ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lepidopsocid sp. RS-2001 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004816	TAAA	3	77	88	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_004816	ATT	4	331	342	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31324909
3	NC_004816	TTAA	3	413	425	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31324909
4	NC_004816	TCAT	3	591	602	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	31324909
5	NC_004816	ATTT	3	836	847	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	31324909
6	NC_004816	TA	6	936	946	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31324909
7	NC_004816	ATT	4	1013	1023	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31324909
8	NC_004816	AAAATT	3	1024	1042	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	31324909
9	NC_004816	TTAA	3	1127	1137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31324909
10	NC_004816	TAAT	3	1506	1517	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	31324910
11	NC_004816	TAT	5	1847	1861	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31324910
12	NC_004816	ATT	4	2991	3002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_004816	ATT	4	3041	3052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31324911
14	NC_004816	TTTA	5	3238	3257	20	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	31324912
15	NC_004816	TTAA	3	3308	3318	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31324912
16	NC_004816	ATT	4	3754	3765	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31324912
17	NC_004816	AAT	4	3978	3989	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31324906
18	NC_004816	CTCA	3	4280	4290	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	31324906
19	NC_004816	ATA	4	4298	4309	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	31324906
20	NC_004816	ATTTA	3	5105	5120	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	31324907
21	NC_004816	ATTTTA	4	6134	6157	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31324908
22	NC_004816	TAA	4	6306	6317	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_004816	ATAAAT	3	6444	6461	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	31324913
24	NC_004816	AAAT	4	6458	6473	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	31324913
25	NC_004816	TA	8	6677	6691	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	31324913
26	NC_004816	A	16	6999	7014	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31324913
27	NC_004816	AAG	4	7541	7552	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	31324913
28	NC_004816	AAT	4	7581	7593	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31324913
29	NC_004816	AATT	3	7599	7611	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	31324913
30	NC_004816	ATT	5	7843	7857	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	31324913
31	NC_004816	A	14	8085	8098	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	31324913
32	NC_004816	AAAT	3	8129	8139	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	31324913
33	NC_004816	AT	6	8300	8310	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31324914
34	NC_004816	ATTA	3	8574	8584	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31324914
35	NC_004816	TAA	4	9188	9200	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31324914
36	NC_004816	TCT	4	9336	9347	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	31324914
37	NC_004816	AT	6	9485	9495	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	31324914
38	NC_004816	ATT	4	9994	10004	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	31324916
39	NC_004816	ATTT	3	10174	10186	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	31324916
40	NC_004816	AAT	4	10266	10278	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	31324916
41	NC_004816	TTA	4	11074	11085	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	31324917
42	NC_004816	TAAT	3	11619	11630	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	31324917
43	NC_004816	A	14	11787	11800	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	31324918
44	NC_004816	A	15	11814	11828	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	31324918
45	NC_004816	ATAAAT	3	12047	12064	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	31324918
46	NC_004816	AAAT	3	12676	12687	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_004816	TAAT	4	12690	12705	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_004816	ATTA	4	13023	13038	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_004816	AAATA	4	13046	13065	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
50	NC_004816	TAAAT	3	13339	13353	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_004816	AAAT	3	13443	13453	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_004816	TTTATA	3	13524	13542	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_004816	AATT	3	13607	13618	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_004816	AAAT	4	13708	13723	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_004816	TAAA	3	13808	13818	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_004816	TAAT	3	13834	13844	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_004816	TTTAAA	3	13851	13867	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_004816	TAA	4	13887	13897	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_004816	TAA	4	13908	13919	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_004816	AAT	4	13932	13943	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_004816	AATTT	3	14159	14173	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_004816	TTATA	3	14251	14265	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_004816	AAT	4	14698	14708	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_004816	TAA	4	15010	15020	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_004816	TAAATA	3	16333	16351	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
66	NC_004816	T	15	16371	16385	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_004816	TTAA	3	16434	16445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004816	AT	24	16454	16500	47	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_004816	AATT	3	16501	16511	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_004816	TA	7	16534	16549	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_004816	AT	6	16589	16599	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_004816	AT	7	16602	16615	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_004816	TA	8	16664	16678	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_004816	TTAA	3	16872	16884	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lepidopsocid sp. RS-2001 mitochondrion