ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Psilotum nudum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003386	TGTT	4	966	981	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_003386	AAT	4	1703	1714	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_003386	TAA	4	4916	4927	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_003386	TGA	4	4944	4954	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_003386	GATA	3	5718	5728	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_003386	AACT	3	5788	5798	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_003386	AGA	4	6134	6144	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_003386	TCT	4	7744	7754	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	18860290
9	NC_003386	TA	6	8618	8628	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_003386	CTAA	3	8667	8677	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_003386	TTAG	3	8728	8738	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_003386	ATC	4	9349	9359	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	18860291
13	NC_003386	TA	6	10605	10615	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_003386	AGCT	3	10967	10978	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_003386	AATT	3	11354	11364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_003386	AAGA	3	11652	11662	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_003386	TCTT	3	12811	12821	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	18860292
18	NC_003386	CTTT	3	13544	13555	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_003386	AG	6	13582	13592	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_003386	T	12	14016	14027	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_003386	GAT	4	14454	14464	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_003386	TTTA	3	15434	15445	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_003386	T	12	15659	15670	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_003386	CAG	4	18975	18986	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	18860298
25	NC_003386	A	16	19379	19394	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_003386	TTAA	3	20555	20566	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18860300
27	NC_003386	TCAA	3	21627	21638	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	126022796
28	NC_003386	AGG	4	24138	24149	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	126022796
29	NC_003386	AATC	3	25116	25126	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	126022796
30	NC_003386	AT	6	29276	29287	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18860303
31	NC_003386	TCG	4	30307	30318	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	18860303
32	NC_003386	AAT	4	31943	31955	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_003386	A	14	32730	32743	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003386	ATT	4	32883	32893	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_003386	CTAT	3	32973	32984	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
36	NC_003386	CTT	4	33470	33481	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003386	TAG	4	34029	34040	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_003386	ATCT	3	34660	34670	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_003386	CT	8	35104	35118	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
40	NC_003386	AAGC	3	35797	35807	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	126022797
41	NC_003386	T	13	37879	37891	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003386	TCT	4	38127	38138	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_003386	TAGA	3	38342	38352	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_003386	ATT	4	39760	39770	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_003386	TTTTC	3	40086	40100	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	18860309
46	NC_003386	T	12	40283	40294	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_003386	TAT	4	40998	41009	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18860310
48	NC_003386	TC	6	44795	44805	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
49	NC_003386	A	15	45465	45479	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	18860312
50	NC_003386	T	13	47297	47309	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003386	TTAT	3	48641	48651	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_003386	AT	7	48752	48765	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_003386	T	14	49616	49629	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_003386	TCTT	3	52448	52458	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_003386	TTGT	3	53011	53021	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_003386	TTCC	3	55509	55519	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
57	NC_003386	A	18	55563	55580	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_003386	GAAC	3	58144	58156	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	18860320
59	NC_003386	TTAG	3	59336	59348	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_003386	TAA	4	59557	59567	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_003386	AAAT	3	59580	59592	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_003386	AAT	6	59614	59631	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_003386	ATA	4	61703	61713	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18860323
64	NC_003386	TAA	5	63118	63131	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_003386	A	13	63610	63622	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_003386	AT	6	64512	64522	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_003386	ACT	4	64964	64975	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
68	NC_003386	TAA	4	65164	65175	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_003386	AATG	3	65401	65411	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_003386	AGA	5	65502	65516	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_003386	AAAG	3	65588	65599	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_003386	TTTA	4	66621	66636	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_003386	AT	6	68187	68198	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_003386	GGAT	3	68832	68842	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_003386	T	14	69181	69194	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	18860359
