ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Naegleria gruberi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002573	TTA	4	30	41	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_002573	A	12	123	134	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_002573	TA	6	666	677	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_002573	AAGT	3	2677	2687	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_002573	T	12	2933	2944	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11466175
6	NC_002573	TTTA	3	3151	3162	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466175
7	NC_002573	TTTA	3	3926	3937	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466176
8	NC_002573	A	13	3949	3961	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466176
9	NC_002573	ATT	4	4065	4076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466176
10	NC_002573	AATT	3	4110	4121	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466176
11	NC_002573	AAAC	3	4277	4287	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11466176
12	NC_002573	TAAA	3	4368	4378	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466176
13	NC_002573	A	13	4442	4454	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466176
14	NC_002573	TTTTA	3	4609	4623	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466176
15	NC_002573	T	16	4810	4825	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	11466176
16	NC_002573	AAATAA	3	5133	5151	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	11466176
17	NC_002573	AAAAG	3	5170	5183	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_002573	TTTA	3	6816	6826	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466177
19	NC_002573	AATATA	3	7055	7073	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
20	NC_002573	T	14	7595	7608	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466178
21	NC_002573	ATTT	3	7897	7907	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466178
22	NC_002573	TTTTA	3	7938	7951	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466178
23	NC_002573	ATT	4	8266	8277	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466179
24	NC_002573	TAT	4	8392	8402	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466179
25	NC_002573	AAATT	3	9175	9189	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	11466180
26	NC_002573	TTAC	3	9242	9252	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11466180
27	NC_002573	ATAA	3	9305	9316	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466181
28	NC_002573	TATT	4	9842	9858	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_002573	TAT	4	10700	10710	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466182
30	NC_002573	AGG	4	10746	10756	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	11466182
31	NC_002573	T	12	11473	11484	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11466182
32	NC_002573	AT	6	12086	12096	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466183
33	NC_002573	T	12	12112	12123	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11466183
34	NC_002573	T	12	12298	12309	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466183
35	NC_002573	TTATA	3	12346	12359	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11466183
36	NC_002573	T	13	12364	12376	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466183
37	NC_002573	TTTTA	3	12591	12605	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466183
38	NC_002573	AATC	3	13178	13189	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11466184
39	NC_002573	ATA	12	13662	13698	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_002573	AATT	3	15130	15140	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466185
41	NC_002573	TAT	4	15497	15507	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466185
42	NC_002573	TATTTT	3	15987	16004	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	0 %	11466186
43	NC_002573	TTA	4	16172	16183	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466186
44	NC_002573	TAG	4	16498	16508	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466186
45	NC_002573	TTCCT	3	16831	16844	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
46	NC_002573	TATGA	3	17263	17278	16	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	11466187
47	NC_002573	TTG	4	17734	17745	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466188
48	NC_002573	GTTTTT	3	18120	18138	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	11466188
49	NC_002573	TTTA	3	18290	18302	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466188
50	NC_002573	ATTT	4	18312	18327	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466188
51	NC_002573	ATT	4	18506	18517	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466188
52	NC_002573	TTTTA	3	18692	18706	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466188
53	NC_002573	T	18	18744	18761	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	11466188
54	NC_002573	TTTTA	3	18901	18915	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466188
55	NC_002573	TTAA	3	19246	19257	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466188
56	NC_002573	ATTT	3	19276	19286	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466188
57	NC_002573	ATA	4	19531	19542	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_002573	T	15	19831	19845	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466189
59	NC_002573	AT	6	20049	20059	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466189
60	NC_002573	ATTT	3	20568	20578	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466189
61	NC_002573	ATTT	3	20649	20661	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466189
62	NC_002573	TA	6	20862	20872	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466189
63	NC_002573	TTA	5	21030	21044	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466189
64	NC_002573	TAAT	3	21945	21956	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466190
65	NC_002573	TTTA	3	22044	22054	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466191
66	NC_002573	TTTA	3	22113	22123	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466191
67	NC_002573	T	22	22125	22146	22	0 %	100 %	0 %	0 %	9 %	11466191
68	NC_002573	AGA	5	22185	22198	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11466191
69	NC_002573	TAT	4	22319	22330	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466191
70	NC_002573	TTTA	3	22565	22575	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466192
71	NC_002573	TTA	4	22981	22991	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466192
72	NC_002573	T	12	22998	23009	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466192
73	NC_002573	TAAA	3	23396	23407	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466193
74	NC_002573	ATTT	3	23419	23429	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466193
