ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Spizellomyces punctatus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003052	ATGA	3	712	722	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_003052	TTTG	3	3596	3606	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_003052	TTA	5	3927	3941	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_003052	TA	6	5700	5711	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_003052	AAAG	3	5980	5991	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	15147294
6	NC_003052	AAAT	3	7631	7642	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_003052	ATTAA	3	7925	7938	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	15147295
8	NC_003052	TAGCA	3	8063	8078	16	40 %	20 %	20 %	20 %	6 %	15147295
9	NC_003052	AG	6	8577	8587	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	15147295
10	NC_003052	ATT	4	8607	8618	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147295
11	NC_003052	GAA	4	9815	9826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	15147296
12	NC_003052	AGA	7	11053	11073	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	15147298
13	NC_003052	CTTTAC	6	11835	11870	36	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	15147299
14	NC_003052	ACT	4	13624	13635	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	15147300
15	NC_003052	TTAA	3	13844	13854	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15147300
16	NC_003052	ATAA	3	14326	14336	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	15147300
17	NC_003052	TAGG	3	15212	15222	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	15147302
18	NC_003052	ATA	4	15244	15254	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15147302
19	NC_003052	CCAT	3	16221	16231	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	15147302
20	NC_003052	TAAA	5	16297	16315	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	15147302
21	NC_003052	TAA	4	16874	16885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147302
22	NC_003052	ATTT	3	17304	17315	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15147302
23	NC_003052	TTA	4	17391	17401	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_003052	ATA	4	18452	18464	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_003052	AATTA	3	18468	18482	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	15147303
26	NC_003052	TTTC	3	19609	19620	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_003052	CCAAC	7	19869	19903	35	40 %	0 %	0 %	60 %	5 %	Non-Coding
28	NC_003052	TAC	4	20056	20066	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
29	NC_003052	TAA	4	20244	20254	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_003052	TAT	4	20917	20929	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15147305
31	NC_003052	TAC	4	22315	22326	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147305
32	NC_003052	TAT	4	22407	22418	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147305
33	NC_003052	TTA	4	24430	24441	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_003052	ATTA	3	24599	24610	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_003052	TAA	4	25050	25061	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_003052	TAA	4	25067	25079	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_003052	TAA	4	25536	25547	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147308
38	NC_003052	ATA	4	25673	25684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147308
39	NC_003052	ACT	4	25843	25854	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147308
40	NC_003052	AAAG	3	27880	27891	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_003052	TAGA	3	28153	28165	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	15147310
42	NC_003052	GTA	4	28791	28802	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15147310
43	NC_003052	ATA	4	28987	28998	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147310
44	NC_003052	T	14	29488	29501	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	15147310
45	NC_003052	TCTA	3	29707	29718	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
46	NC_003052	ATA	4	29821	29831	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_003052	TTA	4	30239	30251	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15147311
48	NC_003052	TTA	4	30420	30431	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147311
49	NC_003052	TGCT	3	30764	30776	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	15147311
50	NC_003052	GTATT	3	31132	31147	16	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	15147311
51	NC_003052	CTTTA	3	31261	31275	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	15147311
52	NC_003052	AATT	3	31690	31700	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15147312
53	NC_003052	GTAA	3	31718	31728	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	15147312
54	NC_003052	TAA	4	31939	31950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	15147312
55	NC_003052	TA	6	32540	32550	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_003052	A	15	33212	33226	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_003052	ATA	4	33730	33741	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_003052	AGT	4	34658	34669	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_003052	AAAT	3	35506	35517	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_003052	CAA	4	35889	35900	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
61	NC_003052	ATA	4	37185	37196	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147313
62	NC_003052	AAT	4	37297	37309	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15147313
63	NC_003052	ATA	4	39002	39013	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_003052	TAG	4	41180	41191	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_003052	TTAA	3	41432	41443	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_003052	TTAA	3	41446	41456	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_003052	AT	6	42942	42953	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15147316
68	NC_003052	TCAA	3	44077	44088	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
69	NC_003052	CAG	4	44113	44124	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
70	NC_003052	A	12	45112	45123	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_003052	TA	6	45909	45919	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_003052	AGT	4	46231	46241	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	15147318
73	NC_003052	T	12	48698	48709	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	15147319
74	NC_003052	ATATGC	3	49289	49306	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
75	NC_003052	AT	6	49933	49943	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	15147320
76	NC_003052	TCG	4	49954	49964	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	15147320
77	NC_003052	CAT	4	50101	50112	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147320
78	NC_003052	ACT	4	51729	51740	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147320
79	NC_003052	TAT	4	52324	52335	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147320
80	NC_003052	CTA	4	52525	52536	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147320
81	NC_003052	ATTA	3	53111	53122	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15147320
82	NC_003052	CT	7	53215	53227	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	15147320
83	NC_003052	ATTT	3	53253	53264	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15147320
84	NC_003052	TAC	4	53484	53495	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
85	NC_003052	ATT	4	54613	54625	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15147323
86	NC_003052	ACT	4	55097	55109	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	15147324
87	NC_003052	CAAT	3	56693	56704	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_003052	TAA	4	56757	56768	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_003052	TGA	4	58093	58104	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_003052	ATCT	3	58555	58567	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding

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