ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Oenothera elata subsp. hookeri plastid plastome I

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_002693GAAC31091191150 %0 %25 %25 %9 %Non-Coding
2NC_002693CAG49589691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %13518299
3NC_002693AAGT3106410741150 %25 %25 %0 %9 %13518299
4NC_002693AT6156715771150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_002693TACTCT3178117971716.67 %50 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
6NC_002693GAA4276327741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13518300
7NC_002693TCTTTC330313047170 %66.67 %0 %33.33 %5 %13518300
8NC_002693A124409442012100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_002693TAA4475347641266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_002693CT648564866110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
11NC_002693TTTA3505250621125 %75 %0 %0 %9 %13518301
12NC_002693TCTCT350925105140 %60 %0 %40 %7 %13518301
13NC_002693T1457065719140 %100 %0 %0 %0 %13518301
14NC_002693TTA4578657971233.33 %66.67 %0 %0 %8 %13518301
15NC_002693CCAT3651365241225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
16NC_002693CCAT3662066311225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
17NC_002693CCAT3689169021225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
18NC_002693CCAT3701570261225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
19NC_002693AAAG3901690271275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
20NC_002693AGA411491115011166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
21NC_002693ATC411675116851133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
22NC_002693AAGA312328123381175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
23NC_002693A16123861240116100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
24NC_002693AAGA513250132681975 %0 %25 %0 %10 %Non-Coding
25NC_002693TTG41371813728110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
26NC_002693CAATT313753137661440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
27NC_002693ATA415955159651166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
28NC_002693AGG415973159831133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
29NC_002693AAAAG316007160211580 %0 %20 %0 %6 %Non-Coding
30NC_002693A18163861640318100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
31NC_002693AACAA416600166181980 %0 %0 %20 %10 %Non-Coding
32NC_002693T141708017093140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
33NC_002693TTTA317765177761225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_002693AGA417830178401166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
35NC_002693TA617932179421150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
36NC_002693TCTA318111181211125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
37NC_002693AATGA320023200371560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
38NC_002693CA620264202741150 %0 %0 %50 %9 %Non-Coding
39NC_002693ATT420762207731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %164597810
40NC_002693AAAG320818208281175 %0 %25 %0 %9 %164597810
41NC_002693T142265522668140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
42NC_002693AT622896229071250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_002693TTCA323041230521225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
44NC_002693AATA323168231791275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_002693TACT328853288641225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
46NC_002693TCATT329107291201420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
47NC_002693AG629146291561150 %0 %50 %0 %9 %13518316
48NC_002693TAA429400294101166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
49NC_002693CT62976229772110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
50NC_002693CTTTTT32988129898180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
51NC_002693CTG43004530056120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %164597814
52NC_002693AAGC330539305491150 %0 %25 %25 %9 %164597814
53NC_002693AATC332657326671150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
54NC_002693AT633204332151250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
55NC_002693A13332573326913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
56NC_002693T143350633519140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
