ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ostrinia furnacalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003368	TAT	4	97	107	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_003368	T	17	251	267	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	18314305
3	NC_003368	TAT	4	448	459	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314305
4	NC_003368	ATT	4	677	687	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314305
5	NC_003368	TTTA	3	816	827	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18314305
6	NC_003368	ATTA	3	915	926	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18314305
7	NC_003368	ATT	4	928	939	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314305
8	NC_003368	TTTA	3	1029	1039	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18314305
9	NC_003368	TTTATA	3	1093	1111	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	18314305
10	NC_003368	TTTA	3	1112	1123	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18314305
11	NC_003368	T	12	1219	1230	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	18314305
12	NC_003368	ATT	7	2008	2028	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314306
13	NC_003368	GGA	4	2102	2112	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	18314306
14	NC_003368	GAAA	3	2220	2231	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	18314306
15	NC_003368	ATT	4	3285	3295	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314307
16	NC_003368	CATTA	3	3317	3330	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	18314307
17	NC_003368	AATT	3	3705	3715	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18314307
18	NC_003368	ATT	5	3833	3846	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_003368	TAT	7	3908	3928	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314308
20	NC_003368	TATTAA	3	3953	3970	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	18314308
21	NC_003368	TAA	4	3986	3997	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18314308
22	NC_003368	TTTTAT	3	4225	4242	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	18314309
23	NC_003368	ATT	4	4840	4850	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314310
24	NC_003368	TAT	5	5573	5587	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18314311
25	NC_003368	T	13	5828	5840	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	18314311
26	NC_003368	ATT	5	5838	5851	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18314311
27	NC_003368	TAAA	3	6364	6375	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	18314312
28	NC_003368	TAT	4	6671	6682	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314312
29	NC_003368	ATT	4	6768	6779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314312
30	NC_003368	AATA	3	6903	6914	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18314312
31	NC_003368	TAT	4	7082	7092	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314312
32	NC_003368	TAAA	3	7114	7124	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18314312
33	NC_003368	TTA	4	7189	7200	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314312
34	NC_003368	ATA	5	7294	7308	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314312
35	NC_003368	AAT	5	7478	7492	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314312
36	NC_003368	ATAAA	3	7531	7544	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18314312
37	NC_003368	TAAA	3	7586	7598	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	18314312
38	NC_003368	TAA	4	7732	7744	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	18314312
39	NC_003368	ATA	5	7944	7958	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314312
40	NC_003368	ATA	4	7962	7972	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18314312
41	NC_003368	AAAAAT	3	8004	8021	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	18314312
42	NC_003368	TAA	4	8177	8191	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314313
43	NC_003368	AATATA	3	8302	8319	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	18314313
44	NC_003368	ATT	4	8948	8958	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314313
45	NC_003368	AAAT	3	9024	9034	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18314313
46	NC_003368	AAAAT	3	9113	9126	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18314313
47	NC_003368	TA	7	9153	9165	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	18314313
48	NC_003368	AT	6	9303	9314	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18314313
49	NC_003368	AATAT	3	9598	9612	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	18314314
50	NC_003368	ATA	5	9719	9733	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314314
51	NC_003368	ATT	5	9872	9886	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_003368	TAT	4	9946	9956	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314315
53	NC_003368	TCTA	3	10093	10104	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	18314315
54	NC_003368	TAT	5	10158	10171	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18314315
55	NC_003368	TAA	7	10338	10358	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	18314315
56	NC_003368	TATT	4	10357	10372	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	18314315
57	NC_003368	TAA	5	11018	11032	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314316
58	NC_003368	TAT	4	11145	11155	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314316
59	NC_003368	AATTTT	3	11340	11357	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	18314316
60	NC_003368	TTAA	4	11666	11682	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_003368	TTA	4	13106	13118	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_003368	AATT	3	13178	13190	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_003368	TAA	4	13190	13202	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_003368	ATTA	6	13653	13676	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_003368	AATT	3	13945	13955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_003368	AAAAT	3	14211	14224	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ostrinia furnacalis mitochondrion