ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Schizosaccharomyces octosporus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004312	TA	7	172	184	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_004312	TAG	4	654	665	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_004312	AAGT	4	750	765	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_004312	ATGA	4	2190	2205	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_004312	ATAA	3	2476	2486	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_004312	TAAA	3	2537	2547	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_004312	AAAT	5	2941	2961	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_004312	TCAA	3	3695	3706	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
9	NC_004312	TAT	4	3803	3813	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_004312	AT	6	4474	4484	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_004312	TTA	4	4520	4531	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_004312	TAA	4	4796	4806	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_004312	TCAT	3	5503	5513	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	23505431
14	NC_004312	GCTTTA	3	5564	5581	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	23505431
15	NC_004312	TAAA	3	6573	6583	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_004312	TTAAA	3	6677	6690	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_004312	AT	6	6897	6907	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_004312	ATA	5	7479	7494	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_004312	TTTTA	3	7687	7700	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_004312	TAT	5	7726	7739	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_004312	TAGT	3	8015	8025	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_004312	TATT	3	8192	8203	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004312	TTTA	3	8323	8335	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_004312	TTA	4	8477	8488	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_004312	TAA	4	9063	9073	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_004312	TTATAT	3	9214	9231	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004312	TA	6	9433	9443	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_004312	ATTA	3	9463	9473	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_004312	AT	6	9687	9697	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_004312	CATTA	3	10145	10159	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
31	NC_004312	TTTAT	3	10686	10699	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_004312	CTT	4	10961	10973	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	23505432
33	NC_004312	TAG	4	11573	11584	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	23505432
34	NC_004312	TAT	5	11606	11620	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	23505432
35	NC_004312	AT	7	12020	12032	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_004312	TAAA	3	12095	12105	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_004312	TTTA	3	13376	13386	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_004312	TAA	4	13662	13675	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_004312	ATT	7	13923	13944	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_004312	TTTC	3	13968	13978	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
41	NC_004312	ATT	4	14355	14366	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23505433
42	NC_004312	ATA	4	15020	15031	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_004312	CTTT	3	15762	15774	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
44	NC_004312	GTG	4	16045	16056	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	23505435
45	NC_004312	AAATT	3	16971	16985	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_004312	AAAT	3	17323	17334	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004312	AAGT	3	17374	17384	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_004312	TAT	4	17442	17454	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_004312	ATA	5	17631	17644	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_004312	TTA	4	18024	18035	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_004312	TTA	4	18131	18141	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_004312	TAA	4	18166	18177	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_004312	TAAA	3	18217	18227	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_004312	ATAA	3	18244	18255	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_004312	TTTA	3	18315	18326	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004312	AATT	3	18622	18632	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_004312	TTTA	3	19031	19042	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_004312	TTTTA	3	19497	19510	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_004312	ATTT	3	20089	20100	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_004312	AT	6	20352	20362	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_004312	ATT	4	20672	20682	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	23505436
62	NC_004312	ATA	5	21430	21444	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	23505436
63	NC_004312	TAT	5	22585	22598	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	23505436
64	NC_004312	ATA	4	23892	23905	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_004312	CTAA	3	23921	23932	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_004312	TTAT	3	24045	24056	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004312	TAT	5	24099	24113	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_004312	CTT	4	24233	24244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_004312	TTA	4	24342	24352	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_004312	ATT	4	24388	24400	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_004312	TA	6	24408	24418	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_004312	AAGA	3	24591	24602	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_004312	TTTAA	3	25607	25621	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_004312	CAG	4	25920	25931	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
75	NC_004312	ATT	4	27128	27138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_004312	GTTT	3	27957	27967	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	23505438
77	NC_004312	GGT	4	29584	29595	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	23505438
78	NC_004312	TAAA	3	29934	29946	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	23505438
79	NC_004312	TACT	3	31408	31418	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	23505438
80	NC_004312	TTAT	3	31522	31533	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	23505438
81	NC_004312	ATT	4	33208	33220	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	23505438
82	NC_004312	TAA	4	34933	34944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23505438
83	NC_004312	GTA	4	35030	35041	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	23505438
84	NC_004312	AAAAT	3	35874	35887	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	23505438
85	NC_004312	TATACT	3	36732	36749	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
86	NC_004312	TTA	4	36829	36841	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_004312	TTTA	3	37281	37291	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_004312	TTTA	3	37395	37405	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_004312	ATTT	3	37542	37552	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_004312	TTAT	3	38309	38319	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_004312	TAT	4	38386	38397	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_004312	TCAA	3	38529	38539	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_004312	TA	6	38560	38570	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_004312	ATTT	3	38578	38589	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004312	ATTT	3	38715	38725	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_004312	TTAT	3	38824	38836	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_004312	TTTA	3	38841	38851	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_004312	TAA	4	38890	38901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_004312	ATAA	3	38916	38927	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_004312	AATT	3	38960	38970	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_004312	TATAAA	3	39378	39395	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
102	NC_004312	TTAA	3	39432	39443	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_004312	ATTTTT	3	39561	39579	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
104	NC_004312	TTCT	3	39854	39865	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004312	TATT	5	40000	40020	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_004312	TTATTT	3	40355	40372	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004312	ATTT	3	40415	40426	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_004312	AAT	4	40673	40685	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
109	NC_004312	TAT	4	40792	40803	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_004312	ATAA	3	41467	41478	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004312	AT	6	41570	41580	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_004312	AATT	3	41787	41798	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	23505444
113	NC_004312	CTATTG	3	41859	41876	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	23505444
114	NC_004312	ATA	4	42000	42011	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23505444
115	NC_004312	TAAA	3	42844	42855	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_004312	AAAT	3	43216	43228	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_004312	ATT	4	43509	43521	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_004312	ATAA	3	43724	43735	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_004312	TATT	3	43889	43900	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_004312	ATTT	3	44157	44167	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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