ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ostrinia nubilalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003367	TAT	4	97	107	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_003367	T	17	251	267	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	18314291
3	NC_003367	TAT	4	448	459	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314291
4	NC_003367	ATT	4	677	687	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314291
5	NC_003367	TTTA	3	816	827	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	18314291
6	NC_003367	TTTA	3	1029	1039	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18314291
7	NC_003367	AATTAA	3	1135	1152	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	18314291
8	NC_003367	T	12	1219	1230	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	18314291
9	NC_003367	ATT	7	2008	2028	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314292
10	NC_003367	GAAA	3	2220	2231	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	18314292
11	NC_003367	ATT	4	3285	3295	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314293
12	NC_003367	CATTA	3	3317	3330	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	18314293
13	NC_003367	AATT	3	3705	3715	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18314293
14	NC_003367	TAT	4	3832	3842	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_003367	TATTAA	3	3950	3967	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	18314294
16	NC_003367	TAA	4	3983	3994	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18314294
17	NC_003367	TTTTAT	3	4222	4239	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	18314295
18	NC_003367	ATT	4	4837	4847	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314296
19	NC_003367	TAT	5	5571	5585	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18314297
20	NC_003367	T	13	5826	5838	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	18314297
21	NC_003367	ATT	5	5836	5849	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18314297
22	NC_003367	TTAA	3	5974	5985	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_003367	TAAA	3	6359	6370	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	18314298
24	NC_003367	TAT	4	6666	6677	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314298
25	NC_003367	ATT	4	6763	6774	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314298
26	NC_003367	AATA	3	6898	6909	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18314298
27	NC_003367	TAT	4	7077	7087	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314298
28	NC_003367	TAAA	3	7109	7119	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18314298
29	NC_003367	TTA	4	7184	7195	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18314298
30	NC_003367	ATA	5	7289	7303	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314298
31	NC_003367	AAT	5	7473	7487	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314298
32	NC_003367	ATAAA	3	7526	7539	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18314298
33	NC_003367	TAAA	3	7581	7593	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	18314298
34	NC_003367	TAA	4	7727	7739	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	18314298
35	NC_003367	ATA	5	7939	7953	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314298
36	NC_003367	ATA	4	7957	7967	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18314298
37	NC_003367	AAAAAT	3	7999	8016	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	18314298
38	NC_003367	ATC	4	8412	8423	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	18314299
39	NC_003367	ATT	4	8943	8953	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314299
40	NC_003367	AAAT	3	9019	9029	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18314299
41	NC_003367	AAAAT	3	9108	9121	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18314299
42	NC_003367	TA	7	9148	9160	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	18314299
43	NC_003367	ATA	5	9714	9728	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314300
44	NC_003367	ATT	5	9868	9882	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_003367	TCTA	3	10089	10100	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	18314301
46	NC_003367	TAT	5	10154	10167	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18314301
47	NC_003367	AATC	3	10233	10243	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	18314301
48	NC_003367	TAA	7	10334	10354	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	18314301
49	NC_003367	TATT	4	10353	10368	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	18314301
50	NC_003367	TAA	5	11014	11028	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18314302
51	NC_003367	TAT	4	11141	11151	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18314302
52	NC_003367	AATTTT	3	11336	11353	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	18314302
53	NC_003367	ACTT	4	11665	11680	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
54	NC_003367	TAAAA	3	12288	12301	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18314303
55	NC_003367	TTA	4	13106	13118	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_003367	AATT	3	13178	13190	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_003367	TAA	4	13190	13202	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_003367	ATTA	6	13653	13676	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_003367	AATT	3	13945	13955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_003367	AAAAT	3	14211	14224	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ostrinia nubilalis mitochondrion