76	NC_003386	TTAT	3	69448	69458	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18860359
77	NC_003386	TTA	4	69680	69691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18860359
78	NC_003386	ATAA	3	69787	69798	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18860359
79	NC_003386	TTTA	3	70240	70251	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18860359
80	NC_003386	TTTTC	3	70341	70354	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	18860359
81	NC_003386	CTTT	3	70639	70650	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	18860359
82	NC_003386	TATAGA	3	73011	73028	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	18860359
83	NC_003386	CCTT	3	73281	73292	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	18860359
84	NC_003386	AATT	3	73866	73876	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18860359
85	NC_003386	TAG	4	74253	74264	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	18860359
86	NC_003386	GAAA	3	74323	74335	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	18860359
87	NC_003386	TTTA	3	75556	75566	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18860359
88	NC_003386	TTC	4	75943	75954	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	18860359
89	NC_003386	TAAT	3	76692	76703	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18860359
90	NC_003386	ATTC	3	77035	77045	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	18860359
91	NC_003386	CATA	3	78695	78706	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	18860359
92	NC_003386	ATTT	3	79171	79182	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18860359
93	NC_003386	ATT	4	79244	79255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18860359
94	NC_003386	A	17	79375	79391	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	18860359
95	NC_003386	TTA	4	80689	80700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18860359
96	NC_003386	TA	8	80780	80794	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	18860359
97	NC_003386	T	16	81106	81121	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	18860359
98	NC_003386	ATT	4	81122	81134	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18860359
99	NC_003386	ATA	4	81217	81228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18860359
100	NC_003386	TTTCT	3	82258	82272	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	18860359
101	NC_003386	ACG	4	82567	82578	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	18860359
102	NC_003386	TTAT	3	83389	83400	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18860359
103	NC_003386	CCT	4	83833	83843	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	18860359
104	NC_003386	AT	6	84001	84012	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18860359
105	NC_003386	TTAT	3	84032	84043	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18860359
106	NC_003386	TTA	4	84339	84350	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18860359
107	NC_003386	AGAA	3	85013	85024	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	18860359
108	NC_003386	TCT	4	85406	85418	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	18860359
109	NC_003386	AGAA	3	86107	86119	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	18860359
110	NC_003386	AAGG	3	87233	87244	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	18860359
111	NC_003386	CTAA	3	87451	87461	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	18860359
112	NC_003386	GCT	4	90272	90283	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	18860335
113	NC_003386	TATG	3	90546	90556	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	18860335
114	NC_003386	T	12	91036	91047	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	18860335
115	NC_003386	AT	6	91050	91061	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18860335
116	NC_003386	GA	6	92948	92959	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	18860335
117	NC_003386	CTC	4	93314	93326	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	18860335
118	NC_003386	GGT	4	93655	93667	13	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	18860335
119	NC_003386	GAGG	3	96452	96463	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	18860335
120	NC_003386	AGGT	3	96666	96677	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	18860335
121	NC_003386	CTA	4	98914	98926	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	18860335
122	NC_003386	GGGA	3	99224	99234	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	18860335
123	NC_003386	TCA	4	99240	99252	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	18860335
124	NC_003386	CA	6	99261	99272	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	18860335
125	NC_003386	AG	6	100327	100338	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	18860335
126	NC_003386	GCAA	3	100866	100876	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	18860335
127	NC_003386	TTGAAG	3	101550	101566	17	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	18860335
128	NC_003386	GAAA	3	102522	102532	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	18860335
129	NC_003386	AGAT	3	102951	102962	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	18860335
130	NC_003386	ATAGAT	3	102972	102989	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	18860335
131	NC_003386	AGAA	3	103134	103145	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	18860335
132	NC_003386	T	16	104807	104822	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	18860335
133	NC_003386	ATTT	3	104844	104856	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	18860335
134	NC_003386	AAAT	3	104881	104891	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18860335
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170	NC_003386	CCTT	3	136203	136214	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	18860389
171	NC_003386	TTGG	3	137971	137982	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
172	NC_003386	TAGA	3	138028	138038	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
173	NC_003386	TTCT	3	138423	138434	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	18860390

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Psilotum nudum chloroplast