75	NC_002573	TTTA	3	23666	23676	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466193
76	NC_002573	TTTA	3	23714	23724	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466193
77	NC_002573	TTTTTA	3	23854	23872	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	11466193
78	NC_002573	TTGT	3	23962	23973	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_002573	ATA	5	23986	23999	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_002573	TA	7	24002	24015	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466194
81	NC_002573	TTATT	3	24063	24077	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466194
82	NC_002573	T	13	24083	24095	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466194
83	NC_002573	ATTT	3	24208	24218	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466194
84	NC_002573	TTTTA	3	24275	24288	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466194
85	NC_002573	A	15	24333	24347	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	11466194
86	NC_002573	TTTTA	3	24400	24414	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466195
87	NC_002573	A	12	24420	24431	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466195
88	NC_002573	TTTA	3	24499	24509	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466195
89	NC_002573	ATTTT	3	24533	24546	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466195
90	NC_002573	ATT	4	24633	24645	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466195
91	NC_002573	AAT	4	24699	24710	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466195
92	NC_002573	ATTTTA	3	24709	24726	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466195
93	NC_002573	ATT	4	25223	25233	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466196
94	NC_002573	TA	6	25345	25355	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466196
95	NC_002573	TTTA	3	25453	25465	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466196
96	NC_002573	TTTA	3	25755	25766	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466197
97	NC_002573	GGA	4	26205	26216	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	11466197
98	NC_002573	AAAT	3	26805	26816	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466199
99	NC_002573	ATTT	3	26930	26940	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466199
100	NC_002573	TTTTA	3	27187	27202	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466199
101	NC_002573	TTAT	3	27214	27224	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466199
102	NC_002573	T	23	27421	27443	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11466199
103	NC_002573	TATT	4	27472	27487	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466199
104	NC_002573	TAT	5	27513	27526	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466199
105	NC_002573	TAAA	3	27553	27564	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466199
106	NC_002573	ATT	4	27691	27701	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466199
107	NC_002573	A	12	27760	27771	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466199
108	NC_002573	AAAT	3	27834	27845	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466199
109	NC_002573	TAAA	3	28560	28570	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466200
110	NC_002573	A	12	28646	28657	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466201
111	NC_002573	AATT	3	29008	29018	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466202
112	NC_002573	TATT	3	29055	29065	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466202
113	NC_002573	A	14	29168	29181	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466202
114	NC_002573	TTA	4	29246	29258	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466202
115	NC_002573	AAAT	3	29688	29698	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466203
116	NC_002573	ATTT	3	29731	29742	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466203
117	NC_002573	AGA	4	30058	30069	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466204
118	NC_002573	TAT	4	30232	30242	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466204
119	NC_002573	T	14	30372	30385	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466205
120	NC_002573	TTTTA	4	30399	30417	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	11466205
121	NC_002573	A	13	30635	30647	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466205
122	NC_002573	ATT	4	30839	30849	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466206
123	NC_002573	A	13	30990	31002	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466206
124	NC_002573	A	12	31149	31160	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466206
125	NC_002573	A	14	31275	31288	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466206
126	NC_002573	ATA	4	31397	31407	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466206
127	NC_002573	TTA	4	31600	31611	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466206
128	NC_002573	A	15	31786	31800	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466206
129	NC_002573	TA	6	32031	32041	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466206
130	NC_002573	A	14	32127	32140	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466206
131	NC_002573	TTTA	3	32315	32325	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466206
132	NC_002573	A	17	32518	32534	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466206
133	NC_002573	TATT	3	32680	32691	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466207
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164	NC_002573	TGTA	3	37434	37444	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11466211
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168	NC_002573	TTATT	4	37864	37883	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	11466212
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190	NC_002573	AT	6	43721	43731	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
191	NC_002573	ATA	4	43758	43769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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198	NC_002573	AGAC	3	45057	45069	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
199	NC_002573	TAT	4	45123	45133	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
200	NC_002573	TAAAA	3	45192	45206	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11466218
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211	NC_002573	TATT	3	47864	47874	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466220
212	NC_002573	TA	6	48114	48124	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
213	NC_002573	AT	6	48396	48406	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
214	NC_002573	GATATA	3	49224	49242	19	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Naegleria gruberi mitochondrion