ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Schizophyllum commune mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003049	AAAT	3	16	26	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_003049	AAAATA	3	242	259	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_003049	AAGGA	3	326	340	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003049	AATT	3	2036	2046	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_003049	ATA	4	3527	3538	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_003049	ATAAA	4	3810	3828	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
7	NC_003049	AATT	3	3902	3913	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003049	TTATAA	5	4323	4352	30	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_003049	AAGA	5	4362	4380	19	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
10	NC_003049	AGAAAT	3	4378	4395	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_003049	ATA	4	4547	4559	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_003049	TAA	4	4572	4583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_003049	TAAA	3	4768	4780	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_003049	AAGA	3	4875	4886	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_003049	TAA	4	5240	5250	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_003049	ATTT	3	5539	5549	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_003049	TAAT	4	5770	5785	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_003049	ATA	4	5788	5802	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_003049	AAAT	3	5961	5971	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_003049	TAAA	3	5979	5989	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_003049	AAT	4	6065	6075	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_003049	TAA	4	6394	6405	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_003049	ATTT	3	7831	7843	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_003049	ATTT	3	8123	8138	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_003049	TTTAA	3	8334	8349	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_003049	TAG	4	8399	8409	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_003049	ATA	5	8434	8448	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_003049	AAAT	3	8701	8711	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_003049	TAA	4	8762	8774	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_003049	ATAC	3	9147	9158	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
31	NC_003049	TAG	4	9519	9530	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15088704
32	NC_003049	TTTA	3	10295	10306	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003049	TTAAAA	3	10311	10327	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_003049	TTATAA	4	10391	10414	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_003049	AGTT	3	10651	10662	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_003049	ATAA	3	10786	10798	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_003049	CAAA	3	10827	10838	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
38	NC_003049	TTAA	3	10842	10852	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_003049	TAA	4	10918	10929	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_003049	TAA	4	10932	10942	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_003049	TCT	4	11235	11246	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	15088705
42	NC_003049	ATA	4	11669	11680	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
43	NC_003049	ATA	4	11879	11890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
44	NC_003049	TAT	4	11922	11933	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088705
45	NC_003049	ATA	5	11972	11985	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15088705
46	NC_003049	AATTT	3	12199	12212	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	15088705
47	NC_003049	TAA	4	12279	12290	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
48	NC_003049	TAAAAA	4	12555	12578	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	15088705
49	NC_003049	TAA	6	12579	12596	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	15088705
50	NC_003049	AATT	3	12606	12617	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	15088705
51	NC_003049	TTA	4	12974	12985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088705
52	NC_003049	AAT	4	13243	13254	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
53	NC_003049	TAA	5	13506	13520	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	15088705
54	NC_003049	TTTA	3	13545	13555	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	15088705
55	NC_003049	ATA	4	13685	13695	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15088705
56	NC_003049	ATA	4	13994	14005	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
57	NC_003049	CTTA	3	14789	14800	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	15088705
58	NC_003049	ATA	4	14918	14929	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
59	NC_003049	AAGAAA	3	14955	14972	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	15088705
60	NC_003049	TAA	4	15393	15404	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
61	NC_003049	TATT	3	16229	16240	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_003049	AATT	3	16329	16339	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_003049	GTTAAT	3	16405	16423	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
64	NC_003049	CTAA	3	17186	17197	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	15088706
65	NC_003049	AAT	4	17412	17425	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15088706
66	NC_003049	ATA	5	17561	17575	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	15088706
67	NC_003049	TAAA	3	18548	18559	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_003049	ATTTA	3	18696	18709	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_003049	TAAA	4	18907	18922	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_003049	TTAT	3	18974	18985	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_003049	TTTAA	3	19380	19393	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_003049	AAT	4	19528	19538	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_003049	AAGG	3	19855	19866	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_003049	TTAA	4	19972	19987	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003049	ATT	4	20019	20030	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_003049	AT	6	20193	20203	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_003049	TTAAT	3	20269	20283	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_003049	TAAATT	3	20319	20336	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_003049	TAAT	3	20424	20435	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003049	TAAA	3	20632	20642	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_003049	ATA	4	20694	20705	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_003049	AAAT	3	20730	20741	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_003049	CTA	4	20841	20852	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15088708
84	NC_003049	TAT	4	21393	21404	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088708
85	NC_003049	TA	7	21461	21474	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_003049	AT	6	21622	21633	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_003049	TTAAT	3	21644	21658	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_003049	TATT	3	21904	21915	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003049	ATA	4	22055	22066	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088709
90	NC_003049	TTAA	3	22679	22689	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_003049	TTATA	3	22831	22844	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_003049	ATTT	3	23042	23052	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_003049	TTTTA	4	23122	23140	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
94	NC_003049	AT	7	23308	23320	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_003049	AAAT	3	23460	23471	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_003049	TAA	7	23486	23509	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_003049	TAGT	3	24202	24212	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	15088710
98	NC_003049	ATAAT	3	24811	24825	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	15088710
99	NC_003049	TAAA	3	24828	24839	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003049	TTAA	3	24849	24859	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_003049	TTTA	3	25108	25118	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_003049	TAA	4	25151	25161	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_003049	AAAG	4	25222	25236	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_003049	TTA	5	25328	25344	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
105	NC_003049	AAAT	3	25419	25430	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_003049	ATA	4	25440	25451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_003049	TAATTA	4	25749	25772	24	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
108	NC_003049	TA	6	25874	25884	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_003049	ATT	5	25985	25998	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_003049	TAT	4	26668	26679	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_003049	TAAA	3	26759	26770	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_003049	TTTA	3	26772	26782	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_003049	ATTT	3	26816	26826	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_003049	ATTT	3	26842	26853	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_003049	ATT	4	27124	27135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_003049	ATTT	3	27207	27219	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_003049	TTTA	3	27228	27238	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_003049	A	17	27331	27347	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
119	NC_003049	TTA	4	27478	27488	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_003049	TATT	3	27652	27664	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_003049	TAT	4	27917	27927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_003049	TAAA	3	27936	27946	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_003049	TATT	3	28601	28611	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	15088711
124	NC_003049	TTC	4	28962	28973	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	15088711
125	NC_003049	ATCT	3	29081	29091	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	15088711
126	NC_003049	TTA	4	29548	29558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_003049	TAT	4	29847	29858	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_003049	A	13	29953	29965	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_003049	AAATT	5	30050	30075	26	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_003049	TA	8	30295	30309	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_003049	TTA	4	31234	31245	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088712
132	NC_003049	AATTAT	3	31475	31491	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	15088712
133	NC_003049	TATT	3	31791	31801	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	15088713
134	NC_003049	TAT	4	32126	32137	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088713
135	NC_003049	TTAA	3	32294	32304	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_003049	TTTA	3	32688	32699	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	15088714
137	NC_003049	GAA	4	32829	32841	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	15088714
138	NC_003049	TTA	4	33723	33733	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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183	NC_003049	TTTTAA	3	49669	49687	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Schizophyllum commune mitochondrion