ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Schizaphis graminum mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_006158	TAA	4	135	146	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51830050
2	NC_006158	AATT	3	229	240	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51830050
3	NC_006158	TAA	4	317	328	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	51830050
4	NC_006158	TAA	4	510	520	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51830050
5	NC_006158	AGG	4	657	668	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51830050
6	NC_006158	TTAA	3	1519	1529	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51830050
7	NC_006158	TAT	7	1682	1702	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51830051
8	NC_006158	TTA	4	1747	1758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830051
9	NC_006158	ATTTTT	3	2440	2457	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	51830052
10	NC_006158	A	13	2528	2540	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51830052
11	NC_006158	CAA	4	2580	2591	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51830053
12	NC_006158	ATT	4	2679	2691	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51830053
13	NC_006158	TTTTA	3	2779	2794	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51830053
14	NC_006158	ATT	4	3095	3108	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51830053
15	NC_006158	TAAAT	3	3428	3442	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	51830054
16	NC_006158	ATT	4	3604	3614	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51830054
17	NC_006158	TAT	4	3678	3689	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830054
18	NC_006158	TAA	4	4143	4154	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51830055
19	NC_006158	TAA	4	4569	4580	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_006158	A	15	4783	4797	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_006158	ATAAA	3	4933	4947	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_006158	A	15	5087	5101	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_006158	A	15	5240	5254	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_006158	A	14	5442	5455	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51830056
25	NC_006158	AAAT	3	5652	5662	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51830056
26	NC_006158	A	13	5676	5688	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51830056
27	NC_006158	AAAT	3	5718	5728	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51830056
28	NC_006158	TAAA	3	5756	5766	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51830056
29	NC_006158	TAT	4	5946	5957	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830056
30	NC_006158	A	29	6002	6030	29	100 %	0 %	0 %	0 %	3 %	51830056
31	NC_006158	AAG	4	6548	6559	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51830056
32	NC_006158	ATAA	4	6607	6621	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51830056
33	NC_006158	ATA	4	6691	6703	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51830056
34	NC_006158	ATTT	3	6752	6762	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51830056
35	NC_006158	A	14	7026	7039	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51830056
36	NC_006158	A	35	7108	7142	35	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_006158	ATTT	3	7147	7158	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_006158	ATA	4	7271	7283	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51830057
39	NC_006158	ATAA	5	7790	7809	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	51830057
40	NC_006158	ATA	4	7995	8006	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51830057
41	NC_006158	ATA	4	8028	8040	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51830057
42	NC_006158	TAAA	5	8103	8122	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	51830057
43	NC_006158	ATAAA	3	8205	8219	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	51830057
44	NC_006158	ATA	4	8248	8262	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51830057
45	NC_006158	A	27	8434	8460	27	100 %	0 %	0 %	0 %	3 %	51830057
46	NC_006158	TAA	4	8648	8658	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51830058
47	NC_006158	TAA	5	8687	8701	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51830058
48	NC_006158	TAAA	3	8807	8819	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51830058
49	NC_006158	TTAT	3	9144	9155	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51830059
50	NC_006158	ATTT	4	9356	9371	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51830059
51	NC_006158	TAT	4	9788	9799	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830060
52	NC_006158	TAT	5	9993	10006	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51830060
53	NC_006158	AAAT	3	10598	10608	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_006158	TAAATA	3	10675	10692	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	51830061
55	NC_006158	AAAATA	4	10782	10805	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	51830061
56	NC_006158	ATAAAA	3	10890	10907	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	51830061
57	NC_006158	A	27	11018	11044	27	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51830061
58	NC_006158	ATA	4	11112	11123	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51830061
59	NC_006158	ATT	4	11118	11129	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51830061
60	NC_006158	AAAT	3	11246	11257	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51830061
61	NC_006158	ATTT	4	11668	11684	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
62	NC_006158	AAAATT	3	12029	12046	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_006158	ATTA	6	12353	12375	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_006158	TAAA	3	12421	12431	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_006158	TTAAAT	3	12577	12595	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_006158	TAAA	3	12838	12849	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006158	AAAT	3	13076	13087	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006158	ATA	4	13198	13208	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_006158	TAA	4	13256	13266	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_006158	TAAAT	3	13371	13385	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_006158	TAA	4	13505	13516	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_006158	TTTA	3	13866	13877	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_006158	TAAA	3	13905	13916	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_006158	TA	11	13949	13969	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_006158	AT	9	14010	14026	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
76	NC_006158	AT	14	14061	14087	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_006158	TA	13	14116	14139	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_006158	TA	6	14151	14162	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_006158	T	14	14204	14217	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006158	AAAC	3	14319	14330	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_006158	TAA	4	14911	14922	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51830062
82	NC_006158	AATT	3	15065	15075	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51830062
83	NC_006158	AT	6	15334	15346	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51830062
84	NC_006158	ATTAT	3	15351	15364	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	51830062
85	NC_006158	TTATT	3	15404	15418	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51830062
86	NC_006158	TTAT	7	15501	15527	27	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51830062

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Schizaphis graminum mitochondrion