57NC_002693A12344043441512100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
58NC_002693TTTTC43547435492190 %80 %0 %20 %5 %Non-Coding
59NC_002693TAAAAA336878368961983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
60NC_002693ATT436942369521133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
61NC_002693TTCTT33735237365140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
62NC_002693ATT438888388991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
63NC_002693AT639506395161150 %50 %0 %0 %9 %164597817
64NC_002693TATC339662396721125 %50 %0 %25 %9 %164597817
65NC_002693TAGG341608416181125 %25 %50 %0 %9 %164597817
66NC_002693AAC442542425531266.67 %0 %0 %33.33 %8 %164597818
67NC_002693ATTT343441434511125 %75 %0 %0 %9 %164597818
68NC_002693TA644876448861150 %50 %0 %0 %9 %164597818
69NC_002693AT646206462171250 %50 %0 %0 %8 %164597819
70NC_002693AAAAG349608496211480 %0 %20 %0 %7 %164597819
71NC_002693T134978849800130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
72NC_002693GTT55135551369150 %66.67 %33.33 %0 %6 %164597821
73NC_002693AAG751813518332166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
74NC_002693AGTT352397524071125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
75NC_002693ATTTT352478524911420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
76NC_002693A14530715308414100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
77NC_002693A16540135402816100 %0 %0 %0 %6 %164597822
78NC_002693TGT45482954840120 %66.67 %33.33 %0 %8 %164597823
79NC_002693TCT45498154991110 %66.67 %0 %33.33 %9 %164597823
80NC_002693AGAC355126551371250 %0 %25 %25 %0 %164597823
81NC_002693TAT456293563041233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
82NC_002693A16570285704316100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
83NC_002693CTTT35720757218120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
84NC_002693AAAT557662576801975 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
85NC_002693TAA457851578621266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
86NC_002693TA758126581381350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
87NC_002693AT758146581581350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
88NC_002693AT758168581801350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
89NC_002693AT758190582021350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
90NC_002693AT658212582221150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
91NC_002693T125857858589120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_002693T135884358855130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
93NC_002693A15588585887215100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
94NC_002693T135937859390130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
95NC_002693T175948659502170 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
96NC_002693ATGG360789608001225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
97NC_002693TTA460921609321233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
98NC_002693TAATTA363989640071950 %50 %0 %0 %10 %164597824
99NC_002693TTA464953649631133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
100NC_002693GATC365384653961325 %25 %25 %25 %7 %164597825
101NC_002693T136611466126130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
102NC_002693A17664826649817100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
103NC_002693AT667420674301150 %50 %0 %0 %9 %13518346
104NC_002693TCT46840668418130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
105NC_002693AAAG368910689211275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
106NC_002693T157059170605150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
107NC_002693AGT571030710441533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
108NC_002693AAAT371104711151275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
109NC_002693A25711287115225100 %0 %0 %0 %4 %Non-Coding
110NC_002693TGAT371324713351225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
111NC_002693ATTA371887718981250 %50 %0 %0 %0 %13518352
112NC_002693AT772470724821350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
113NC_002693TAT472510725221333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
114NC_002693AT872517725311550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
