ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bombyx mori mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002355	AT	7	247	259	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_002355	T	18	334	351	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	8572563
3	NC_002355	TAA	4	358	372	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	8572563
4	NC_002355	TAT	4	596	607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8572563
5	NC_002355	TA	14	668	694	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_002355	AT	13	770	794	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_002355	A	15	1153	1167	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	8572564
8	NC_002355	TAAA	3	1194	1205	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	8572564
9	NC_002355	AAATA	3	1724	1738	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	8572564
10	NC_002355	TTA	4	2019	2030	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8572564
11	NC_002355	AAT	4	2308	2319	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8572564
12	NC_002355	TAA	4	2562	2574	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	8572564
13	NC_002355	A	13	2806	2818	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	8572564
14	NC_002355	A	15	2840	2854	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	8572564
15	NC_002355	ATT	4	2869	2880	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_002355	ATT	4	2929	2939	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_002355	AT	12	2950	2974	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_002355	GTT	7	2983	3002	20	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	10 %	8572565
19	NC_002355	ATTT	3	3003	3013	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	8572565
20	NC_002355	ATA	4	3077	3089	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	8572565
21	NC_002355	ATT	4	3194	3205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8572565
22	NC_002355	ATA	4	3300	3311	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8572565
23	NC_002355	ATC	4	3312	3323	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	8572565
24	NC_002355	AAAT	3	3919	3929	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	8572565
25	NC_002355	CAAT	3	3969	3979	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	8572565
26	NC_002355	A	15	4006	4020	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	8572565
27	NC_002355	TAA	5	4016	4029	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	8572565
28	NC_002355	AAAAAT	3	4089	4106	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	8572565
29	NC_002355	AT	7	4466	4480	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	8572566
30	NC_002355	A	16	4504	4519	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	8572566
31	NC_002355	ATAA	4	4604	4619	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	8572566
32	NC_002355	ATT	4	4751	4762	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_002355	TAA	4	4806	4817	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8572567
34	NC_002355	ATT	5	4960	4974	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	8572567
35	NC_002355	ATT	4	5005	5016	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8572567
36	NC_002355	TAT	5	5041	5055	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	8572567
37	NC_002355	ATT	5	5057	5071	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	8572567
38	NC_002355	ATA	4	5069	5079	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	8572567
39	NC_002355	TTA	4	5082	5093	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	8572567
40	NC_002355	AAT	4	5094	5104	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	8572567
41	NC_002355	AAAT	3	5124	5135	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	8572567
42	NC_002355	ATTT	4	5227	5242	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	8572567
43	NC_002355	GTA	4	5252	5263	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	8572567
44	NC_002355	ATA	8	5304	5327	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	8572567
45	NC_002355	ATCT	3	5810	5820	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	8572568
46	NC_002355	ATTT	3	5954	5964	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	8572568
47	NC_002355	AAAT	3	6508	6519	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	8572568
48	NC_002355	TAAAA	3	6609	6622	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	8572569
49	NC_002355	ATA	4	6637	6649	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	8572569
50	NC_002355	ATAAA	3	7207	7220	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	8572569
51	NC_002355	AAATT	4	7227	7246	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	8572569
52	NC_002355	ATAAAT	3	7528	7546	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	8572569
53	NC_002355	ATTAA	3	8341	8354	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_002355	AAAAT	3	8433	8447	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_002355	ATT	4	8568	8578	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_002355	TTTA	3	8590	8601	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_002355	TTA	4	8721	8733	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_002355	ATA	4	9004	9016	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_002355	TTAA	3	9167	9178	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_002355	TAT	5	9315	9329	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_002355	TTA	4	9473	9484	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_002355	ATTTTA	3	9587	9604	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_002355	AATTT	3	9638	9652	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002355	CTTA	3	9709	9720	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_002355	ATT	4	9751	9763	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_002355	TTTA	3	9838	9848	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_002355	T	23	9870	9892	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_002355	ATT	8	9902	9924	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_002355	AAAT	4	9954	9969	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_002355	ATTTAA	3	10005	10023	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_002355	TAAT	4	10028	10043	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_002355	AATT	3	10148	10160	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_002355	TA	12	10182	10203	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_002355	TA	6	10219	10229	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_002355	AT	12	10256	10278	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_002355	A	12	10329	10340	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002355	TTTAT	3	10466	10480	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_002355	TTA	4	11024	11034	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	8572570
79	NC_002355	TTTA	3	11407	11417	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	8572570
80	NC_002355	ATT	5	11445	11460	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	8572570
81	NC_002355	TAT	5	12399	12413	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	8572571
82	NC_002355	GGA	4	12491	12501	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	8572571
83	NC_002355	GAAA	3	12609	12620	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	8572571
84	NC_002355	TAA	5	13215	13229	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	8572571
85	NC_002355	ATT	4	14486	14498	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	8572574
86	NC_002355	TTTTA	3	14639	14652	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	8572574
87	NC_002355	TAATTT	3	15205	15222	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
88	NC_002355	T	14	15369	15382	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_002355	CTCA	3	15537	15547	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding

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