestivum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_007579	TAA	4	1068	1078	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_007579	GAT	4	1379	1390	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_007579	TG	6	1490	1500	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_007579	GCAA	3	2263	2275	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
5	NC_007579	TACCTA	3	8585	8602	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
6	NC_007579	AG	6	9620	9630	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_007579	TCTTAT	5	9933	9962	30	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	6 %	Non-Coding
8	NC_007579	CTT	4	11328	11339	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_007579	GAA	4	11646	11658	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_007579	TGTT	3	11725	11735	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_007579	TTCC	3	12056	12067	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007579	TTTCA	3	12444	12457	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
13	NC_007579	GATC	3	13177	13188	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
14	NC_007579	GCTT	3	13468	13478	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
15	NC_007579	AGGG	3	15633	15644	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_007579	GAAT	3	15836	15846	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_007579	CAGT	3	16872	16882	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	81176539
18	NC_007579	TCA	4	16954	16965	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
19	NC_007579	CAT	4	18009	18020	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
20	NC_007579	GCTC	3	20317	20329	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	81176539
21	NC_007579	AACT	3	20574	20584	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
22	NC_007579	TTAG	3	20598	20610	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	81176539
23	NC_007579	TTC	4	23183	23194	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
24	NC_007579	TCCA	3	24108	24119	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	81176539
25	NC_007579	AGA	4	24183	24193	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
26	NC_007579	TATTGG	3	24425	24442	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	81176539
27	NC_007579	TTCA	3	26103	26114	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	81176539
28	NC_007579	CTCG	3	26457	26467	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	81176539
29	NC_007579	AACT	3	27821	27831	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
30	NC_007579	CTGG	3	27936	27948	13	0 %	25 %	50 %	25 %	7 %	81176539
31	NC_007579	CTA	4	31130	31142	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	81176539
32	NC_007579	AAAG	3	31482	31492	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	81176539
33	NC_007579	TA	6	31783	31794	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	81176539
34	NC_007579	AACC	3	32047	32057	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	81176539
35	NC_007579	CCTT	3	32653	32664	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	81176539
36	NC_007579	AGAGAT	3	33236	33253	18	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	5 %	81176539
37	NC_007579	CAA	5	33510	33524	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	81176539
38	NC_007579	TGCAA	3	36958	36971	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	81176539
39	NC_007579	CAG	4	37290	37301	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
40	NC_007579	GCATC	3	39934	39947	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	81176539
41	NC_007579	AAG	7	40176	40196	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
42	NC_007579	ATA	4	40837	40848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	81176539
43	NC_007579	AG	7	41422	41434	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	81176539
44	NC_007579	ATTC	3	41728	41739	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	81176539
45	NC_007579	ATC	4	43021	43031	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
46	NC_007579	TCAT	4	43825	43840	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	81176539
47	NC_007579	AGA	4	46961	46972	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
48	NC_007579	AGA	4	48238	48250	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	81176539
49	NC_007579	GAATA	5	48693	48716	24	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	81176539
50	NC_007579	A	13	48768	48780	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	81176539
51	NC_007579	CATAA	3	50123	50137	15	60 %	20 %	0 %	20 %	0 %	81176539
52	NC_007579	ACC	4	50507	50519	13	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	7 %	81176539
53	NC_007579	CATT	3	50963	50973	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	81176539
54	NC_007579	AAG	4	52416	52427	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
55	NC_007579	GTTC	3	52925	52936	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	81176539
56	NC_007579	CTG	4	53428	53439	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
57	NC_007579	CATT	3	55095	55106	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	81176539
58	NC_007579	TCAT	5	56345	56365	21	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	81176539
59	NC_007579	CCATTG	3	57093	57110	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	81176539
60	NC_007579	CGT	4	57307	57318	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
61	NC_007579	GTT	4	57664	57674	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
62	NC_007579	TA	7	58942	58955	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	81176539
63	NC_007579	CTTG	3	60054	60064	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	81176539
64	NC_007579	AGA	4	63708	63719	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176539
65	NC_007579	GA	6	64795	64805	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	81176539
66	NC_007579	TGAT	3	65732	65744	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	81176539
67	NC_007579	GGAAT	3	66149	66163	15	40 %	20 %	40 %	0 %	6 %	81176539
68	NC_007579	AGA	4	69959	69969	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
69	NC_007579	GAAG	3	70426	70436	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	81176539
70	NC_007579	ACGA	3	70551	70561	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
