ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cafeteria roenbergensis mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_000946	T	14	2609	2622	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_000946	TATT	3	2712	2723	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_000946	ATTT	4	2966	2981	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466299
4	NC_000946	TTTATT	3	3029	3047	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	11466299
5	NC_000946	ATTT	3	3093	3103	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466299
6	NC_000946	ATTT	4	3127	3142	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466299
7	NC_000946	TTAA	3	6381	6393	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466301
8	NC_000946	TAA	4	6522	6534	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466301
9	NC_000946	TAT	4	7040	7051	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466302
10	NC_000946	GGA	4	7378	7388	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	11466302
11	NC_000946	ATT	4	8100	8111	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466302
12	NC_000946	CTT	4	8761	8772	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466303
13	NC_000946	T	13	9308	9320	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466303
14	NC_000946	TAT	4	9365	9377	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466304
15	NC_000946	TTTTA	3	9485	9499	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466304
16	NC_000946	TTCTTT	3	9548	9565	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	11466304
17	NC_000946	TTATT	3	9646	9660	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466304
18	NC_000946	TAT	4	10211	10221	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_000946	A	12	10856	10867	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466306
20	NC_000946	AAAATT	3	11284	11301	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466307
21	NC_000946	ATTT	3	11733	11744	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466308
22	NC_000946	ATTT	3	11862	11872	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466308
23	NC_000946	TAAT	3	12417	12427	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_000946	T	13	15767	15779	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_000946	A	14	16858	16871	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466313
26	NC_000946	A	13	17730	17742	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466315
27	NC_000946	ATT	4	17838	17849	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466315
28	NC_000946	A	19	18507	18525	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	11466315
29	NC_000946	AAAT	3	19772	19783	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466317
30	NC_000946	GAAA	3	20994	21005	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11466317
31	NC_000946	TAAA	3	22491	22501	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466317
32	NC_000946	AGC	4	23186	23196	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_000946	T	13	23406	23418	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466318
34	NC_000946	ATTTTT	3	24293	24310	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11466319
35	NC_000946	ATTTT	3	24375	24388	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466319
36	NC_000946	TGAA	3	24959	24969	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11466319
37	NC_000946	A	17	25429	25445	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	11466319
38	NC_000946	TTC	4	25493	25503	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11466319
39	NC_000946	TAT	4	25640	25651	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466319
40	NC_000946	ATTT	3	25850	25860	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466319
41	NC_000946	GAAA	3	27238	27249	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11466321
42	NC_000946	TAAAA	3	27561	27574	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11466322
43	NC_000946	A	12	28314	28325	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466323
44	NC_000946	ATTT	3	28403	28413	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466323
45	NC_000946	TTA	4	28648	28658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466323
46	NC_000946	AATT	3	29043	29053	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466324
47	NC_000946	AAAT	3	29462	29473	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466324
48	NC_000946	T	14	29662	29675	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	11466324
49	NC_000946	TTTA	3	30067	30078	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466324
50	NC_000946	ATTT	3	30450	30460	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466324
51	NC_000946	TTAA	3	30503	30514	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466324
52	NC_000946	GAA	4	31030	31041	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466324
53	NC_000946	GAA	5	31045	31058	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11466324
54	NC_000946	GAA	5	31183	31197	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	11466324
55	NC_000946	A	13	31293	31305	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466324
56	NC_000946	TCTAA	3	31447	31460	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	11466324
57	NC_000946	CAAAA	3	31973	31986	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	11466324
58	NC_000946	ATA	4	32069	32080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466324
59	NC_000946	TTC	4	32523	32534	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466324
60	NC_000946	A	18	32545	32562	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	11466324
61	NC_000946	AGA	4	33603	33613	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_000946	TAT	5	34303	34318	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_000946	T	12	35141	35152	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	11466327
64	NC_000946	TAAA	3	35375	35385	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466327
65	NC_000946	TGGT	3	35686	35696	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	11466328
66	NC_000946	ATT	4	35905	35915	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466328
67	NC_000946	TTTA	3	37550	37561	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466329
68	NC_000946	ATTA	3	38329	38341	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466329
69	NC_000946	GGTT	3	38721	38731	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_000946	ATTTTT	3	40168	40184	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_000946	CAAAA	3	40299	40312	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	11466330
72	NC_000946	ATA	4	41595	41606	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466331
73	NC_000946	TTTA	3	41860	41871	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466331

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cafeteria roenbergensis mitochondrion