115NC_002693ATT473282732931233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
116NC_002693TTTC37337473385120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
117NC_002693ACAA373625736361275 %0 %0 %25 %8 %13518354
118NC_002693TGAA374839748501250 %25 %25 %0 %8 %Non-Coding
119NC_002693T137499475006130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
120NC_002693T127617076181120 %100 %0 %0 %0 %13518409
121NC_002693AAGA376751767621275 %0 %25 %0 %8 %13518409
122NC_002693GTC47689276902110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %13518409
123NC_002693TCT47867978690120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13518409
124NC_002693T147884878861140 %100 %0 %0 %7 %13518409
125NC_002693GTTT38044880458110 %75 %25 %0 %9 %13518409
126NC_002693ATTCA382697827111540 %40 %0 %20 %6 %13518409
127NC_002693ACGTAA484294843172450 %16.67 %16.67 %16.67 %0 %13518409
128NC_002693TTTAAA385177851941850 %50 %0 %0 %0 %13518409
129NC_002693TCCTT38521585230160 %60 %0 %40 %6 %13518409
130NC_002693A17861708618617100 %0 %0 %0 %5 %13518409
131NC_002693A13861978620913100 %0 %0 %0 %7 %13518409
132NC_002693CTTT38623886248110 %75 %0 %25 %9 %13518409
133NC_002693TTCT38686386874120 %75 %0 %25 %8 %13518409
134NC_002693GAAT387121871321250 %25 %25 %0 %8 %13518409
135NC_002693TTCT38745987470120 %75 %0 %25 %0 %13518409
136NC_002693ACTA388817888271150 %25 %0 %25 %9 %13518409
137NC_002693AT688998890091250 %50 %0 %0 %8 %13518409
138NC_002693TTTTC38903889051140 %80 %0 %20 %7 %13518409
139NC_002693CTT48957189582120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13518409
140NC_002693ATATG391368913821540 %40 %20 %0 %6 %13518409
141NC_002693AT691384913941150 %50 %0 %0 %9 %13518409
142NC_002693GAT491434914441133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13518409
143NC_002693TTCT49294892962150 %75 %0 %25 %6 %13518409
144NC_002693ATCG393596936081325 %25 %25 %25 %7 %13518409
145NC_002693CGTT39406994080120 %50 %25 %25 %8 %13518409
146NC_002693CTTT39411894128110 %75 %0 %25 %9 %13518409
147NC_002693TGG49581895828110 %33.33 %66.67 %0 %9 %13518409
148NC_002693ACA497098971091266.67 %0 %0 %33.33 %0 %13518409
149NC_002693GAC898245982682433.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %13518409
150NC_002693GAAGAG398521985381850 %0 %50 %0 %5 %13518409
151NC_002693GAGGAA998566986195450 %0 %50 %0 %7 %13518409
152NC_002693GAGGAA598623986523050 %0 %50 %0 %3 %13518409
153NC_002693GAA498725987361266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13518409
154NC_002693CTT59885798871150 %66.67 %0 %33.33 %6 %13518409
155NC_002693AAG498926989381366.67 %0 %33.33 %0 %7 %13518409
156NC_002693AGAT31007081007181150 %25 %25 %0 %9 %13518409
157NC_002693TTTC3100976100987120 %75 %0 %25 %8 %13518409
158NC_002693TTC4105068105079120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13518409
159NC_002693ACG41085661085771233.33 %0 %33.33 %33.33 %0 %13518409
160NC_002693ACG81088791089012333.33 %0 %33.33 %33.33 %4 %13518409
161NC_002693ACG81089841090062333.33 %0 %33.33 %33.33 %4 %13518409
162NC_002693ATCC31093991094101225 %25 %0 %50 %8 %13518409
163NC_002693TCTA31097941098051225 %50 %0 %25 %8 %13518409
164NC_002693AAGG31099331099431150 %0 %50 %0 %9 %13518409
165NC_002693GAGG31126701126811225 %0 %75 %0 %8 %13518409
166NC_002693AGGT31128821128931225 %25 %50 %0 %8 %13518409
167NC_002693TAAG31140021140121150 %25 %25 %0 %9 %13518409
168NC_002693ATT41166341166461333.33 %66.67 %0 %0 %7 %13518409
169NC_002693AAG41172911173021266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13518409
170NC_002693AAAT31174651174751175 %25 %0 %0 %9 %13518409
171NC_002693ATAG31179641179751250 %25 %25 %0 %8 %13518409
172NC_002693ATATTA31182361182531850 %50 %0 %0 %5 %13518409
173NC_002693TA81183231183371550 %50 %0 %0 %6 %13518409
174NC_002693A1211848511849612100 %0 %0 %0 %0 %13518409
175NC_002693T13118563118575130 %100 %0 %0 %0 %13518409
176NC_002693TTTG4119243119257150 %75 %25 %0 %6 %13518409
177NC_002693AAAT41192641192791675 %25 %0 %0 %6 %13518409
178NC_002693ACTA31194081194181150 %25 %0 %25 %9 %13518409
179NC_002693T12119697119708120 %100 %0 %0 %8 %13518409
180NC_002693AT101208311208491950 %50 %0 %0 %10 %13518409
181NC_002693AGA41208711208821266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13518409
182NC_002693AGT41209231209331133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13518409
183NC_002693TTA41209881209991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %13518409