71	NC_007579	TAC	4	71414	71424	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	81176539
72	NC_007579	CAG	4	72510	72520	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176539
73	NC_007579	GCT	5	76550	76564	15	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81176539
74	NC_007579	GT	6	76599	76610	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	81176539
75	NC_007579	AAGC	3	76980	76990	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
76	NC_007579	CTT	4	77389	77400	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
77	NC_007579	CCGT	3	77582	77593	12	0 %	25 %	25 %	50 %	0 %	81176539
78	NC_007579	TAGA	3	78008	78020	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	81176539
79	NC_007579	TTTGA	3	79100	79114	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	81176539
80	NC_007579	GATA	3	79488	79498	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	81176539
81	NC_007579	GA	6	81177	81188	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	81176539
82	NC_007579	TAGA	5	82596	82614	19	50 %	25 %	25 %	0 %	10 %	81176539
83	NC_007579	TAAC	3	82796	82806	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
84	NC_007579	AGCATC	3	84071	84089	19	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	10 %	81176539
85	NC_007579	GCTC	3	86193	86205	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	81176539
86	NC_007579	AAAG	3	86388	86399	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	81176539
87	NC_007579	TAAA	3	86585	86596	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	81176539
88	NC_007579	TAAC	3	88889	88899	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	81176539
89	NC_007579	TTACC	3	91125	91140	16	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	81176539
90	NC_007579	CTTC	3	91424	91435	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	81176539
91	NC_007579	AATG	3	92043	92054	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	81176539
92	NC_007579	ATA	4	92176	92188	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	81176539
93	NC_007579	AAGC	3	92906	92916	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
94	NC_007579	TCT	4	95225	95236	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
95	NC_007579	CTT	4	95516	95527	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
96	NC_007579	TAT	4	96779	96791	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	81176539
97	NC_007579	ACACT	3	97865	97878	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	81176539
98	NC_007579	GCAA	3	98131	98142	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	81176539
99	NC_007579	TACC	3	98257	98267	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	81176539
100	NC_007579	TAG	4	99128	99138	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
101	NC_007579	ATA	5	99222	99236	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	81176539
102	NC_007579	CTT	4	99531	99542	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
103	NC_007579	ATTCCT	3	99649	99666	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	81176539
104	NC_007579	CT	6	99914	99924	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	81176539
105	NC_007579	CTCG	3	100482	100492	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	81176539
106	NC_007579	GAC	4	100929	100940	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	81176539
107	NC_007579	AAGC	3	101006	101016	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	81176539
108	NC_007579	TGGG	3	101076	101086	11	0 %	25 %	75 %	0 %	9 %	81176539
109	NC_007579	CTGG	3	101705	101715	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	81176539
110	NC_007579	GAAA	3	102084	102094	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	81176539
111	NC_007579	ATT	4	102597	102607	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	81176539
112	NC_007579	GGAA	4	103479	103494	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	81176539
113	NC_007579	TACT	3	103673	103683	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	81176539
114	NC_007579	TCCAG	3	104398	104411	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	81176539
115	NC_007579	AGGG	3	104958	104969	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	81176539
116	NC_007579	AGTC	3	104970	104980	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	81176539
117	NC_007579	CTT	5	105083	105096	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	81176539
118	NC_007579	CAAC	3	105694	105704	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	81176539
119	NC_007579	ACT	4	107846	107857	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
120	NC_007579	CAAA	3	107900	107910	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	81176539
121	NC_007579	CCTTG	3	108046	108061	16	0 %	40 %	20 %	40 %	6 %	81176539
122	NC_007579	CTT	4	110120	110131	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	81176539
123	NC_007579	GAT	4	110746	110758	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	81176539
124	NC_007579	CGA	4	111042	111052	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	81176539
125	NC_007579	CTGGT	3	111167	111180	14	0 %	40 %	40 %	20 %	7 %	81176539
126	NC_007579	AAAG	4	112350	112365	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	81176539
127	NC_007579	TTCTTT	3	113164	113182	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	81176539
128	NC_007579	GCT	6	114136	114152	17	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	5 %	81176539
129	NC_007579	AGT	4	114615	114625	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	81176539
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247	NC_007579	AAG	4	193575	193586	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	81176528
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249	NC_007579	CCT	4	193770	193781	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	81176528
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251	NC_007579	GCTC	3	197187	197199	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	81176528
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533	NC_007579	AATG	3	426962	426974	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
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535	NC_007579	CCTT	3	428090	428101	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Triticum aestivum mitochondrion