ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Smittium culisetae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006837	TA	6	85	95	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_006837	A	15	482	496	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_006837	AAT	4	729	740	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_006837	AAAT	3	811	822	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006837	TAA	4	1579	1589	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_006837	TAT	4	1613	1623	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_006837	AT	6	2015	2026	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_006837	AAAT	3	2881	2892	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	58578568
9	NC_006837	ATA	4	3171	3183	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	58578568
10	NC_006837	TTAAA	3	3494	3508	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006837	TAA	4	4147	4158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_006837	TAGG	3	4412	4422	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_006837	AAAT	3	5358	5368	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_006837	TATT	3	5691	5701	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_006837	TTA	4	5726	5737	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_006837	TTA	4	5815	5825	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_006837	AT	6	5859	5869	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_006837	ATA	4	5984	5995	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_006837	TAT	4	6197	6208	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006837	AT	7	6750	6762	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_006837	TATTT	3	6839	6853	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006837	AT	6	6966	6976	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_006837	AT	6	7072	7082	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_006837	ATT	4	7176	7187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_006837	TA	6	7219	7229	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_006837	ATATT	3	7357	7372	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_006837	TTA	4	7375	7386	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_006837	TGA	4	7643	7654	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	58578569
29	NC_006837	AAAT	3	7705	7716	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	58578569
30	NC_006837	ATA	4	7725	7737	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	58578569
31	NC_006837	TATATT	3	8007	8024	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_006837	TTTA	3	8055	8065	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_006837	TAT	5	8132	8147	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_006837	TATT	3	8728	8739	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_006837	ATA	4	8740	8751	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_006837	AATAA	3	8839	8852	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_006837	ATT	5	8962	8976	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_006837	TAA	4	9151	9163	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_006837	AT	6	9342	9354	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578571
40	NC_006837	AT	6	9479	9491	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578571
41	NC_006837	AATT	3	9498	9508	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	58578571
42	NC_006837	TAAA	3	9520	9530	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	58578571
43	NC_006837	TAA	4	9567	9577	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578571
44	NC_006837	TAA	4	9598	9608	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578571
45	NC_006837	AAT	4	9677	9688	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578571
46	NC_006837	TAT	4	9688	9698	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58578571
47	NC_006837	TAA	4	9850	9860	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578571
48	NC_006837	TAA	4	10255	10265	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578571
49	NC_006837	TAA	5	10540	10554	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	58578571
50	NC_006837	TTGA	3	10591	10602	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	58578571
51	NC_006837	TAT	4	10750	10761	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578571
52	NC_006837	TTTTTA	3	10796	10814	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_006837	ATTT	4	10868	10883	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_006837	TTAT	3	10944	10955	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_006837	TA	6	11123	11133	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_006837	TAAA	3	12146	12156	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	58578572
57	NC_006837	TA	6	12492	12503	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578572
58	NC_006837	TA	6	12597	12607	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	58578572
59	NC_006837	TA	7	13158	13170	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578572
60	NC_006837	TAA	4	13329	13340	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578572
61	NC_006837	TAT	4	13689	13700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578572
62	NC_006837	TAT	4	13743	13754	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_006837	TTTC	3	13951	13961	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
64	NC_006837	ATT	4	13972	13982	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_006837	A	14	14279	14292	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_006837	AAAAT	4	14677	14695	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	58578573
67	NC_006837	AAAAT	3	15037	15051	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	58578573
68	NC_006837	AT	6	15198	15209	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578573
69	NC_006837	TA	6	15300	15311	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578573
70	NC_006837	TAAA	3	15380	15392	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	58578573
71	NC_006837	TTAATA	3	15569	15586	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	58578573
72	NC_006837	T	13	15716	15728	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	58578573
73	NC_006837	TTTA	3	15801	15811	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	58578573
74	NC_006837	ATT	4	15837	15848	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578573
75	NC_006837	TAT	4	16602	16613	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578573
76	NC_006837	AATTTA	3	16680	16698	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	58578573
77	NC_006837	AT	7	17316	17328	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578573
78	NC_006837	TAT	4	17929	17941	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	58578573
79	NC_006837	ATTTT	4	17968	17988	21	20 %	80 %	0 %	0 %	4 %	58578573
80	NC_006837	ATT	4	18530	18541	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578573
81	NC_006837	TAT	6	18568	18586	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	58578573
82	NC_006837	ATATTT	3	18610	18626	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	58578573
83	NC_006837	TAT	4	18678	18689	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578573
84	NC_006837	ATTT	4	19065	19080	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006837	TAT	4	19178	19189	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_006837	TAAA	3	19355	19366	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006837	ATA	4	19796	19807	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_006837	TAT	4	19865	19875	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_006837	ATA	8	20041	20063	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578577
90	NC_006837	AAAT	3	20070	20081	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	58578577
91	NC_006837	TA	7	20128	20141	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578577
92	NC_006837	TTAATA	3	20253	20270	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	58578577
93	NC_006837	TATAAA	3	20314	20331	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	58578577
94	NC_006837	ATA	4	20421	20431	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578577
95	NC_006837	TAT	4	20435	20445	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	58578577
96	NC_006837	TTTTA	3	20725	20739	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_006837	TTAATA	3	21067	21085	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
98	NC_006837	TAA	4	21142	21152	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_006837	ATAA	4	21292	21306	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_006837	ATAA	3	21334	21345	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006837	TTATA	4	21348	21368	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_006837	AAAT	5	21405	21424	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
103	NC_006837	ATT	4	21445	21457	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
104	NC_006837	AT	6	21599	21610	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_006837	TTTA	3	22400	22410	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_006837	ATTC	3	22474	22485	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_006837	CTT	5	22516	22529	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_006837	TTTA	3	22700	22712	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_006837	CCTATA	3	23145	23162	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	58578578
110	NC_006837	AT	7	23262	23274	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	58578578
111	NC_006837	TAA	4	23859	23869	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_006837	A	15	23868	23882	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
113	NC_006837	ATA	4	24126	24137	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_006837	TA	10	24379	24398	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
115	NC_006837	GGTA	3	24414	24424	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_006837	TAA	4	24520	24530	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	58578579
117	NC_006837	ATA	4	24773	24784	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	58578579
118	NC_006837	ATT	4	24961	24972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	58578579
119	NC_006837	TAAC	3	25292	25302	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
120	NC_006837	TAT	5	25810	25823	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_006837	TAT	4	25884	25894	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_006837	ATT	4	26284	26294	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_006837	AT	6	26297	26307	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_006837	TATT	3	26335	26345	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_006837	ATT	4	26394	26404	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_006837	A	13	26453	26465	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_006837	TA	11	26703	26723	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_006837	TAT	4	26845	26856	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_006837	TAT	5	26890	26903	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_006837	TAAA	3	26914	26924	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_006837	TAT	4	26992	27003	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_006837	ATA	4	27028	27038	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_006837	ATA	4	27081	27091	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
134	NC_006837	TATT	3	27105	27116	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
135	NC_006837	TTA	4	27133	27143	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_006837	ATA	4	27293	27303	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
137	NC_006837	TTTA	3	27327	27338	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_006837	ATA	4	27871	27881	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
139	NC_006837	TAT	5	28012	28026	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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173	NC_006837	TTTA	3	33535	33546	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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261	NC_006837	AT	6	50438	50449	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	58578588
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Smittium culisetae mitochondrion