184NC_002693TCTT3121128121138110 %75 %0 %25 %9 %13518409
185NC_002693AAT41214461214571266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13518409
186NC_002693AAGA31216051216161275 %0 %25 %0 %8 %13518409
187NC_002693AT71227021227151450 %50 %0 %0 %7 %13518409
188NC_002693ATGA31231141231251250 %25 %25 %0 %8 %13518409
189NC_002693TGAAA31237331237471560 %20 %20 %0 %6 %13518409
190NC_002693CTTT3125066125077120 %75 %0 %25 %8 %13518409
191NC_002693TTC5125498125512150 %66.67 %0 %33.33 %6 %13518409
192NC_002693AT71258051258171350 %50 %0 %0 %7 %13518409
193NC_002693ATA41258831258941266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13518409
194NC_002693AATC31264761264871250 %25 %0 %25 %8 %13518409
195NC_002693CTTT3128827128837110 %75 %0 %25 %9 %13518409
196NC_002693T19128883128901190 %100 %0 %0 %5 %13518409
197NC_002693AT61289001289111250 %50 %0 %0 %8 %13518409
198NC_002693TCA41299301299411233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13518409
199NC_002693TTTTCT3130061130078180 %83.33 %0 %16.67 %5 %13518409
200NC_002693TCT4130092130103120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13518409
201NC_002693T12130279130290120 %100 %0 %0 %0 %13518409
202NC_002693CATTTT31305641305811816.67 %66.67 %0 %16.67 %0 %13518409
203NC_002693TCATTT31306141306311816.67 %66.67 %0 %16.67 %0 %13518409
204NC_002693ATAC31311961312071250 %25 %0 %25 %0 %13518409
205NC_002693T24131844131867240 %100 %0 %0 %8 %13518409
206NC_002693TCTT3132187132198120 %75 %0 %25 %0 %13518409
207NC_002693TCT4133840133850110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13518409
208NC_002693GTTT3134132134143120 %75 %25 %0 %8 %13518409
209NC_002693GTTT3134153134164120 %75 %25 %0 %8 %13518409
210NC_002693GTTT3134174134185120 %75 %25 %0 %8 %13518409
211NC_002693GTTT3134195134206120 %75 %25 %0 %8 %13518409
212NC_002693T12134695134706120 %100 %0 %0 %8 %13518409
213NC_002693T14134751134764140 %100 %0 %0 %7 %13518409
214NC_002693TCTTTA41367361367582316.67 %66.67 %0 %16.67 %4 %13518409
215NC_002693TCTA31370951371061225 %50 %0 %25 %8 %13518409
216NC_002693ATA41375781375891266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13518409
217NC_002693ATTT31375961376061125 %75 %0 %0 %9 %13518409
218NC_002693CATT31380171380271125 %50 %0 %25 %9 %13518409
219NC_002693AAT41384251384371366.67 %33.33 %0 %0 %7 %13518409
220NC_002693TTC4139196139207120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13518409
221NC_002693TAA41404751404861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13518409
222NC_002693CTTA31410591410691125 %50 %0 %25 %9 %13518409
223NC_002693GGAT31456611456721225 %25 %50 %0 %8 %13518409
224NC_002693TCG9146064146088250 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13518409
225NC_002693TCG9146169146193250 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13518409
226NC_002693CGT4146354146364110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %13518409
227NC_002693TCG5146493146506140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %13518409
228NC_002693A1314996714997913100 %0 %0 %0 %7 %13518409
229NC_002693GAA41499921500031266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13518409
230NC_002693GAAA31540841540951275 %0 %25 %0 %8 %164597847
231NC_002693CATAC31557071557201440 %20 %0 %40 %7 %Non-Coding
232NC_002693CTT4156133156145130 %66.67 %0 %33.33 %7 %164597848
233NC_002693AAG51562001562141566.67 %0 %33.33 %0 %6 %164597848
234NC_002693TCCTCT5156420156449300 %50 %0 %50 %3 %164597848
235NC_002693TCCTCT9156453156506540 %50 %0 %50 %7 %164597848
236NC_002693CTCTTC3156533156550180 %50 %0 %50 %5 %164597848
237NC_002693TCG7156804156824210 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %164597848
238NC_002693TGT4157962157973120 %66.67 %33.33 %0 %0 %164597848
239NC_002693CGAT31591751591871325 %25 %25 %25 %7 %164597848
240NC_002693CCA41592431592531133.33 %0 %0 %66.67 %9 %164597848
241NC_002693AAAG31609431609531175 %0 %25 %0 %9 %164597848
242NC_002693AACG31609911610021250 %0 %25 %25 %8 %164597848
243NC_002693CGAT31614631614751325 %25 %25 %25 %7 %164597848
244NC_002693AATGA31633651633791560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
245NC_002693ATC41636271636371133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
246NC_002693AT61636771636871150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
247NC_002693GAA51654881655021566.67 %0 %33.33 %0 %6 %164597849